FuNGI

A0A0F8W8U2

Protein Details

Accession

A0A0F8W8U2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
336-355	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
449-472	KTGAQAKRKGAKAKRGKNGNETIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
340-345	RRKKRK
454-465	AKRKGAKAKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRKQWIDKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDPEADDRVLHAVYGPPPSDPSSSSKDARSKNLNDLAGEFGSERIRTNEGEAANYGVYYDDSKYDYMQHLRELGTGGGDSYFVEANTKGKDKPKSMKLEDALRQASLNDDDDDDEVRSTWDGRSTASYAYGAASTASSFVRKPTYQDQQNVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEEYVDGDDGDDVFGQLTSNAEEMDAGDWEDTIFDHDEEDDGWESDATEKAPNQPNTTDAKLHATLEAESLAPGELPSHDVPAPDMDPEDQSWMREFAKFKKAGKPQATPAAAPSVVPSEQRSTLASTVFTVGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSIARTEGHRLLDDRFERVEALYSLDEEDEFDDSMSMVSGMTGMTGMTGMSAISTASSQAPSLIDANGNAVAPRHDFNNIMDDFLAGWDGKTGAQAKRKGAKAKRGKNGNETIGIQMLDEIRQGLGPAHLSGQVPGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.65
2	0.59
3	0.58
4	0.61
5	0.55
6	0.52
7	0.51
8	0.5
9	0.5
10	0.55
11	0.48
12	0.42
13	0.45
14	0.46
15	0.39
16	0.37
17	0.33
18	0.29
19	0.29
20	0.25
21	0.2
22	0.15
23	0.17
24	0.16
25	0.15
26	0.11
27	0.13
28	0.16
29	0.2
30	0.2
31	0.18
32	0.21
33	0.24
34	0.25
35	0.23
36	0.26
37	0.29
38	0.34
39	0.36
40	0.41
41	0.46
42	0.5
43	0.55
44	0.59
45	0.56
46	0.59
47	0.64
48	0.58
49	0.51
50	0.48
51	0.43
52	0.34
53	0.3
54	0.21
55	0.16
56	0.16
57	0.16
58	0.15
59	0.14
60	0.17
61	0.17
62	0.19
63	0.23
64	0.21
65	0.22
66	0.22
67	0.21
68	0.18
69	0.17
70	0.14
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.09
76	0.11
77	0.12
78	0.13
79	0.16
80	0.2
81	0.24
82	0.24
83	0.25
84	0.26
85	0.26
86	0.26
87	0.24
88	0.19
89	0.14
90	0.13
91	0.11
92	0.08
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.06
98	0.08
99	0.08
100	0.11
101	0.14
102	0.17
103	0.19
104	0.26
105	0.33
106	0.39
107	0.48
108	0.54
109	0.61
110	0.62
111	0.66
112	0.63
113	0.65
114	0.63
115	0.6
116	0.52
117	0.43
118	0.39
119	0.31
120	0.29
121	0.22
122	0.19
123	0.13
124	0.12
125	0.13
126	0.13
127	0.14
128	0.12
129	0.11
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.09
135	0.11
136	0.11
137	0.12
138	0.15
139	0.16
140	0.16
141	0.16
142	0.15
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.08
147	0.07
148	0.06
149	0.05
150	0.06
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.09
155	0.14
156	0.15
157	0.19
158	0.26
159	0.35
160	0.4
161	0.45
162	0.49
163	0.49
164	0.52
165	0.48
166	0.4
167	0.32
168	0.26
169	0.21
170	0.16
171	0.11
172	0.07
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.08
177	0.09
178	0.09
179	0.09
180	0.13
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.07
192	0.06
193	0.04
194	0.04
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.07
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.13
240	0.21
241	0.23
242	0.24
243	0.24
244	0.26
245	0.29
246	0.3
247	0.25
248	0.19
249	0.21
250	0.2
251	0.2
252	0.18
253	0.14
254	0.13
255	0.12
256	0.12
257	0.07
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.07
266	0.07
267	0.09
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.12
272	0.12
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.09
278	0.13
279	0.11
280	0.11
281	0.12
282	0.14
283	0.14
284	0.17
285	0.18
286	0.2
287	0.29
288	0.33
289	0.35
290	0.42
291	0.48
292	0.54
293	0.59
294	0.57
295	0.52
296	0.57
297	0.55
298	0.46
299	0.4
300	0.34
301	0.28
302	0.23
303	0.19
304	0.13
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.13
309	0.14
310	0.15
311	0.16
312	0.16
313	0.17
314	0.16
315	0.15
316	0.13
317	0.13
318	0.12
319	0.11
320	0.09
321	0.08
322	0.11
323	0.13
324	0.18
325	0.25
326	0.36
327	0.43
328	0.47
329	0.56
330	0.63
331	0.71
332	0.75
333	0.78
334	0.78
335	0.8
336	0.81
337	0.72
338	0.64
339	0.54
340	0.43
341	0.35
342	0.25
343	0.18
344	0.14
345	0.13
346	0.12
347	0.12
348	0.14
349	0.13
350	0.14
351	0.19
352	0.2
353	0.22
354	0.23
355	0.23
356	0.24
357	0.31
358	0.3
359	0.26
360	0.24
361	0.23
362	0.22
363	0.21
364	0.21
365	0.14
366	0.15
367	0.13
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.11
372	0.09
373	0.1
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.12
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.12
412	0.12
413	0.12
414	0.11
415	0.1
416	0.11
417	0.12
418	0.13
419	0.13
420	0.14
421	0.16
422	0.17
423	0.25
424	0.23
425	0.22
426	0.21
427	0.19
428	0.17
429	0.16
430	0.16
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.08
435	0.08
436	0.12
437	0.17
438	0.22
439	0.3
440	0.35
441	0.43
442	0.51
443	0.57
444	0.63
445	0.67
446	0.72
447	0.75
448	0.8
449	0.81
450	0.83
451	0.83
452	0.83
453	0.82
454	0.77
455	0.7
456	0.62
457	0.54
458	0.47
459	0.4
460	0.3
461	0.24
462	0.2
463	0.15
464	0.14
465	0.12
466	0.1
467	0.1
468	0.11
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.12
473	0.13
474	0.16
475	0.16
476	0.18

A0A0F8W8U2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer