Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7EDF1

Protein Details
Accession A7EDF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-211VEPALAKSGRRTRKRNNRGKKPVERAFQEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
189-204KSGRRTRKRNNRGKKP
331-337TRRPESK
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 8, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004443  YjeF_N_dom  
IPR036652  YjeF_N_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0031087  P:deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
GO:0033962  P:P-body assembly  
KEGG ssl:SS1G_03341  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03853  YjeF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51385  YJEF_N  
Amino Acid Sequences MSNQFIGLTMLVTLSSPPGAQLRGIVSSIEPGKSLTLREVTCPSNGKYVPEFTINAAEITELIEARNENVKPPPSVIQQKPAVVPASAAKKFEDPAILSMGRRPVSDTPLAASVQSQSQWKSTMMERGDSARTAVSREDRRKEQNTSSTLPDSMTSLEVHDLEEREEAEILEELDTELADLSVEPALAKSGRRTRKRNNRGKKPVERAFQEPNVDPAKETTRSKGWRQTPLLEPVTSFQPFATLKKSQRRGNRNMEESGWATEEATDVQEMGDFDFPGTYGGKNLHPSENVLDTPNGATKASETWKSDADDTDIQEKSSQRGSGSGRNSRTRRPESKLGNHHRPISRKGSTVPGSQPSRNISVGPSKPMFYLLPSDRRCEPISALQMLNLENIADTELGLTEDMMTENAGRGIAEVGLSAVNIEGRALTQGKKSTVPTVIVFAGNNKSGLRAVAAGRHLRNHGLNVVVCVLGLERDSELLVGLRRQIKVFRGFGGKVCTKAELLDFVKTSSVPIDLIIDGLLGLTMSFEELRTGDQATAYELIEWANRNKAPVLAIDVPTGIDPTSGKVSVIDGRKLYIYARYVVAMGAPKKGLLEAMIMGEGVGNEEKLGLGITSLNAKASGEWQLSVADVGLGMAVWKKAGTRVRRGVEFEGSWVLGMRFQSGVGLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.07
4 0.09
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.15
9 0.16
10 0.18
11 0.19
12 0.18
13 0.15
14 0.2
15 0.22
16 0.2
17 0.18
18 0.16
19 0.19
20 0.2
21 0.21
22 0.2
23 0.24
24 0.24
25 0.28
26 0.32
27 0.31
28 0.34
29 0.38
30 0.35
31 0.38
32 0.38
33 0.38
34 0.37
35 0.39
36 0.37
37 0.36
38 0.35
39 0.28
40 0.33
41 0.29
42 0.25
43 0.21
44 0.18
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.08
49 0.07
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.18
54 0.17
55 0.19
56 0.26
57 0.3
58 0.29
59 0.33
60 0.36
61 0.38
62 0.48
63 0.48
64 0.5
65 0.51
66 0.53
67 0.51
68 0.49
69 0.42
70 0.32
71 0.3
72 0.27
73 0.31
74 0.3
75 0.29
76 0.27
77 0.28
78 0.28
79 0.29
80 0.28
81 0.21
82 0.21
83 0.25
84 0.25
85 0.23
86 0.26
87 0.3
88 0.26
89 0.24
90 0.27
91 0.25
92 0.29
93 0.31
94 0.28
95 0.25
96 0.26
97 0.26
98 0.22
99 0.19
100 0.16
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.16
105 0.18
106 0.2
107 0.2
108 0.21
109 0.22
110 0.28
111 0.26
112 0.27
113 0.26
114 0.28
115 0.29
116 0.27
117 0.25
118 0.19
119 0.18
120 0.17
121 0.2
122 0.24
123 0.32
124 0.4
125 0.46
126 0.51
127 0.6
128 0.64
129 0.67
130 0.67
131 0.65
132 0.62
133 0.59
134 0.56
135 0.5
136 0.44
137 0.38
138 0.3
139 0.23
140 0.18
141 0.16
142 0.12
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.14
177 0.23
178 0.33
179 0.42
180 0.51
181 0.61
182 0.71
183 0.82
184 0.86
185 0.88
186 0.9
187 0.92
188 0.94
189 0.93
190 0.92
191 0.89
192 0.85
193 0.78
194 0.72
195 0.68
196 0.61
197 0.55
198 0.45
199 0.42
200 0.38
201 0.34
202 0.28
203 0.24
204 0.25
205 0.25
206 0.26
207 0.25
208 0.3
209 0.35
210 0.4
211 0.46
212 0.48
213 0.53
214 0.55
215 0.56
216 0.53
217 0.56
218 0.53
219 0.44
220 0.38
221 0.31
222 0.31
223 0.26
224 0.22
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.17
229 0.21
230 0.23
231 0.29
232 0.39
233 0.46
234 0.48
235 0.57
236 0.65
