Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7ER87

Protein Details
Accession A7ER87    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-53LIASKVRGRTNKDCRKRWSKVGKEVNKGLWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
148-156RKGRLKRRK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000278  P:mitotic cell cycle  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ssl:SS1G_07841  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MDITAPSPPSRVLKERGIVNDWNLIASKVRGRTNKDCRKRWSKVGKEVNKGLWDHEEDDRLRRGVEQHGTYWTMVAEIVQTRHADQCAKRWYHFLDPNISHEDWDSDEEARLLEAVSVHGRSWKSISEKEFPNRSPTDIKNRYVIMERKGRLKRRKASTTQCTPVRERSGFDFPKPERLNQGLRTETSPDNVMEYETENTLMGQLPLPGLPLQLTAQQISQNHYNNDANSLFNFDGLPPLQFHDMSYSSTEPSSPGISLSQNPVPTGYNMGIQTVSGLTNETEADIDQLYCEDMNFDLALAEAFSAPDHRQSIASTPPTMSSASDVPAGGHNYKLILEDVKPDTLFSIVNMLVESRSNVKMEVFSNVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.54
4 0.54
5 0.5
6 0.46
7 0.46
8 0.39
9 0.35
10 0.29
11 0.24
12 0.21
13 0.21
14 0.24
15 0.25
16 0.32
17 0.37
18 0.45
19 0.55
20 0.64
21 0.72
22 0.77
23 0.8
24 0.83
25 0.87
26 0.86
27 0.86
28 0.86
29 0.85
30 0.85
31 0.88
32 0.86
33 0.84
34 0.83
35 0.77
36 0.71
37 0.62
38 0.53
39 0.48
40 0.41
41 0.36
42 0.33
43 0.34
44 0.3
45 0.34
46 0.35
47 0.31
48 0.28
49 0.27
50 0.27
51 0.28
52 0.34
53 0.32
54 0.3
55 0.33
56 0.35
57 0.33
58 0.3
59 0.22
60 0.15
61 0.12
62 0.1
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.17
70 0.18
71 0.22
72 0.21
73 0.29
74 0.36
75 0.39
76 0.39
77 0.41
78 0.43
79 0.47
80 0.51
81 0.46
82 0.46
83 0.44
84 0.47
85 0.48
86 0.44
87 0.35
88 0.29
89 0.27
90 0.19
91 0.2
92 0.17
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.15
110 0.17
111 0.21
112 0.25
113 0.3
114 0.32
115 0.38
116 0.44
117 0.49
118 0.46
119 0.48
120 0.44
121 0.43
122 0.43
123 0.41
124 0.45
125 0.45
126 0.45
127 0.42
128 0.41
129 0.4
130 0.4
131 0.4
132 0.35
133 0.37
134 0.37
135 0.42
136 0.49
137 0.57
138 0.6
139 0.66
140 0.69
141 0.7
142 0.78
143 0.77
144 0.79
145 0.79
146 0.78
147 0.75
148 0.71
149 0.65
150 0.59
151 0.56
152 0.52
153 0.44
154 0.37
155 0.35
156 0.39
157 0.36
158 0.35
159 0.37
160 0.31
161 0.41
162 0.4
163 0.37
164 0.32
165 0.34
166 0.38
167 0.35
168 0.39
169 0.3
170 0.3
171 0.3
172 0.29
173 0.26
174 0.22
175 0.18
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.13
205 0.14
206 0.16
207 0.21
208 0.21
209 0.21
210 0.25
211 0.26
212 0.23
213 0.26
214 0.24
215 0.19
216 0.16
217 0.19
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.12
225 0.08
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.16
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.15
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.13
246 0.17
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.19
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.16
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.1
262 0.1
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.07
293 0.08
294 0.12
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.2
300 0.26
301 0.28
302 0.26
303 0.25
304 0.26
305 0.26
306 0.25
307 0.22
308 0.18
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.15
313 0.15
314 0.18
315 0.21
316 0.19
317 0.18
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.17
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.19
326 0.22
327 0.25
328 0.24
329 0.23
330 0.22
331 0.2
332 0.2
333 0.14
334 0.16
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.13
341 0.15
342 0.14
343 0.17
344 0.17
345 0.18
346 0.19
347 0.22
348 0.22