Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EH04

Protein Details
Accession A7EH04    Localization Confidence Low Confidence Score 5.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-30LDQWVQPKSKRQKDQALSLLSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 5.5, cyto_nucl 4.5, pero 3, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040662  Tfb2_C  
IPR004598  TFIIH_p52/Tfb2  
Gene Ontology GO:0000112  C:nucleotide-excision repair factor 3 complex  
GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG ssl:SS1G_04596  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03849  Tfb2  
PF18307  Tfb2_C  
Amino Acid Sequences MPKPLPLTALDQWVQPKSKRQKDQALSLLSRLHIVDITALSREDPQTVALTKSFGTSLRLALTGGGNHQSFGVPSSDHIAPHVDIDFLDVHARMQWEGILHYMVNNVAAGSGQEGSGPAGSVKKLLDAGKLVTRGRSVGITQAGFSFLLQEANAQVWTLLLLWIENAESMGMDSVDVLSFLFMLGSLELGRAYSTTTLTDAQHNMLGNLIDFGLIYLPPSAPTQFFPTRLATTLTSDASALRTVSAGFDAASKSAANQKGFIIIETNYRLYAYTNSPLQIAVLSLFTKLNTRYPNMVSGRVSRDSIRTAISHGITSDQIITYLSTHAHPQLVKASTAAHGGPVLPPTVVDQIRLWQLENERMKAVPGFLFKEFDGQKEYEGCAKYAEEVGVLVWKNDAKRMFFVTRVEQLRDYIKARKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.39
3 0.47
4 0.51
5 0.6
6 0.67
7 0.71
8 0.76
9 0.78
10 0.84
11 0.82
12 0.79
13 0.71
14 0.64
15 0.58
16 0.47
17 0.42
18 0.32
19 0.24
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.13
25 0.12
26 0.13
27 0.12
28 0.15
29 0.16
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.17
34 0.18
35 0.2
36 0.17
37 0.18
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.14
42 0.16
43 0.15
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.16
49 0.17
50 0.14
51 0.15
52 0.18
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.15
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.09
61 0.09
62 0.14
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.12
71 0.1
72 0.13
73 0.12
74 0.1
75 0.11
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.15
115 0.17
116 0.19
117 0.23
118 0.22
119 0.2
120 0.2
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.13
125 0.14
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.15
131 0.13
132 0.13
133 0.1
134 0.07
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.02
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.15
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.21
215 0.21
216 0.22
217 0.23
218 0.17
219 0.18
220 0.18
221 0.16
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.1
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.13
242 0.17
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.21
247 0.21
248 0.2
249 0.16
250 0.12
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.15
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.15
266 0.12
267 0.1
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.11
275 0.12
276 0.17
277 0.19
278 0.21
279 0.24
280 0.26
281 0.33
282 0.33
283 0.35
284 0.32
285 0.34
286 0.36
287 0.34
288 0.34
289 0.28
290 0.28
291 0.27
292 0.26
293 0.23
294 0.19
295 0.19
296 0.22
297 0.21
298 0.19
299 0.16
300 0.17
301 0.15
302 0.15
303 0.14
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.11
313 0.13
314 0.16
315 0.15
316 0.16
317 0.22
318 0.23
319 0.22
320 0.21
321 0.21
322 0.18
323 0.2
324 0.18
325 0.12
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.11
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.2
339 0.25
340 0.26
341 0.24
342 0.21
343 0.25
344 0.32
345 0.36
346 0.35
347 0.31
348 0.31
349 0.31
350 0.28
351 0.27
352 0.22
353 0.22
354 0.23
355 0.23
356 0.25
357 0.24
358 0.31
359 0.29
360 0.27
361 0.28
362 0.25
363 0.26
364 0.27
365 0.28
366 0.27
367 0.28
368 0.26
369 0.23
370 0.23
371 0.22
372 0.22
373 0.2
374 0.13
375 0.12
376 0.12
377 0.16
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.16
382 0.17
383 0.23
384 0.27
385 0.25
386 0.28
387 0.35
388 0.37
389 0.38
390 0.42
391 0.42
392 0.47
393 0.48
394 0.49
395 0.43
396 0.42
397 0.43
398 0.44
399 0.42
400 0.41