FuNGI

A7EM90

Protein Details

Accession

A7EM90

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
236-257	NRDRGKYHKNEGRPRENRQSYR	Basic
406-432	EATGWFPQRKAKRPYKKGKSEKLSSHD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-425	RKAKRPYKKGKS

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR041588 Integrase_H2C2 IPR032567 LDOC1-rel IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH IPR041577 RT_RNaseH_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
KEGG	ssl:SS1G_06437 -
Pfam	View protein in Pfam PF13650 Asp_protease_2 PF17921 Integrase_H2C2 PF03732 Retrotrans_gag PF17917 RT_RNaseH PF17919 RT_RNaseH_2 PF00078 RVT_1 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSSTTPQPSNPATTNQATPESTDKDGDIAMGGIEDPKEITVTETLKVALPDRFTGNRQELETFLLQLEIYFQFNQDKFNHDADKSVWAASYLRGEAAKWIQPYLKDYFTNLSEPKKRMYPTQAIFGRFKGFKREIRRVFGNINELRDAESKIYGLKQTGSAVKYVVEFRRYIGIIGWEENATMSHYRKGLKPEVRLELDRNGTWEDLNELIEESIKADEMLYEYQKERRSSNVHGNRDRGKYHKNEGRPRENRQSYREPMQLDATFKNKLPKEEVERRRKDKLCFECGKPGHRARDCRSKRSSGGGYHKKFGKGQLNATFVPQLCASYPIEDDSYEREERQKEIDAMPRDQEGLNAIDRYELERLRTPSPPLIKEDPKEIPSVEHATMSWIACYDESCRIHLSDKEATGWFPQRKAKRPYKKGKSEKLSSHDHLNGQLHKIDQIDQIDQIDQIDQIDHNKVLGQGQLNIAGQAGQIYCNAKINGRVIRAMIDSGATGNFIAPGTVKHLGVQLQAKRTPYQLQLVDGQLAGLDGKISQETRPLQMSITQHKGVIQFDVVPLGNQQIILGMPWLKAHNPQIDWSSETISFPRRSDQRDVLEPARLNTRGGELKANSTTDVGRPVQGPPLTAKEGEPPVQMKNEQKKLLETTPVEKQDETPIPVQYQKYKKLFEERKGHEALPEHKPWDHEIVLEEGKTPPFGPIYPMSASDLRTLRDYIADALEKGWIRESTSQAASPVLFVPKKDGTRRLCVDYRKLNDITIKDRYPLPLATELRDRLGKAKIFSKFDLRNGFHLIRMKEGEEWKTAFRTRYGLYEYQVMPFGLTNAPATYDILVFSETEEQHIKDVHKVLQQLEEADLQCKPSKCEFHVTETEFLGYTIFSGGLKMSPNKNYSKIAAPMTEITKKSQGEFRWTETAQEAFERLKEAFAGEPVLRAFDPELPIIVETDSSDYAIGALSPAELNYEIYDKELLAIVDAFREWRVYLEGSKYTVQVYTDHKNLVYFTTTKELNRRQVRWSETMAAYNFRISYVKGNENARADALSRKPEYLQNKTHESRAILKQDGDALVHNKPQLAATSGVNYDTIKDIIKTEYSTDTTAKRILAIPDNPERGFTIEDGFIHFHGKLYIPSSLAKDYVTEQHELPAHGHQGIARTFARIRGEVHFPKMRTIVENVVGNCDTCIRNKAARHAPYGQLKTPELPTQPWKSIAWDFVVKLPLSKDPVTRKEYDSILVVTDRLTKFAHMIPFCETWTADDLAYIFMRNIKALDNLSPTNRWPNRTIKPNDGSLSSLLHQLQTRQLVWDLRLKGGIKFISFEETYRQNDQAIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.4
3	0.41
4	0.35
5	0.35
6	0.36
7	0.35
8	0.33
9	0.31
10	0.28
11	0.24
12	0.24
13	0.21
14	0.15
15	0.11
16	0.08
17	0.07
18	0.07
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.08
25	0.08
26	0.1
27	0.14
28	0.16
29	0.16
30	0.17
31	0.18
32	0.19
33	0.2
34	0.21
35	0.2
36	0.2
37	0.22
38	0.27
39	0.3
40	0.3
41	0.37
42	0.4
43	0.4
44	0.4
45	0.39
46	0.34
47	0.36
48	0.35
49	0.28
50	0.22
51	0.19
52	0.16
53	0.14
54	0.16
55	0.12
56	0.14
57	0.13
58	0.14
59	0.21
60	0.22
61	0.28
62	0.26
63	0.3
64	0.31
65	0.37
66	0.41
67	0.34
68	0.37
69	0.33
70	0.37
71	0.33
72	0.29
73	0.23
74	0.19
75	0.2
76	0.19
77	0.22
78	0.17
79	0.17
80	0.17
81	0.17
82	0.21
83	0.25
84	0.28
85	0.24
86	0.27
87	0.28
88	0.3
89	0.34
90	0.34
91	0.34
92	0.3
93	0.31
94	0.33
95	0.33
96	0.37
97	0.36
98	0.41
99	0.44
100	0.45
101	0.47
102	0.49
103	0.49
104	0.51
105	0.56
106	0.56
107	0.52
108	0.59
109	0.6
110	0.58
111	0.58
112	0.52
113	0.5
114	0.44
115	0.42
116	0.42
117	0.43
118	0.46
119	0.54
120	0.62
121	0.62
122	0.67
123	0.7
124	0.66
125	0.64
126	0.61
127	0.61
128	0.54
129	0.5
130	0.43
131	0.38
132	0.37
133	0.34
134	0.31
135	0.23
136	0.2
137	0.17
138	0.18
139	0.21
140	0.19
141	0.19
142	0.18
143	0.18
144	0.22
145	0.27
146	0.25
147	0.23
148	0.22
149	0.21
150	0.22
151	0.26
152	0.27
153	0.24
154	0.24
155	0.24
156	0.3
157	0.29
158	0.27
159	0.23
160	0.24
161	0.23
162	0.24
163	0.24
164	0.18
165	0.17
166	0.17
167	0.15
168	0.13
169	0.14
170	0.15
171	0.17
172	0.2
173	0.23
174	0.27
175	0.34
176	0.41
177	0.45
178	0.51
179	0.54
180	0.59
181	0.61
182	0.61
183	0.57
184	0.54
185	0.51
186	0.44
187	0.39
188	0.33
189	0.28
190	0.25
191	0.22
192	0.17
193	0.14
194	0.14
195	0.12
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.06
205	0.07
206	0.09
207	0.12
208	0.13
209	0.15
210	0.17
211	0.23
212	0.29
213	0.31
214	0.3
215	0.34
216	0.38
217	0.42
218	0.51
219	0.56
220	0.59
221	0.63
222	0.69
223	0.69
224	0.68
225	0.65
226	0.6
227	0.59
228	0.56
229	0.6
230	0.61
231	0.63
232	0.69
233	0.74
234	0.79
235	0.78
236	0.8
237	0.81
238	0.83
239	0.8
240	0.77
241	0.77
242	0.72
243	0.72
244	0.68
245	0.58
246	0.51
247	0.5
248	0.45
249	0.4
250	0.37
251	0.32
252	0.3
253	0.3
254	0.37
255	0.33
256	0.34
257	0.36
258	0.4
259	0.46
260	0.55
261	0.63
262	0.66
263	0.73
264	0.75
265	0.8
266	0.78
267	0.75
268	0.75
269	0.73
270	0.72
271	0.69
272	0.67
273	0.67
274	0.65
275	0.63
276	0.62
277	0.6
278	0.6
279	0.6
280	0.65
281	0.62
282	0.69
283	0.71
284	0.71
285	0.71
286	0.67
287	0.63
288	0.63
289	0.62
290	0.6
291	0.64
292	0.66
293	0.63
294	0.63
295	0.64
296	0.59
297	0.55
298	0.54
299	0.52
300	0.46
301	0.51
302	0.52
303	0.52
304	0.49
305	0.48
306	0.44
307	0.35
308	0.32
309	0.24
310	0.18
311	0.14
312	0.16
313	0.15
314	0.13
315	0.14
316	0.13
317	0.14
318	0.13
319	0.14
320	0.15
321	0.19
322	0.19
323	0.19
324	0.23
325	0.24
326	0.25
327	0.28
328	0.28
329	0.26
330	0.29
331	0.36
332	0.35
333	0.35
334	0.35
335	0.32
336	0.29
337	0.26
338	0.23
339	0.17
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.14
347	0.16
348	0.15
349	0.16
350	0.22
351	0.25
352	0.27
353	0.3
354	0.31
355	0.33
356	0.39
357	0.38
358	0.38
359	0.42
360	0.45
361	0.44
362	0.46
363	0.44
364	0.4
365	0.39
366	0.33
367	0.27
368	0.25
369	0.28
370	0.23
371	0.19
372	0.17
373	0.18
374	0.2
375	0.19
376	0.14
377	0.1
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.16
383	0.17
384	0.18
385	0.19
386	0.2
387	0.23
388	0.24
389	0.27
390	0.24
391	0.24
392	0.25
393	0.24
394	0.24
395	0.25
396	0.31
397	0.28
398	0.28
399	0.35
400	0.4
401	0.48
402	0.57
403	0.64
404	0.67
405	0.76
406	0.83
407	0.86
408	0.89
409	0.91
410	0.91
411	0.89
412	0.86
413	0.83
414	0.77
415	0.74
416	0.65
417	0.61
418	0.54
419	0.46
420	0.43
421	0.39
422	0.36
423	0.3
424	0.29
425	0.23
426	0.21
427	0.21
428	0.19
429	0.18
430	0.18
431	0.17
432	0.16
433	0.17
434	0.15
435	0.15
436	0.12
437	0.1
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.08
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.11
451	0.11
452	0.12
453	0.14
454	0.13
455	0.13
456	0.12
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.05
462	0.07
463	0.08
464	0.09
465	0.12
466	0.13
467	0.12
468	0.15
469	0.19
470	0.22
471	0.22
472	0.22
473	0.19
474	0.21
475	0.2
476	0.17
477	0.13
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.05
483	0.05
484	0.04
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.12
495	0.13
496	0.16
497	0.22
498	0.21
499	0.24
500	0.26
501	0.28
502	0.27
503	0.28
504	0.29
505	0.26
506	0.28
507	0.25
508	0.24
509	0.25
510	0.25
511	0.23
512	0.19
513	0.16
514	0.1
515	0.09
516	0.07
517	0.04
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.11
525	0.12
526	0.14
527	0.16
528	0.16
529	0.16
530	0.2
531	0.23
532	0.24
533	0.28
534	0.26
535	0.24
536	0.26
537	0.27
538	0.23
539	0.2
540	0.15
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.09
545	0.08
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.06
551	0.05
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.07
558	0.07
559	0.08
560	0.11
561	0.15
562	0.18
563	0.18
564	0.2
565	0.21
566	0.22
567	0.23
568	0.2
569	0.18
570	0.14
571	0.14
572	0.14
573	0.17
574	0.18
575	0.17
576	0.21
577	0.23
578	0.27
579	0.33
580	0.37
581	0.35
582	0.38
583	0.42
584	0.38
585	0.38
586	0.34
587	0.29
588	0.28
589	0.24
590	0.2
591	0.16
592	0.18
593	0.16
594	0.17
595	0.19
596	0.15
597	0.18
598	0.19
599	0.19
600	0.16
601	0.15
602	0.14
603	0.11
604	0.15
605	0.12
606	0.12
607	0.12
608	0.13
609	0.16
610	0.16
611	0.16
612	0.14
613	0.17
614	0.17
615	0.17
616	0.17
617	0.16
618	0.18
619	0.18
620	0.18
621	0.16
622	0.16
623	0.17
624	0.19
625	0.23
626	0.29
627	0.34
628	0.35
629	0.34
630	0.35
631	0.37
632	0.36
633	0.34
634	0.27
635	0.24
636	0.27
637	0.3
638	0.28
639	0.25
640	0.24
641	0.24
642	0.25
643	0.24
644	0.2
645	0.19
646	0.19
647	0.22
648	0.22
649	0.24
650	0.27
651	0.32
652	0.35
653	0.36
654	0.37
655	0.45
656	0.5
657	0.52
658	0.56
659	0.52
660	0.54
661	0.54
662	0.52
663	0.44
664	0.41
665	0.37
666	0.32
667	0.3
668	0.26
669	0.25
670	0.26
671	0.25
672	0.25
673	0.21
674	0.15
675	0.14
676	0.16
