FuNGI

A7F1V6

Protein Details

Accession

A7F1V6

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
128-150	STGRARFKPKNIRRDQADRERLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-24	ERGATSRGRPRGRGRGRGR
122-146	MRARGESTGRARFKPKNIRRDQADR
156-157	RK
164-182	AEKEARRFQRGRGHTGRGR
405-412	KKRLKKEL
419-427	KVLRPSRKK

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	ssl:SS1G_11577 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAERGATSRGRPRGRGRGRGRGVAIDAIETPELRAVPEESSQSSQSLAPIAPVAPMAPMTQSTGTITPKVEPSDDAFDPNTSLATIPAETPAQDPANTPAGLPSRAGSATIRGRGGATMRARGESTGRARFKPKNIRRDQADRERLEQEERDRKAANQAQAEKEARRFQRGRGHTGRGRGDAMGQNRGAGRGAPMSSATGIFSVAPAAMDRKGGMDGFAIGSTRGGGGGGGGGGFGGGGGGGGGGGGGGGGGGSGSGNGGVNVLSAENSSTFDPEYPDEGDGQVKKVNIEMISLVEDDDDDMVGSGRGGKGGYKSRSLAPIRIKREEHKERSNMMVSDPDLAEAAKKQADEAEDDKSGEDIEMTMDRATTAEEPRAKDEPGLESPTMSKFPEFKAPSSPEEKKRLKKELESPQQSKVLRPSRKKDKVPVIQTEEDKFEYERYLEDVDILAEELRLLRGNVDESPKDKGKGKAVDVDGDVGMGGEQEQDESQPEANHADGRIYLFQFPPVLPRLFNPQVENSEDVVVTQSSEQIDLTDDKDKGIKKESEEVIIKTEPNVAQENEALVSEQGYIGKLVVRKSGKVELDWGGTSMAVGRGVPAAFLSQIVLAEDPKGEAPEGVATGLGKVMGKFIVTPDWEKIF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.73
3	0.75
4	0.77
5	0.79
6	0.78
7	0.8
8	0.8
9	0.8
10	0.73
11	0.66
12	0.59
13	0.52
14	0.43
15	0.34
16	0.28
17	0.23
18	0.21
19	0.17
20	0.15
21	0.13
22	0.13
23	0.12
24	0.13
25	0.12
26	0.14
27	0.17
28	0.19
29	0.21
30	0.24
31	0.25
32	0.23
33	0.23
34	0.22
35	0.2
36	0.19
37	0.16
38	0.13
39	0.13
40	0.13
41	0.12
42	0.11
43	0.1
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.09
49	0.12
50	0.12
51	0.13
52	0.15
53	0.18
54	0.2
55	0.22
56	0.22
57	0.21
58	0.24
59	0.26
60	0.24
61	0.22
62	0.25
63	0.29
64	0.28
65	0.28
66	0.26
67	0.24
68	0.24
69	0.22
70	0.18
71	0.12
72	0.11
73	0.09
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.11
78	0.11
79	0.12
80	0.12
81	0.16
82	0.16
83	0.16
84	0.17
85	0.19
86	0.23
87	0.22
88	0.21
89	0.22
90	0.23
91	0.24
92	0.23
93	0.19
94	0.17
95	0.17
96	0.19
97	0.14
98	0.18
99	0.23
100	0.26
101	0.26
102	0.23
103	0.24
104	0.24
105	0.25
106	0.25
107	0.23
108	0.25
109	0.26
110	0.27
111	0.27
112	0.27
113	0.27
114	0.27
115	0.31
116	0.35
117	0.37
118	0.39
119	0.46
120	0.52
121	0.59
122	0.63
123	0.65
124	0.67
125	0.72
126	0.77
127	0.78
128	0.81
129	0.8
130	0.8
131	0.8
132	0.72
133	0.68
134	0.63
135	0.57
136	0.51
137	0.46
138	0.44
139	0.44
140	0.43
141	0.43
142	0.41
143	0.4
144	0.46
145	0.47
146	0.44
147	0.42
148	0.45
149	0.44
150	0.5
151	0.52
152	0.44
153	0.43
154	0.46
155	0.4
156	0.45
157	0.43
158	0.43
159	0.51
160	0.53
161	0.57
162	0.56
163	0.62
164	0.56
165	0.62
166	0.59
167	0.52
168	0.48
169	0.39
170	0.36
171	0.33
172	0.32
173	0.29
174	0.25
175	0.24
176	0.23
177	0.23
178	0.19
179	0.14
180	0.13
181	0.11
182	0.12
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.05
214	0.04
215	0.04
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.02
222	0.02
223	0.02
224	0.02
225	0.02
226	0.02
227	0.01
228	0.01
229	0.01
230	0.01
231	0.01
232	0.01
233	0.01
234	0.01
235	0.01
236	0.01
237	0.01
238	0.01
239	0.01
240	0.01
241	0.01
242	0.01
243	0.01
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.04
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.07
262	0.07
