Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7F8J3

Protein Details
Accession A7F8J3    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-50VKPSQTTKAKSKQTAKATATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-62AKSKQTAKATATKAAKPAPKPVKK
92-97TKAKAN
433-481GGFGGRGGRGGGGRGGGRGGGRGGFDRGGRGGGGRGGARGGRGGSTNRG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ssl:SS1G_13924  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKTKDTKVAKASKKTEVKPPLSTVKNAAVVKPSQTTKAKSKQTAKATATKAAKPAPKPVKKAATPSSDSGSDSESGSDSESEEEKPAPKATKAKANGKTAKVAEKKEVESSSESSSESSSESEDDSESSESETDSEPVAKTAKKAASSESDDSDDSSDSDSDSEEEAKPVVAAAKKVQAVVDAGKAKVNGAAKAVAKATEDSDDSDSSDSSEDKKASGSDSDSSDSDSESASETEAEAPSKKRKAENEPEPSAKKTKTEETAADDGSPKNLFVGNLSWNIDDEWLYREFEEFGEITGARVISDKNTGRSKGFGYVEFAKSADAAAALAAKKGALIDGREANVDFSTPRENVAPKDRANNRAAQFGDAKNPPSDTLFLGNLSFDADENGFGYVTFGSVEDATAAYDAMMGADIAGRPVRLDYATPRPERSEGGGFGGRGGRGGGGRGGGRGGGRGGFDRGGRGGGGRGGARGGRGGSTNRGGFGDFKGKKMSFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.75
3 0.76
4 0.76
5 0.72
6 0.68
7 0.69
8 0.68
9 0.63
10 0.61
11 0.56
12 0.52
13 0.53
14 0.49
15 0.44
16 0.4
17 0.38
18 0.39
19 0.4
20 0.36
21 0.36
22 0.41
23 0.45
24 0.49
25 0.57
26 0.63
27 0.66
28 0.73
29 0.75
30 0.77
31 0.81
32 0.76
33 0.76
34 0.7
35 0.69
36 0.65
37 0.59
38 0.55
39 0.53
40 0.55
41 0.49
42 0.56
43 0.58
44 0.61
45 0.64
46 0.68
47 0.7
48 0.68
49 0.73
50 0.71
51 0.68
52 0.64
53 0.61
54 0.56
55 0.47
56 0.44
57 0.37
58 0.31
59 0.23
60 0.19
61 0.17
62 0.13
63 0.12
64 0.13
65 0.12
66 0.1
67 0.11
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.19
74 0.23
75 0.23
76 0.27
77 0.34
78 0.36
79 0.44
80 0.5
81 0.57
82 0.61
83 0.68
84 0.7
85 0.65
86 0.68
87 0.61
88 0.63
89 0.59
90 0.54
91 0.52
92 0.49
93 0.48
94 0.47
95 0.45
96 0.39
97 0.36
98 0.35
99 0.31
100 0.27
101 0.26
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.14
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.2
130 0.22
131 0.23
132 0.24
133 0.26
134 0.3
135 0.35
136 0.36
137 0.31
138 0.3
139 0.27
140 0.27
141 0.25
142 0.19
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.12
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.15
167 0.15
168 0.15
169 0.18
170 0.15
171 0.15
172 0.16
173 0.16
174 0.15
175 0.17
176 0.17
177 0.13
178 0.12
179 0.15
180 0.15
181 0.16
182 0.16
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.11
189 0.11
190 0.13
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.14
209 0.15
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.11
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.11
227 0.17
228 0.2
229 0.22
230 0.25
231 0.31
232 0.39
233 0.48
234 0.55
235 0.57
236 0.58
237 0.6
238 0.58
239 0.55
240 0.5
241 0.41
242 0.34
243 0.29
244 0.29
245 0.28
246 0.29
247 0.28
248 0.3
249 0.32
250 0.29
251 0.26
252 0.23
253 0.19
254 0.18
255 0.16
256 0.1
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.1
263 0.12
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.08
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.14
291 0.15
292 0.19
293 0.24
294 0.25
295 0.25
296 0.27
297 0.27
298 0.28
299 0.28
300 0.23
301 0.24
302 0.27
303 0.27
304 0.26
305 0.24
306 0.18
307 0.16
308 0.15
309 0.1
310 0.06
311 0.04
312 0.04
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.06
322 0.07
323 0.11
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.15
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.09
332 0.09
333 0.12
334 0.11
335 0.12
336 0.14
337 0.16
338 0.2
339 0.28
340 0.32
341 0.3
342 0.4
343 0.44
344 0.48
345 0.49
346 0.53
347 0.46
348 0.46
349 0.45
350 0.38
351 0.37
352 0.32
353 0.36
354 0.31
355 0.32
356 0.26
357 0.27
358 0.25
359 0.22
360 0.22
361 0.17
362 0.18
363 0.17
364 0.16
365 0.15
366 0.14
367 0.12
368 0.12
369 0.1
370 0.07
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.04
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.03
397 0.03
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.12
408 0.16
409 0.26
410 0.35
411 0.37
412 0.4
413 0.42
414 0.43
415 0.43
416 0.43
417 0.38
418 0.31
419 0.34
420 0.34
421 0.3
422 0.3
423 0.3
424 0.24
425 0.19
426 0.18
427 0.14
428 0.12
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.12
440 0.13
441 0.14
442 0.17
443 0.18
444 0.18
445 0.19
446 0.19
447 0.19
448 0.17
449 0.16
450 0.15
451 0.15
452 0.17
453 0.15
454 0.15
455 0.16
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.16
460 0.15
461 0.18
462 0.2
463 0.24
464 0.3
465 0.3
466 0.29
467 0.29
468 0.29
469 0.28
470 0.3
471 0.34
472 0.29
473 0.31
474 0.38