677	0.16
678	0.15
679	0.14
680	0.1
681	0.1
682	0.1
683	0.09
684	0.07
685	0.07
686	0.07
687	0.09
688	0.1
689	0.13
690	0.13
691	0.14
692	0.15
693	0.16
694	0.17
695	0.18
696	0.18
697	0.16
698	0.16
699	0.16
700	0.14
701	0.13
702	0.13
703	0.1
704	0.1
705	0.1
706	0.09
707	0.08
708	0.11
709	0.1
710	0.1
711	0.11
712	0.09
713	0.11
714	0.14
715	0.16
716	0.17
717	0.18
718	0.18
719	0.17
720	0.17
721	0.15
722	0.12
723	0.11
724	0.12
725	0.11
726	0.11
727	0.15
728	0.18
729	0.23
730	0.25
731	0.33
732	0.33
733	0.4
734	0.43
735	0.44
736	0.45
737	0.45
738	0.48
739	0.48
740	0.47
741	0.45
742	0.42
743	0.38
744	0.37
745	0.36
746	0.34
747	0.31
748	0.29
749	0.25
750	0.25
751	0.25
752	0.23
753	0.21
754	0.19
755	0.21
756	0.22
757	0.22
758	0.25
759	0.25
760	0.24
761	0.25
762	0.22
763	0.18
764	0.22
765	0.22
766	0.2
767	0.26
768	0.29
769	0.31
770	0.33
771	0.37
772	0.35
773	0.38
774	0.45
775	0.4
776	0.38
777	0.4
778	0.39
779	0.34
780	0.36
781	0.32
782	0.26
783	0.26
784	0.24
785	0.22
786	0.24
787	0.24
788	0.21
789	0.22
790	0.2
791	0.23
792	0.24
793	0.22
794	0.2
795	0.21
796	0.19
797	0.22
798	0.25
799	0.24
800	0.22
801	0.26
802	0.26
803	0.23
804	0.23
805	0.2
806	0.15
807	0.13
808	0.13
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.07
813	0.08
814	0.08
815	0.08
816	0.08
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.07
821	0.06
822	0.07
823	0.11
824	0.1
825	0.12
826	0.13
827	0.13
828	0.14
829	0.16
830	0.17
831	0.16
832	0.19
833	0.2
834	0.22
835	0.24
836	0.24
837	0.25
838	0.25
839	0.22
840	0.21
841	0.2
842	0.17
843	0.16
844	0.16
845	0.14
846	0.17
847	0.17
848	0.19
849	0.21
850	0.25
851	0.27
852	0.36
853	0.36
854	0.38
855	0.45
856	0.44
857	0.4
858	0.37
859	0.35
860	0.25
861	0.23
862	0.17
863	0.09
864	0.07
865	0.05
866	0.05
867	0.04
868	0.05
869	0.05
870	0.06
871	0.08
872	0.12
873	0.15
874	0.2
875	0.24
876	0.27
877	0.31
878	0.32
879	0.32
880	0.33
881	0.34
882	0.31
883	0.28
884	0.26
885	0.25
886	0.27
887	0.3
888	0.26
889	0.25
890	0.28
891	0.28
892	0.28
893	0.31
894	0.29
895	0.32
896	0.34
897	0.36
898	0.37
899	0.36
900	0.36
901	0.32
902	0.31
903	0.23
904	0.21
905	0.18
906	0.12
907	0.12
908	0.13
909	0.11
910	0.1
911	0.1
912	0.1
913	0.09
914	0.09
915	0.11
916	0.09
917	0.11
918	0.1
919	0.12
920	0.11
921	0.11
922	0.11
923	0.11
924	0.13
925	0.12
926	0.12
927	0.11
928	0.12
929	0.11
930	0.1
931	0.07
932	0.06
933	0.08
934	0.08
935	0.07
936	0.07
937	0.07
938	0.06
939	0.06
940	0.06
941	0.04
942	0.04
943	0.04
944	0.04
945	0.04
946	0.05
947	0.05
948	0.06
949	0.07
950	0.08
951	0.08
952	0.09
953	0.09
954	0.08
955	0.08
956	0.09
957	0.08
958	0.07
959	0.08
960	0.07
961	0.07
962	0.07
963	0.07
964	0.06
965	0.07
966	0.07
967	0.07
968	0.1
969	0.11
970	0.13