263	0.08
264	0.09
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.11
270	0.14
271	0.12
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.12
277	0.13
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.05
300	0.09
301	0.16
302	0.18
303	0.2
304	0.21
305	0.22
306	0.3
307	0.3
308	0.32
309	0.35
310	0.41
311	0.43
312	0.47
313	0.48
314	0.45
315	0.54
316	0.58
317	0.56
318	0.55
319	0.54
320	0.51
321	0.53
322	0.51
323	0.41
324	0.32
325	0.27
326	0.2
327	0.18
328	0.16
329	0.12
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.07
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.09
340	0.12
341	0.13
342	0.15
343	0.14
344	0.15
345	0.15
346	0.13
347	0.12
348	0.09
349	0.07
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.13
362	0.16
363	0.17
364	0.21
365	0.23
366	0.22
367	0.21
368	0.21
369	0.21
370	0.2
371	0.23
372	0.19
373	0.18
374	0.19
375	0.2
376	0.2
377	0.16
378	0.14
379	0.12
380	0.14
381	0.23
382	0.24
383	0.23
384	0.3
385	0.33
386	0.35
387	0.41
388	0.46
389	0.44
390	0.52
391	0.59
392	0.59
393	0.64
394	0.69
395	0.66
396	0.66
397	0.69
398	0.7
399	0.73
400	0.73
401	0.68
402	0.63
403	0.65
404	0.58
405	0.51
406	0.5
407	0.49
408	0.49
409	0.54
410	0.6
411	0.65
412	0.74
413	0.77
414	0.76
415	0.77
416	0.78
417	0.77
418	0.75
419	0.71
420	0.67
421	0.63
422	0.56
423	0.48
424	0.4
425	0.34
426	0.26
427	0.2
428	0.16
429	0.14
430	0.13
431	0.12
432	0.13
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.05
446	0.06
447	0.07
448	0.09
449	0.11
450	0.16
451	0.17
452	0.18
453	0.24
454	0.26
455	0.28
456	0.32
457	0.33
458	0.37
459	0.42
460	0.43
461	0.44
462	0.43
463	0.43
464	0.39
465	0.36
466	0.27
467	0.21
468	0.18
469	0.1
470	0.08
471	0.05
472	0.05
473	0.03
474	0.03
475	0.04
476	0.04
477	0.05
478	0.07
479	0.08
480	0.1
481	0.1
482	0.11
483	0.12
484	0.13
485	0.14
486	0.12
487	0.12
488	0.11
489	0.14
490	0.16
491	0.16
492	0.17
493	0.16
494	0.17
495	0.18
496	0.17
497	0.19
498	0.2
499	0.2
500	0.18
501	0.2
502	0.28
503	0.31
504	0.33
505	0.32
506	0.32
507	0.35
508	0.37
509	0.38
510	0.31
511	0.27
512	0.24
513	0.21
514	0.18
515	0.15
516	0.12
517	0.1
518	0.1
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.08
523	0.11
524	0.12
525	0.14
526	0.18
527	0.18
528	0.18
529	0.23
530	0.26
531	0.27
532	0.33
533	0.35
534	0.33
535	0.42
536	0.43
537	0.46
538	0.46
539	0.44
540	0.41
541	0.39
542	0.35
543	0.27
544	0.3
545	0.24
546	0.23
547	0.26
548	0.22
549	0.22
550	0.23
551	0.23
552	0.18
553	0.17
554	0.15
555	0.11
556	0.1
557	0.09
558	0.09
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.11
564	0.13
565	0.15
566	0.22
567	0.24
568	0.26
569	0.31
570	0.38
571	0.37
572	0.36
573	0.39
574	0.34
575	0.35
576	0.33
577	0.29
578	0.21
579	0.18
580	0.17
581	0.14
582	0.12
583	0.09
584	0.08
585	0.08
586	0.1
587	0.1
588	0.1
589	0.09
590	0.09
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.09
597	0.09
598	0.09
599	0.1
600	0.1
601	0.11
602	0.11
603	0.12
604	0.11
605	0.1
606	0.11
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.11
611	0.1
612	0.1
613	0.1
614	0.1
615	0.09
616	0.08
617	0.1
618	0.1
619	0.1
620	0.1
621	0.12
622	0.17
623	0.2
624	0.23

A7F1V6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer