Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7F1R2

Protein Details
Accession A7F1R2    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-75QIETRAREKEQHNQRQRRRKSNKKVQVKIGHGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-66RQRRRKSNKK
Subcellular Location(s) mito 12, cyto_mito 11.833, cyto 10.5, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG ssl:SS1G_11533  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MTKGKVMEGVFAINKPTGRSSAQIVRDLQTHFNPSELFAPWIQIETRAREKEQHNQRQRRRKSNKKVQVKIGHGGTLDPLATGVLIAGIGKGTKELGNFLLCTKTYETIVLFGAATDTYDKDGKLLKRAPYEHITREMVEQGLAKYRGKFMQLPPLFSALKMNGKPLYEYAREGKEIPKEIERRSVDVSELELLEFYEGDEHQWKAPTEEAGYAEVNVAAKLWKQEKAEPATNGKGVENERALEDFESRKRKMGDDQDDLVVERPVKKTKEMVEEEKDDAMMSGGLSSDKTPMEDQPILSKEGVKKGPPAAKIRMTVSSGFYVRSLCHDLGADLGSAGLMCSLVRVRQGQFELGKNVLEYDELERGEGVWGPQVEKFLDEWNGETAVKTVPETATEPPVEETPKVEIEVKSEAVEDIKKEVEGREVTNEAEVKDETVETKEEKTGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.24
4 0.23
5 0.23
6 0.25
7 0.29
8 0.35
9 0.39
10 0.43
11 0.43
12 0.41
13 0.43
14 0.44
15 0.42
16 0.37
17 0.38
18 0.32
19 0.31
20 0.29
21 0.27
22 0.27
23 0.24
24 0.23
25 0.17
26 0.2
27 0.18
28 0.2
29 0.18
30 0.21
31 0.23
32 0.27
33 0.35
34 0.37
35 0.39
36 0.45
37 0.49
38 0.53
39 0.6
40 0.65
41 0.67
42 0.74
43 0.82
44 0.85
45 0.91
46 0.92
47 0.92
48 0.93
49 0.93
50 0.94
51 0.94
52 0.94
53 0.92
54 0.91
55 0.9
56 0.84
57 0.8
58 0.71
59 0.62
60 0.51
61 0.43
62 0.33
63 0.25
64 0.19
65 0.12
66 0.09
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.04
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.06
80 0.07
81 0.08
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.17
88 0.16
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.18
94 0.17
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.1
108 0.11
109 0.17
110 0.19
111 0.26
112 0.31
113 0.34
114 0.41
115 0.43
116 0.47
117 0.47
118 0.5
119 0.45
120 0.45
121 0.41
122 0.35
123 0.34
124 0.3
125 0.24
126 0.2
127 0.17
128 0.13
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.21
134 0.22
135 0.23
136 0.27
137 0.24
138 0.33
139 0.33
140 0.35
141 0.33
142 0.36
143 0.33
144 0.28
145 0.28
146 0.2
147 0.25
148 0.22
149 0.24
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.22
154 0.25
155 0.2
156 0.22
157 0.23
158 0.23
159 0.24
160 0.24
161 0.26
162 0.25
163 0.27
164 0.26
165 0.3
166 0.32
167 0.32
168 0.4
169 0.37
170 0.36
171 0.35
172 0.34
173 0.27
174 0.23
175 0.23
176 0.15
177 0.14
178 0.1
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.04
207 0.05
208 0.08
209 0.1
210 0.13
211 0.15
212 0.19
213 0.24
214 0.3
215 0.33
216 0.32
217 0.34
218 0.32
219 0.32
220 0.29
221 0.23
222 0.21
223 0.18
224 0.19
225 0.15
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.17
234 0.24
235 0.24
236 0.27
237 0.28
238 0.29
239 0.34
240 0.41
241 0.42
242 0.41
243 0.42
244 0.39
245 0.38
246 0.37
247 0.3
248 0.21
249 0.15
250 0.13
251 0.14
252 0.19
253 0.2
254 0.21
255 0.25
256 0.29
257 0.37
258 0.4
259 0.43
260 0.43
261 0.45
262 0.44
263 0.4
264 0.35
265 0.25
266 0.2
267 0.14
268 0.09
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.16
281 0.17
282 0.17
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.23
287 0.26
288 0.23
289 0.29
290 0.31
291 0.26
292 0.28
293 0.33
294 0.38
295 0.4
296 0.42
297 0.41
298 0.43
299 0.45
300 0.44
301 0.4
302 0.37
303 0.33
304 0.3
305 0.27
306 0.23
307 0.21
308 0.19
309 0.17
310 0.15
311 0.17
312 0.2
313 0.16
314 0.17
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.12
320 0.07
321 0.07
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.05
330 0.06
331 0.09
332 0.13
333 0.14
334 0.19
335 0.21
336 0.25
337 0.28
338 0.31
339 0.31
340 0.29
341 0.28
342 0.23
343 0.22
344 0.17
345 0.14
346 0.12
347 0.12
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.14
360 0.16
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.16
365 0.19
366 0.18
367 0.18
368 0.18
369 0.2
370 0.19
371 0.18
372 0.16
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.14
379 0.17
380 0.18
381 0.22
382 0.21
383 0.22
384 0.22
385 0.25
386 0.25
387 0.23
388 0.22
389 0.21
390 0.22
391 0.23
392 0.25
393 0.23
394 0.24
395 0.27
396 0.26
397 0.23
398 0.22
399 0.2
400 0.19
401 0.21
402 0.18
403 0.17
404 0.17
405 0.17
406 0.18
407 0.19
408 0.23
409 0.24
410 0.25
411 0.27
412 0.28
413 0.27
414 0.31
415 0.31
416 0.24
417 0.24
418 0.22
419 0.18
420 0.18
421 0.18
422 0.15
423 0.16
424 0.19
425 0.18
426 0.2