FuNGI

A0A0F8B004

Protein Details

Accession

A0A0F8B004

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-71	AVESHAQQKRRRQVKREIQVKM	Hydrophilic
268-292	DELVRDCPSRKKRRFEKSSGRSQVP	Hydrophilic
304-329	TAEKASESKKDKKDRKNTPNNQNSDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
278-280	KKR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito_nucl 10.333, cyto_mito 8.333, mito 8, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR014780 tRNA_psdUridine_synth_TruB
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0106029 F:tRNA pseudouridine synthase activity GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01509 TruB_N

Amino Acid Sequences

MTTQKVVEGVFGINKPLGMSSAQVIRDAQQQLNPSKMFAPWIKQEKEKRAVESHAQQKRRRQVKREIQVKMGHGGTLDPLATGVLILGVGSGTKCLQSFLQCTKTYETIVLFGASTDTYDRSGRVLMRRPYEHITKEAVLKAVDEFRGTIKQVPPLYSALKMEGKPLYEYAREGKPIPREIPTREVEVKELELLEYYEPGTHKFRWPREQADAAETRLAQQVWKLEGEDIDSAAATQESEASSEEEIRESEALAAHEATKRRFEESVDELVRDCPSRKKRRFEKSSGRSQVPMMSGALNGHPETAEKASESKKDKKDRKNTPNNQNSDPSRGHNLVPEVDESLPPPWEGKGPAAARIRLTVTSGFYVRSFCHDLGIKLGSVALMSELCRSRQGDFKLNTPSVLEYSDLMKGEEVWAPKIEAMLRQWEEKHSPSPKMAPGKTEHVETDQKPEPAKVVAPIKPETATGASERTIQDDEKSWNGIED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.16
4	0.15
5	0.11
6	0.12
7	0.13
8	0.19
9	0.19
10	0.2
11	0.2
12	0.21
13	0.28
14	0.3
15	0.29
16	0.27
17	0.33
18	0.35
19	0.42
20	0.4
21	0.34
22	0.32
23	0.3
24	0.33
25	0.3
26	0.33
27	0.35
28	0.44
29	0.47
30	0.54
31	0.62
32	0.66
33	0.71
34	0.7
35	0.67
36	0.63
37	0.64
38	0.64
39	0.64
40	0.64
41	0.64
42	0.67
43	0.68
44	0.72
45	0.77
46	0.79
47	0.79
48	0.77
49	0.79
50	0.82
51	0.86
52	0.86
53	0.8
54	0.77
55	0.73
56	0.67
57	0.61
58	0.5
59	0.4
60	0.31
61	0.26
62	0.2
63	0.16
64	0.13
65	0.08
66	0.07
67	0.07
68	0.06
69	0.06
70	0.05
71	0.03
72	0.03
73	0.03
74	0.03
75	0.03
76	0.03
77	0.03
78	0.04
79	0.05
80	0.06
81	0.06
82	0.08
83	0.1
84	0.14
85	0.2
86	0.25
87	0.33
88	0.34
89	0.36
90	0.39
91	0.39
92	0.36
93	0.33
94	0.27
95	0.21
96	0.2
97	0.17
98	0.13
99	0.11
100	0.11
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.08
105	0.09
106	0.1
107	0.11
108	0.11
109	0.14
110	0.17
111	0.23
112	0.31
113	0.35
114	0.41
115	0.43
116	0.46
117	0.48
118	0.51
119	0.47
120	0.41
121	0.39
122	0.34
123	0.36
124	0.33
125	0.3
126	0.23
127	0.21
128	0.2
129	0.19
130	0.17
131	0.14
132	0.13
133	0.13
134	0.16
135	0.16
136	0.2
137	0.18
138	0.24
139	0.26
140	0.27
141	0.28
142	0.28
143	0.28
144	0.25
145	0.23
146	0.21
147	0.23
148	0.21
149	0.23
150	0.21
151	0.21
152	0.2
153	0.21
154	0.2
155	0.17
156	0.19
157	0.19
158	0.2
159	0.21
160	0.21
161	0.24
162	0.27
163	0.31
164	0.31
165	0.32
166	0.33
167	0.35
168	0.4
169	0.37
170	0.37
171	0.36
172	0.34
173	0.3
174	0.28
175	0.25
176	0.19
177	0.17
178	0.12
179	0.09
180	0.09
181	0.07
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.07
186	0.1
187	0.13
188	0.14
189	0.2
190	0.27
191	0.33
192	0.4
193	0.45
194	0.47
195	0.49
196	0.52
197	0.47
198	0.45
199	0.41
200	0.33
201	0.29
202	0.24
203	0.2
204	0.17
205	0.16
206	0.11
207	0.1
208	0.12
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.1
213	0.1
214	0.12
215	0.11
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.04
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.1
244	0.12
245	0.13
246	0.16
247	0.16
248	0.18
249	0.19
250	0.18
251	0.21
252	0.23
253	0.29
254	0.26
255	0.25
256	0.24
257	0.24
258	0.24
259	0.2
260	0.17
261	0.19
262	0.28
263	0.39
264	0.47
265	0.56
266	0.65
267	0.75
268	0.83
269	0.84
270	0.85
271	0.82
272	0.85
273	0.81
274	0.73
275	0.63
276	0.55
277	0.48
278	0.38
279	0.31
280	0.21
281	0.15
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.1
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.07
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.08
294	0.12
295	0.15
296	0.21
297	0.27
298	0.35
299	0.42
300	0.53
301	0.62
302	0.69
303	0.76
304	0.81
305	0.86
306	0.88
307	0.9
308	0.9
309	0.9
310	0.85
311	0.78
312	0.74
313	0.65
314	0.6
315	0.52
316	0.44
317	0.41
318	0.37
319	0.34
320	0.3
321	0.29
322	0.25
323	0.24
324	0.21
325	0.18
326	0.17
327	0.16
328	0.14
329	0.13
330	0.12
331	0.11
332	0.11
333	0.09
334	0.11
335	0.12
336	0.12
337	0.19
338	0.19
339	0.26
340	0.3
341	0.31
342	0.29
343	0.3
344	0.3
345	0.23
346	0.24
347	0.19
348	0.16
349	0.17
350	0.17
351	0.16
352	0.15
353	0.16
354	0.15
355	0.19
356	0.21
357	0.18
358	0.22
359	0.23
360	0.23
361	0.25
362	0.26
363	0.2
364	0.16
365	0.16
366	0.12
367	0.09
368	0.09
369	0.06
370	0.05
371	0.06
372	0.11
373	0.12
374	0.13
375	0.17
376	0.18
377	0.2
378	0.26
379	0.31
380	0.36
381	0.37
382	0.42
383	0.47
384	0.46
385	0.44
386	0.38
387	0.34
388	0.26
389	0.25
390	0.2
391	0.13
392	0.14
393	0.17
394	0.16
395	0.14
396	0.13
397	0.13
398	0.14
399	0.16
400	0.16
401	0.15
402	0.16
403	0.16
404	0.16
405	0.18
406	0.17
407	0.18
408	0.19
409	0.25
410	0.26
411	0.29
412	0.31
413	0.34
414	0.38
415	0.38
416	0.45
417	0.42
418	0.44
419	0.45
420	0.49
421	0.52
422	0.56
423	0.54
424	0.51
425	0.5
426	0.54
427	0.52
428	0.49
429	0.43
430	0.39
431	0.45
432	0.41
433	0.44
434	0.41
435	0.42
436	0.41
437	0.4
438	0.36
439	0.31
440	0.31
441	0.31
442	0.33
443	0.33
444	0.37
445	0.38
446	0.38
447	0.36
448	0.35
449	0.31
450	0.26
451	0.24
452	0.22
453	0.22
454	0.2
455	0.24
456	0.24
457	0.24
458	0.25
459	0.23
460	0.24
461	0.26
462	0.3
463	0.29
464	0.31

A0A0F8B004

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer