FuNGI

A7F6U5

Protein Details

Accession

A7F6U5

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-46	PQVHFAPLPLRPQKRKRRESNSEPIDDY	Hydrophilic
140-170	SEEESAKSRRERERRKRDERKTGRSNLRIQH	Basic
368-397	FAAHQRRQDRLHKRRKEKRWEERDEVRRTA	Basic
470-491	DAELRRGKEKREDERRRARALF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
32-34	KRK
146-163	KSRRERERRKRDERKTGR
374-387	RQDRLHKRRKEKRW
471-488	AELRRGKEKREDERRRAR

Subcellular Location(s)

mito 10.5, nucl 9, cyto_mito 8.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0070860 C:RNA polymerase I core factor complex GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I
KEGG	ssl:SS1G_13325 -
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MPLFTLPIADTSQTSTTTPQVHFAPLPLRPQKRKRRESNSEPIDDYNNDYTANTNSNTGKGKGVENRGPSEPSAEITNPLSLTPAEVMQYRLAGLGLDKELPSKIGVKHWPHRGLPLSYSINSDDHDSATNTRANEEDDSEEESAKSRRERERRKRDERKTGRSNLRIQHLSVLVAIMMRNLEEGDMERAGRAWALLLRMQIAGQGVEIRKTGYWGIGAELLIRGAVNQQRKEWWEADAEEASGDEANIDSDGEPKEDDKGKRGGEEGEEKRYGTAEGLLKVKDYYERLILQYPYKRQFHGSVNALDFWPAMLGCEIYGIQFEHKAGLRKIAKQAEKDEEGDISDSDISDEEEDMDDDEEGDPGDKAFAAHQRRQDRLHKRRKEKRWEERDEVRRTALVATEVVAQRMDELMTTPPYSDSPVLIRLRGMVALYIGDLCVPEKWDGDEEWLGKVRGGDTEADRRFLGRQRDAELRRGKEKREDERRRARALFGKIGLEWDDGDEGMDLDMTLEGYEGDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.23
4	0.28
5	0.28
6	0.28
7	0.28
8	0.3
9	0.3
10	0.31
11	0.31
12	0.29
13	0.38
14	0.44
15	0.51
16	0.58
17	0.68
18	0.76
19	0.81
20	0.88
21	0.9
22	0.91
23	0.92
24	0.92
25	0.93
26	0.9
27	0.84
28	0.76
29	0.68
30	0.61
31	0.51
32	0.47
33	0.38
34	0.3
35	0.25
36	0.23
37	0.22
38	0.21
39	0.23
40	0.18
41	0.2
42	0.2
43	0.25
44	0.28
45	0.28
46	0.29
47	0.27
48	0.33
49	0.36
50	0.43
51	0.45
52	0.46
53	0.49
54	0.48
55	0.48
56	0.42
57	0.38
58	0.3
59	0.25
60	0.24
61	0.21
62	0.2
63	0.19
64	0.21
65	0.18
66	0.17
67	0.17
68	0.13
69	0.13
70	0.12
71	0.11
72	0.1
73	0.11
74	0.13
75	0.13
76	0.13
77	0.12
78	0.11
79	0.1
80	0.09
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.1
85	0.1
86	0.11
87	0.12
88	0.12
89	0.13
90	0.15
91	0.16
92	0.22
93	0.3
94	0.37
95	0.45
96	0.54
97	0.59
98	0.55
99	0.6
100	0.58
101	0.52
102	0.46
103	0.45
104	0.4
105	0.34
106	0.36
107	0.31
108	0.26
109	0.24
110	0.26
111	0.19
112	0.16
113	0.17
114	0.16
115	0.16
116	0.18
117	0.21
118	0.17
119	0.17
120	0.17
121	0.18
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.16
126	0.19
127	0.19
128	0.18
129	0.16
130	0.17
131	0.17
132	0.18
133	0.21
134	0.25
135	0.34
136	0.45
137	0.56
138	0.65
139	0.74
140	0.82
141	0.89
142	0.93
143	0.93
144	0.94
145	0.93
146	0.92
147	0.9
148	0.89
149	0.87
150	0.83
151	0.81
152	0.75
153	0.72
154	0.64
155	0.54
156	0.49
157	0.4
158	0.33
159	0.25
160	0.2
161	0.12
162	0.11
163	0.1
164	0.06
165	0.05
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.05
