Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EDC3

Protein Details
Accession A7EDC3    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-225LGRAKERSKPDKSEKSRKHRHHHRSRYIKDEEDBasic
239-267HDRERDRDRESRKRYPEDNRDRRSRREWSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-220AKALGRAKERSKPDKSEKSRKHRHHHRSRYI
229-269SHRSRHRSHGHDRERDRDRESRKRYPEDNRDRRSRREWSPR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ssl:SS1G_03313  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MNSIRQIQELNRRELENGVPPSASWHTDYRDTAYIYIGGLPFELSEGDVLTIFSQYGEPTYINLVRDKETGKSKGFAFLKYEDQRSTDLAVDNLGGAVIAGRTLKVDHTRYKRKEGEEDTGMDLNGGLDDEGDERRKRRRTSAESEGSEDEEEQRPMLKEERELALLIRDHDEDDPMKAFLIEEKKEEVAKALGRAKERSKPDKSEKSRKHRHHHRSRYIKDEEDLDGSHRSRHRSHGHDRERDRDRESRKRYPEDNRDRRSRREWSPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.4
4 0.37
5 0.32
6 0.28
7 0.26
8 0.31
9 0.31
10 0.28
11 0.23
12 0.23
13 0.26
14 0.31
15 0.33
16 0.32
17 0.34
18 0.33
19 0.3
20 0.28
21 0.24
22 0.19
23 0.2
24 0.16
25 0.11
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.13
48 0.15
49 0.16
50 0.19
51 0.19
52 0.2
53 0.23
54 0.23
55 0.24
56 0.29
57 0.32
58 0.31
59 0.32
60 0.31
61 0.37
62 0.37
63 0.34
64 0.31
65 0.29
66 0.36
67 0.37
68 0.39
69 0.31
70 0.32
71 0.31
72 0.28
73 0.28
74 0.21
75 0.17
76 0.14
77 0.14
78 0.12
79 0.1
80 0.09
81 0.06
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.02
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.04
91 0.07
92 0.12
93 0.16
94 0.24
95 0.33
96 0.43
97 0.47
98 0.55
99 0.59
100 0.57
101 0.61
102 0.57
103 0.54
104 0.46
105 0.44
106 0.38
107 0.33
108 0.3
109 0.21
110 0.16
111 0.1
112 0.08
113 0.06
114 0.03
115 0.02
116 0.03
117 0.04
118 0.05
119 0.08
120 0.1
121 0.12
122 0.2
123 0.27
124 0.29
125 0.36
126 0.45
127 0.5
128 0.56
129 0.64
130 0.64
131 0.59
132 0.6
133 0.52
134 0.43
135 0.35
136 0.27
137 0.2
138 0.14
139 0.13
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.12
144 0.16
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.18
149 0.17
150 0.17
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.14
160 0.11
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.17
169 0.16
170 0.17
171 0.19
172 0.2
173 0.21
174 0.21
175 0.18
176 0.15
177 0.16
178 0.2
179 0.23
180 0.25
181 0.28
182 0.33
183 0.35
184 0.4
185 0.47
186 0.5
187 0.52
188 0.57
189 0.65
190 0.71
191 0.76
192 0.8
193 0.82
194 0.84
195 0.88
196 0.89
197 0.9
198 0.9
199 0.92
200 0.92
201 0.93
202 0.93
203 0.94
204 0.9
205 0.88
206 0.83
207 0.75
208 0.65
209 0.57
210 0.48
211 0.4
212 0.34
213 0.28
214 0.27
215 0.24
216 0.28
217 0.28
218 0.31
219 0.31
220 0.39
221 0.46
222 0.49
223 0.59
224 0.64
225 0.71
226 0.76
227 0.79
228 0.79
229 0.79
230 0.75
231 0.7
232 0.68
233 0.68
234 0.69
235 0.72
236 0.73
237 0.74
238 0.78
239 0.8
240 0.83
241 0.84
242 0.85
243 0.87
244 0.86
245 0.87
246 0.85
247 0.85
248 0.82
249 0.8