Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EJY5

Protein Details
Accession A7EJY5    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-52MSSFFTVPNAQKKRKRNDAPEIPKKRLAAPSRTPAKQSKPAKRPQRDESISGHydrophilic
185-217QDLPRDQYPQKKGKKKSKKPPPPPKKKPTLVASBasic
356-375RGGGSEKKSRHKNNPNDLRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-44KKRKRNDAPEIPKKRLAAPSRTPAKQSKPAKRP
195-212KKGKKKSKKPPPPPKKKP
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031428  C:box C/D RNP complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ssl:SS1G_05631  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSSFFTVPNAQKKRKRNDAPEIPKKRLAAPSRTPAKQSKPAKRPQRDESISGSDSESEGGQLDDNVAESSSEDDLARDGEEETAAERRLRLAERYLQNIREEVADDGVGFDAEDIDRDLIAERLEEDVAESKGKIYKTLADELEFGEASSCHFKKDSHSFTGVATCVPHVYTVTKDMWLVKWRIQDLPRDQYPQKKGKKKSKKPPPPPKKKPTLVASVRGDQRKSKVTSYMGHTDAIISVAASQDGKFVVTGGVDRKIIVWNAETLRPIRVFSQHRDAVTGLAFRRGTNQLYSSSRDRTIKIWSLDEGAYVETLFGHQDEVVDIASLAQERCISVGARDRTARLWKVVEETQLVFRGGGSEKKSRHKNNPNDLRTLEGSIDRIAMVDEDMFITGGDNGSLSLWTIHKKKPIYTLTLAHGADEPIKPEEASAETDLAKRVVPRPSPRWITALTTIPYSDVVLSGSWDGVVRAWRVSHDRKSLEPIGPVGRISDATMEGTDAGVHESQAPARGIINDLSVFERGDRGKDGVCIVAAVGKAHRLGNWQKTPAGRNGAVVFEVSRKQITNNVNGHADEDTGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.87
3 0.86
4 0.88
5 0.89
6 0.92
7 0.93
8 0.91
9 0.86
10 0.81
11 0.73
12 0.68
13 0.67
14 0.63
15 0.62
16 0.62
17 0.66
18 0.7
19 0.7
20 0.7
21 0.68
22 0.69
23 0.69
24 0.71
25 0.72
26 0.72
27 0.8
28 0.85
29 0.87
30 0.87
31 0.86
32 0.86
33 0.81
34 0.75
35 0.71
36 0.68
37 0.58
38 0.51
39 0.43
40 0.33
41 0.28
42 0.24
43 0.17
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.08
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.12
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.19
76 0.21
77 0.23
78 0.25
79 0.33
80 0.37
81 0.44
82 0.47
83 0.46
84 0.45
85 0.42
86 0.37
87 0.29
88 0.26
89 0.19
90 0.15
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.08
96 0.07
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.12
119 0.16
120 0.16
121 0.17
122 0.15
123 0.2
124 0.24
125 0.3
126 0.29
127 0.27
128 0.27
129 0.26
130 0.26
131 0.2
132 0.16
133 0.11
134 0.09
135 0.1
136 0.17
137 0.17
138 0.16
139 0.17
140 0.18
141 0.25
142 0.35
143 0.39
144 0.36
145 0.39
146 0.38
147 0.38
148 0.41
149 0.34
150 0.24
151 0.19
152 0.14
153 0.12
154 0.11
155 0.1
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.13
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.16
164 0.19
165 0.23
166 0.24
167 0.24
168 0.28
169 0.29
170 0.34
171 0.35
172 0.39
173 0.4
174 0.46
175 0.45
176 0.46
177 0.47
178 0.5
179 0.56
180 0.57
181 0.6
182 0.62
183 0.68
184 0.74
185 0.83
186 0.85
187 0.88
188 0.9
189 0.91
190 0.93
191 0.95
192 0.95
193 0.95
194 0.95
195 0.94
196 0.93
197 0.88
198 0.84
199 0.78
200 0.77
201 0.7
202 0.67
203 0.61
204 0.57
205 0.57
206 0.52
207 0.48
208 0.41
209 0.4
210 0.39
211 0.38
212 0.34
213 0.33
214 0.33
215 0.36
216 0.38
217 0.4
218 0.33
219 0.31
220 0.28
221 0.24
222 0.2
223 0.17
224 0.11
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.13
257 0.19
258 0.21
259 0.24
260 0.32
261 0.31
262 0.31
263 0.32
264 0.31
265 0.24
266 0.22
267 0.21
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.13
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.16
276 0.18
277 0.17
278 0.19
279 0.23
280 0.23
281 0.23
282 0.25
283 0.26
284 0.26
285 0.23
286 0.27
287 0.29
288 0.27
289 0.26
290 0.23
291 0.23
292 0.22
293 0.2
294 0.15
295 0.1
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.15
323 0.16
324 0.19
325 0.2
326 0.21
327 0.23
328 0.29
329 0.28
330 0.23
331 0.23
332 0.21
333 0.25
334 0.26
335 0.24
336 0.2
337 0.2
338 0.19
339 0.19
340 0.19
341 0.14
342 0.12
343 0.13
344 0.12
345 0.15
346 0.17
347 0.22
348 0.26
349 0.35
350 0.44
351 0.49
352 0.59
353 0.66
354 0.72
355 0.77
356 0.83
357 0.78
358 0.73
359 0.66
360 0.59
361 0.5
362 0.41
363 0.31
364 0.21
365 0.19
366 0.14
367 0.14
368 0.1
369 0.09
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.07
390 0.12
391 0.17
392 0.2
393 0.27
394 0.29
395 0.32
396 0.4
397 0.43
398 0.45
399 0.45
400 0.45
401 0.42
402 0.46
403 0.43
404 0.34
405 0.31
406 0.25
407 0.23
408 0.2
409 0.18
410 0.13
411 0.13
412 0.13
413 0.12
414 0.13
415 0.12
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.16
421 0.17
422 0.16
423 0.15
424 0.14
425 0.18
426 0.24
427 0.3
428 0.37
429 0.41
430 0.5
431 0.55
432 0.54
433 0.53
434 0.48
435 0.45
436 0.42
437 0.42
438 0.34
439 0.29
440 0.27
441 0.24
442 0.23
443 0.18
444 0.14
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.11
456 0.11
457 0.12
458 0.12
459 0.16
460 0.23
461 0.31
462 0.37
463 0.42
464 0.44
465 0.45
466 0.52
467 0.55
468 0.5
469 0.44
470 0.4
471 0.36
472 0.34
473 0.31
474 0.25
475 0.2
476 0.17
477 0.16
478 0.14
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.07
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.1
493 0.15
494 0.15
495 0.13
496 0.15
497 0.15
498 0.16
499 0.16
500 0.18
501 0.14
502 0.15
503 0.16
504 0.15
505 0.15
506 0.13
507 0.18
508 0.16
509 0.19
510 0.2
511 0.21
512 0.21
513 0.23
514 0.24
515 0.2
516 0.19
517 0.16
518 0.13
519 0.14
520 0.13
521 0.12
522 0.12
523 0.13
524 0.15
525 0.15
526 0.16
527 0.21
528 0.29
529 0.38
530 0.45
531 0.46
532 0.49
533 0.54
534 0.58
535 0.57
536 0.57
537 0.48
538 0.44
539 0.43
540 0.4
541 0.35
542 0.31
543 0.25
544 0.21
545 0.22
546 0.2
547 0.21
548 0.2
549 0.21
550 0.29
551 0.33
552 0.39
553 0.41
554 0.43
555 0.44
556 0.43
557 0.43
558 0.36
559 0.31