172	0.07
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.06
180	0.05
181	0.06
182	0.07
183	0.09
184	0.09
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.07
191	0.06
192	0.09
193	0.08
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.06
210	0.05
211	0.04
212	0.07
213	0.11
214	0.16
215	0.17
216	0.18
217	0.21
218	0.23
219	0.27
220	0.25
221	0.22
222	0.19
223	0.19
224	0.2
225	0.17
226	0.15
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.06
231	0.05
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.1
244	0.16
245	0.16
246	0.18
247	0.22
248	0.22
249	0.23
250	0.23
251	0.21
252	0.19
253	0.27
254	0.26
255	0.26
256	0.26
257	0.25
258	0.24
259	0.24
260	0.21
261	0.12
262	0.14
263	0.11
264	0.13
265	0.15
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.12
272	0.11
273	0.13
274	0.14
275	0.15
276	0.19
277	0.2
278	0.22
279	0.26
280	0.31
281	0.34
282	0.35
283	0.34
284	0.34
285	0.37
286	0.37
287	0.39
288	0.36
289	0.33
290	0.32
291	0.32
292	0.3
293	0.25
294	0.2
295	0.13
296	0.09
297	0.05
298	0.05
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.09
311	0.11
312	0.16
313	0.15
314	0.24
315	0.26
316	0.29
317	0.37
318	0.42
319	0.44
320	0.43
321	0.48
322	0.45
323	0.45
324	0.42
325	0.36
326	0.28
327	0.25
328	0.22
329	0.17
330	0.12
331	0.09
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.15
356	0.21
357	0.26
358	0.34
359	0.39
360	0.43
361	0.5
362	0.57
363	0.61
364	0.66
365	0.72
366	0.75
367	0.8
368	0.87
369	0.91
370	0.92
371	0.92
372	0.92
373	0.92
374	0.91
375	0.88
376	0.88
377	0.87
378	0.82
379	0.74
380	0.64
381	0.53
382	0.45
383	0.38
384	0.29
385	0.21
386	0.14
387	0.12
388	0.16
389	0.16
390	0.16
391	0.15
392	0.13
393	0.12
394	0.12
395	0.11
396	0.06
397	0.07
398	0.09
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.12
403	0.13
404	0.16
405	0.15
406	0.14
407	0.14
408	0.22
409	0.23
410	0.22
411	0.22
412	0.2
413	0.2
414	0.2
415	0.17
416	0.1
417	0.09
418	0.08
419	0.09
420	0.07
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.09
427	0.09
428	0.1
429	0.12
430	0.14
431	0.15
432	0.19
433	0.23
434	0.21
435	0.23
436	0.26
437	0.24
438	0.23
439	0.23
440	0.19
441	0.17
442	0.18
443	0.18
444	0.2
445	0.29
446	0.3
447	0.31
448	0.31
449	0.3
450	0.33
451	0.36
452	0.4
453	0.38
454	0.4
455	0.43
456	0.53
457	0.55
458	0.6
459	0.62
460	0.59
461	0.62
462	0.63
463	0.63
464	0.64
465	0.7
466	0.72
467	0.74
468	0.79
469	0.8
470	0.85
471	0.88
472	0.86
473	0.79
474	0.75
475	0.72
476	0.69
477	0.66
478	0.58
479	0.53
480	0.45
481	0.45
482	0.4
483	0.32
484	0.25
485	0.19
486	0.16
487	0.14
488	0.14
489	0.11
490	0.09
491	0.08
492	0.08
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.05
498	0.05

A7F6U5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer