Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F8CSM3

Protein Details
Accession A0A0F8CSM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
556-581YYLSSLRKPQPDRRVLRQNRQKDYTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-431AKGRGKRRDKPAGAGRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041545  DUF5601  
IPR003123  VPS9  
IPR045046  Vps9-like  
IPR037191  VPS9_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF18151  DUF5601  
PF02204  VPS9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51205  VPS9  
Amino Acid Sequences MPESTPPTIHRDDYDADMAASIATLRPSTPPPPAASSPPTAMTLLEPAPYVDPTPPTPIASTPASSRAASQARHGHDGGSSPARSDFGAISDGQGDGDAGTEGDDGTEIQNIMLQFSDDGPKPTAEEVMSPRLEIASPLLGVSPNGNGKAVAAAAPVNMDTEGAASVSSPVHPMRKSSLEPHSSGQVHGLGLQQPVASSSADAAATPTAFSTPNYGDGSETASKSASRSRELSSASDDVGPPVPPKDGKEGLESPSSAEQAPSSASSQQQNTQKQPPAIFTASSSSIAPGPLSAGITPTHHRPPPPEADPEPALPFDFQRFLEQLRHRKADPIARYLKSFLNEFSKKQWMVHEQVKIISDFLAFIGNKMAMCEVWRDVSDAEFDNAREGMEKLVMNRLYSQTFSPAIPPVLPASAKGRGKRRDKPAGAGRRGQHQEDVERDEIVTQKINIYSWVRLEHLDVPPVAESGQRFLKLAQDELLKIRTYRAPRDKIICVLNCCKVIFGLLKHTRSDSSADSFMPLLIYVVLHSNPDHLVSNVQYILRFRNQDKLNGEAGYYLSSLRKPQPDRRVLRQNRQKDYTVQSMPM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.29
3 0.25
4 0.23
5 0.2
6 0.16
7 0.13
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.11
14 0.16
15 0.2
16 0.26
17 0.29
18 0.32
19 0.38
20 0.41
21 0.44
22 0.45
23 0.45
24 0.41
25 0.39
26 0.37
27 0.3
28 0.27
29 0.22
30 0.21
31 0.18
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.14
39 0.16
40 0.18
41 0.24
42 0.24
43 0.24
44 0.25
45 0.25
46 0.27
47 0.26
48 0.26
49 0.22
50 0.26
51 0.27
52 0.25
53 0.25
54 0.29
55 0.32
56 0.31
57 0.35
58 0.38
59 0.4
60 0.44
61 0.43
62 0.36
63 0.32
64 0.33
65 0.31
66 0.29
67 0.25
68 0.21
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.2
73 0.16
74 0.11
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.09
104 0.13
105 0.12
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.14
113 0.18
114 0.19
115 0.24
116 0.24
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.2
121 0.16
122 0.14
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.09
158 0.14
159 0.15
160 0.17
161 0.2
162 0.25
163 0.27
164 0.32
165 0.39
166 0.38
167 0.39
168 0.39
169 0.41
170 0.37
171 0.34
172 0.3
173 0.22
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.13
178 0.12
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.08
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.09
199 0.1
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.19
206 0.17
207 0.17
208 0.13
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.19
213 0.16
214 0.17
215 0.2
216 0.21
217 0.25
218 0.27
219 0.27
220 0.26
221 0.24
222 0.22
223 0.21
224 0.18
225 0.15
226 0.15
227 0.14
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.12
233 0.17
234 0.19
235 0.2
236 0.25
237 0.26
238 0.27
239 0.28
240 0.26
241 0.22
242 0.2
243 0.19
244 0.14
245 0.12
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.11
253 0.13
254 0.15
255 0.2
256 0.27
257 0.3
258 0.34
259 0.39
260 0.41
261 0.4
262 0.4
263 0.36
264 0.33
265 0.29
266 0.25
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.15
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.08
284 0.09
285 0.12
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.2
290 0.25
291 0.3
292 0.32
293 0.33
294 0.3
295 0.33
296 0.34
297 0.32
298 0.28
299 0.22
300 0.19
301 0.14
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.21
310 0.27
311 0.34
312 0.38
313 0.4
314 0.39
315 0.42
316 0.45
317 0.44
318 0.41
319 0.4
320 0.41
321 0.4
322 0.41
323 0.38
324 0.37
325 0.3
326 0.28
327 0.22
328 0.24
329 0.25
330 0.26
331 0.28
332 0.32
333 0.31
334 0.31
335 0.34
336 0.3
337 0.33
338 0.38
339 0.37
340 0.31
341 0.33
342 0.32
343 0.28
344 0.23
345 0.18
346 0.12
347 0.09
348 0.08
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.06
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.18
384 0.2
385 0.19
386 0.19
387 0.19
388 0.16
389 0.17
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.12
400 0.15
401 0.22
402 0.25
403 0.3
404 0.38
405 0.45
406 0.54
407 0.62
408 0.67
409 0.71
410 0.69
411 0.73
412 0.74
413 0.75
414 0.72
415 0.7
416 0.62
417 0.6
418 0.61
419 0.54
420 0.48
421 0.41
422 0.4
423 0.38
424 0.41
425 0.33
426 0.29
427 0.27
428 0.24
429 0.23
430 0.2
431 0.18
432 0.13
433 0.14
434 0.15
435 0.15
436 0.18
437 0.19
438 0.19
439 0.2
440 0.21
441 0.2
442 0.2
443 0.22
444 0.24
445 0.23
446 0.24
447 0.22
448 0.21
449 0.2
450 0.2
451 0.17
452 0.13
453 0.11
454 0.13
455 0.17
456 0.16
457 0.16
458 0.16
459 0.22
460 0.22
461 0.23
462 0.22
463 0.21
464 0.22
465 0.25
466 0.27
467 0.22
468 0.21
469 0.23
470 0.26
471 0.29
472 0.38
473 0.45
474 0.49
475 0.54
476 0.6
477 0.6
478 0.59
479 0.61
480 0.56
481 0.52
482 0.52
483 0.5
484 0.47
485 0.44
486 0.38
487 0.3
488 0.29
489 0.26
490 0.22
491 0.28
492 0.33
493 0.36
494 0.37
495 0.39
496 0.37
497 0.34
498 0.36
499 0.29
500 0.27
501 0.27
502 0.25
503 0.25
504 0.24
505 0.22
506 0.18
507 0.14
508 0.1
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.12
517 0.12
518 0.14
519 0.15
520 0.13
521 0.16
522 0.16
523 0.19
524 0.2
525 0.2
526 0.2
527 0.21
528 0.26
529 0.29
530 0.34
531 0.32
532 0.39
533 0.41
534 0.47
535 0.49
536 0.47
537 0.45
538 0.39
539 0.38
540 0.29
541 0.27
542 0.21
543 0.18
544 0.15
545 0.14
546 0.16
547 0.21
548 0.27
549 0.36
550 0.42
551 0.51
552 0.61
553 0.69
554 0.74
555 0.79
556 0.83
557 0.84
558 0.87
559 0.88
560 0.87
561 0.86
562 0.84
563 0.78
564 0.74
565 0.72
566 0.7