Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EHE4

Protein Details
Accession A7EHE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27KSTPSYWCKHCKQYVKDTKLEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-280KKRKTKNIRQK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 2, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ssl:SS1G_04736  -  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPSYWCKHCKQYVKDTKLEKSNHEASPRHQGNLKRFLRDLHRGHEKDQREKDRAKDEVARLNGIVSGSGEAGSSSQACMPSASTPKPPATAAQRKQQLAQLAELGVSVPDEFRSDLAMPGEWQVTSERIIDDGNGEKKPDALALGVRKREAEDEDEEAKEAKRKRWGTAIRTYPTENNDNDLDALLSNTGKGKGPGLKAETDNGIKIEIKKENDEDVEPPSNSKGAEPAVKPETEEDSKIDLNQVPEATEQNNEPAASGVVFKKRKTKNIRQK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.79
4 0.78
5 0.8
6 0.83
7 0.8
8 0.8
9 0.77
10 0.76
11 0.74
12 0.7
13 0.64
14 0.61
15 0.61
16 0.58
17 0.59
18 0.53
19 0.48
20 0.56
21 0.53
22 0.48
23 0.45
24 0.47
25 0.48
26 0.57
27 0.57
28 0.5
29 0.49
30 0.51
31 0.54
32 0.57
33 0.53
34 0.5
35 0.57
36 0.54
37 0.57
38 0.6
39 0.59
40 0.59
41 0.65
42 0.65
43 0.62
44 0.65
45 0.67
46 0.67
47 0.63
48 0.58
49 0.56
50 0.52
51 0.53
52 0.5
53 0.44
54 0.36
55 0.34
56 0.29
57 0.21
58 0.17
59 0.09
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.12
75 0.17
76 0.19
77 0.21
78 0.24
79 0.25
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.31
84 0.39
85 0.4
86 0.45
87 0.5
88 0.49
89 0.5
90 0.49
91 0.45
92 0.36
93 0.32
94 0.24
95 0.18
96 0.17
97 0.15
98 0.12
99 0.07
100 0.05
101 0.04
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.1
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.08
135 0.06
136 0.09
137 0.15
138 0.19
139 0.2
140 0.2
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.2
145 0.17
146 0.15
147 0.18
148 0.2
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.19
154 0.2
155 0.2
156 0.27
157 0.29
158 0.32
159 0.41
160 0.48
161 0.49
162 0.55
163 0.59
164 0.52
165 0.53
166 0.53
167 0.46
168 0.42
169 0.41
170 0.32
171 0.27
172 0.25
173 0.23
174 0.21
175 0.18
176 0.14
177 0.09
178 0.09
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.12
187 0.16
188 0.18
189 0.23
190 0.24
191 0.27
192 0.27
193 0.28
194 0.29
195 0.25
196 0.24
197 0.2
198 0.18
199 0.17
200 0.18
201 0.22
202 0.24
203 0.25
204 0.28
205 0.3
206 0.32
207 0.32
208 0.32
209 0.28
210 0.28
211 0.3
212 0.27
213 0.26
214 0.24
215 0.23
216 0.21
217 0.2
218 0.17
219 0.16
220 0.22
221 0.21
222 0.27
223 0.29
224 0.29
225 0.29
226 0.28
227 0.31
228 0.28
229 0.29
230 0.25
231 0.26
232 0.27
233 0.27
234 0.28
235 0.24
236 0.23
237 0.25
238 0.22
239 0.19
240 0.19
241 0.21
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.19
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.14
252 0.16
253 0.17
254 0.24
255 0.29
256 0.31
257 0.4
258 0.47
259 0.57
260 0.65