237 0.69
238 0.74
239 0.75
240 0.7
241 0.64
242 0.59
243 0.52
244 0.44
245 0.36
246 0.26
247 0.18
248 0.14
249 0.12
250 0.11
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.08
269 0.1
270 0.14
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.18
275 0.18
276 0.19
277 0.18
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.11
288 0.13
289 0.16
290 0.16
291 0.17
292 0.2
293 0.21
294 0.21
295 0.18
296 0.2
297 0.18
298 0.17
299 0.21
300 0.18
301 0.17
302 0.19
303 0.19
304 0.17
305 0.18
306 0.17
307 0.12
308 0.17
309 0.19
310 0.23
311 0.28
312 0.33
313 0.35
314 0.43
315 0.45
316 0.46
317 0.52
318 0.53
319 0.54
320 0.54
321 0.58
322 0.58
323 0.64
324 0.69
325 0.69
326 0.7
327 0.67
328 0.67
329 0.63
330 0.59
331 0.55
332 0.53
333 0.46
334 0.38
335 0.37
336 0.38
337 0.36
338 0.36
339 0.33
340 0.33
341 0.34
342 0.33
343 0.34
344 0.29
345 0.3
346 0.26
347 0.24
348 0.19
349 0.23
350 0.24
351 0.25
352 0.24
353 0.21
354 0.21
355 0.22
356 0.21
357 0.14
358 0.19
359 0.18
360 0.26
361 0.27
362 0.3
363 0.29
364 0.32
365 0.33
366 0.28
367 0.27
368 0.23
369 0.26
370 0.26
371 0.24
372 0.22
373 0.22
374 0.21
375 0.18
376 0.12
377 0.09
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.05
414 0.07
415 0.08
416 0.12
417 0.15
418 0.17
419 0.2
420 0.21
421 0.23
422 0.24
423 0.25
424 0.22
425 0.22
426 0.21
427 0.19
428 0.18
429 0.16
430 0.16
431 0.15
432 0.15
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.12
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.13
441 0.17
442 0.21
443 0.22
444 0.24
445 0.25
446 0.25
447 0.26
448 0.23
449 0.21
450 0.19
451 0.19
452 0.17
453 0.17
454 0.14
455 0.12
456 0.1
457 0.09
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.07
468 0.07
469 0.12
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.21
474 0.26
475 0.32
476 0.33
477 0.32
478 0.33
479 0.33
480 0.35
481 0.4
482 0.36
483 0.31
484 0.31
485 0.28
486 0.23
487 0.23
488 0.21
489 0.2
490 0.19
491 0.2
492 0.2
493 0.19
494 0.19
495 0.18
496 0.18
497 0.12
498 0.11
499 0.08
500 0.08
501 0.09
502 0.08
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.03
510 0.03
511 0.02
512 0.02
513 0.03
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.06
518 0.07
519 0.08
520 0.1
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.13
526 0.11
527 0.1
528 0.09
529 0.1
530 0.11
531 0.13
532 0.13
533 0.18
534 0.19
535 0.2
536 0.21
537 0.21
538 0.2
539 0.2
540 0.25
541 0.23
542 0.23
543 0.22
544 0.22
545 0.21
546 0.19
547 0.19
548 0.12
549 0.08
550 0.07
551 0.09
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.15
557 0.21
558 0.25
559 0.27
560 0.23
561 0.24
562 0.25
563 0.25
564 0.24
565 0.23
566 0.21
567 0.2
568 0.2
569 0.2
570 0.19
571 0.18
572 0.2
573 0.2
574 0.19
575 0.2
576 0.19
577 0.18
578 0.18
579 0.19
580 0.17
581 0.11
582 0.12
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.07
598 0.05
599 0.05
600 0.06
601 0.07
602 0.1
603 0.11
604 0.11
605 0.11
606 0.12
607 0.12
608 0.14
609 0.19
610 0.16
611 0.16
612 0.17
613 0.17
614 0.17
615 0.16
616 0.14
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.04
622 0.04
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.08
628 0.15
629 0.24
630 0.31
631 0.4
632 0.49
633 0.56
634 0.61
635 0.65
636 0.63
637 0.61
638 0.54
639 0.47
640 0.41
641 0.34
642 0.29
643 0.25
644 0.21
645 0.17
646 0.16
647 0.15
648 0.12
649 0.12