Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EJB8

Protein Details
Accession A7EJB8    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-282VFKAKEQKRGKDKKYWVLADHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR015847  ExoRNase_PH_dom2  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0043928  P:exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
GO:0071042  P:nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process  
GO:0071035  P:nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
GO:0034427  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5'  
GO:0034473  P:U1 snRNA 3'-end processing  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
GO:0034476  P:U5 snRNA 3'-end processing  
KEGG ssl:SS1G_05411  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
PF03725  RNase_PH_C  
Amino Acid Sequences MTSTAQPTLSFPRETFAKLSPHPYLLAHLQPSSPTNSSKRANGRSPTQFRGPHINTGSLTHAEGSAVVRIGDTAVVCGVRGEILLASNVGTYRVDKSTTAPSSRPGYNEAKELDLLVPNIELATGCSPAFLPGQPPTTLAQSLSTRIYSLLHSSRMVDDEDLRIWYQPPDLNEQDRMEDEEEPESVEPEVKAFWTLYIDILFISLDGNPFDAAWAAVVSALRNVRLPKAHWDVDREMILCDDEISLSKRLNLRGLPVAVTCLVFKAKEQKRGKDKKYWVLADPDTFEEGLCDESITMVVDCEAGKPKIMGLSKVGGTTVGRDEMKHILELAETRWHELSPLLSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.31
4 0.34
5 0.35
6 0.41
7 0.4
8 0.39
9 0.38
10 0.35
11 0.34
12 0.32
13 0.34
14 0.3
15 0.27
16 0.26
17 0.27
18 0.28
19 0.3
20 0.27
21 0.27
22 0.29
23 0.36
24 0.39
25 0.45
26 0.52
27 0.55
28 0.6
29 0.61
30 0.65
31 0.68
32 0.72
33 0.69
34 0.68
35 0.64
36 0.59
37 0.64
38 0.58
39 0.56
40 0.52
41 0.5
42 0.42
43 0.4
44 0.4
45 0.3
46 0.28
47 0.19
48 0.17
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.1
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.16
84 0.24
85 0.28
86 0.3
87 0.28
88 0.3
89 0.34
90 0.35
91 0.34
92 0.31
93 0.32
94 0.31
95 0.34
96 0.31
97 0.27
98 0.25
99 0.25
100 0.2
101 0.16
102 0.14
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.09
116 0.1
117 0.08
118 0.1
119 0.11
120 0.14
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.17
125 0.17
126 0.15
127 0.15
128 0.13
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.1
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.11
156 0.16
157 0.18
158 0.19
159 0.21
160 0.21
161 0.2
162 0.19
163 0.19
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.14
212 0.16
213 0.18
214 0.23
215 0.3
216 0.34
217 0.33
218 0.38
219 0.37
220 0.38
221 0.38
222 0.3
223 0.24
224 0.2
225 0.18
226 0.13
227 0.11
228 0.08
229 0.06
230 0.07
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.14
235 0.17
236 0.19
237 0.23
238 0.22
239 0.23
240 0.27
241 0.27
242 0.25
243 0.22
244 0.22
245 0.18
246 0.18
247 0.14
248 0.11
249 0.11
250 0.1
251 0.11
252 0.2
253 0.26
254 0.36
255 0.43
256 0.51
257 0.61
258 0.72
259 0.77
260 0.77
261 0.79
262 0.78
263 0.81
264 0.75
265 0.68
266 0.64
267 0.61
268 0.53
269 0.47
270 0.4
271 0.32
272 0.28
273 0.24
274 0.17
275 0.14
276 0.12
277 0.1
278 0.08
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.09
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.22
295 0.24
296 0.23
297 0.22
298 0.26
299 0.26
300 0.26
301 0.25
302 0.2
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.19
309 0.22
310 0.26
311 0.27
312 0.24
313 0.22
314 0.17
315 0.19
316 0.2
317 0.19
318 0.22
319 0.21
320 0.24
321 0.24
322 0.24
323 0.23
324 0.23