971	0.17
972	0.18
973	0.2
974	0.21
975	0.21
976	0.19
977	0.19
978	0.17
979	0.17
980	0.21
981	0.23
982	0.25
983	0.25
984	0.25
985	0.24
986	0.24
987	0.22
988	0.2
989	0.16
990	0.16
991	0.19
992	0.21
993	0.23
994	0.31
995	0.36
996	0.43
997	0.5
998	0.51
999	0.53
1000	0.58
1001	0.61
1002	0.57
1003	0.54
1004	0.5
1005	0.43
1006	0.45
1007	0.4
1008	0.35
1009	0.3
1010	0.27
1011	0.23
1012	0.18
1013	0.17
1014	0.13
1015	0.19
1016	0.22
1017	0.27
1018	0.3
1019	0.33
1020	0.37
1021	0.38
1022	0.38
1023	0.31
1024	0.26
1025	0.23
1026	0.25
1027	0.26
1028	0.28
1029	0.27
1030	0.27
1031	0.29
1032	0.35
1033	0.41
1034	0.43
1035	0.47
1036	0.46
1037	0.53
1038	0.54
1039	0.55
1040	0.52
1041	0.47
1042	0.46
1043	0.46
1044	0.47
1045	0.4
1046	0.39
1047	0.37
1048	0.36
1049	0.34
1050	0.27
1051	0.22
1052	0.19
1053	0.19
1054	0.21
1055	0.21
1056	0.18
1057	0.18
1058	0.18
1059	0.17
1060	0.17
1061	0.16
1062	0.15
1063	0.17
1064	0.17
1065	0.17
1066	0.17
1067	0.15
1068	0.13
1069	0.13
1070	0.13
1071	0.11
1072	0.11
1073	0.12
1074	0.14
1075	0.16
1076	0.16
1077	0.16
1078	0.19
1079	0.21
1080	0.22
1081	0.24
1082	0.23
1083	0.24
1084	0.25
1085	0.23
1086	0.21
1087	0.22
1088	0.24
1089	0.28
1090	0.3
1091	0.33
1092	0.39
1093	0.43
1094	0.41
1095	0.39
1096	0.36
1097	0.31
1098	0.29
1099	0.23
1100	0.19
1101	0.15
1102	0.16
1103	0.17
1104	0.17
1105	0.16
1106	0.16
1107	0.16
1108	0.13
1109	0.13
1110	0.14
1111	0.14
1112	0.15
1113	0.16
1114	0.16
1115	0.18
1116	0.21
1117	0.21
1118	0.21
1119	0.19
1120	0.17
1121	0.18
1122	0.24
1123	0.24
1124	0.23
1125	0.21
1126	0.25
1127	0.27
1128	0.27
1129	0.26
1130	0.23
1131	0.23
1132	0.21
1133	0.21
1134	0.17
1135	0.2
1136	0.2
1137	0.23
1138	0.19
1139	0.21
1140	0.22
1141	0.26
1142	0.29
1143	0.25
1144	0.27
1145	0.27
1146	0.36
1147	0.36
1148	0.43
1149	0.45
1150	0.42
1151	0.44
1152	0.45
1153	0.43
1154	0.36
1155	0.36
1156	0.34
1157	0.32
1158	0.36
1159	0.32
1160	0.33
1161	0.32
1162	0.29
1163	0.25
1164	0.24
1165	0.2
1166	0.18
1167	0.22
1168	0.22
1169	0.28
1170	0.31
1171	0.41
1172	0.47
1173	0.51
1174	0.54
1175	0.55
1176	0.58
1177	0.62
1178	0.64
1179	0.59
1180	0.54
1181	0.51
1182	0.48
1183	0.47
1184	0.45
1185	0.38
1186	0.38
1187	0.41
1188	0.43
1189	0.45
1190	0.44
1191	0.41
1192	0.41
1193	0.42
1194	0.39
1195	0.36
1196	0.33
1197	0.3
1198	0.31
1199	0.35
1200	0.3
1201	0.28
1202	0.28
1203	0.28
1204	0.3
1205	0.31
1206	0.35
1207	0.39
1208	0.47
1209	0.51
1210	0.53
1211	0.52
1212	0.52
1213	0.51
1214	0.45
1215	0.39
1216	0.32
1217	0.28
1218	0.25
1219	0.21
1220	0.17
1221	0.23
1222	0.21
1223	0.2
1224	0.2
1225	0.19
1226	0.21
1227	0.26
1228	0.33
1229	0.26
1230	0.28
1231	0.31
1232	0.32
1233	0.31
1234	0.31
1235	0.26
1236	0.2
1237	0.23
1238	0.22
1239	0.17
1240	0.16
1241	0.16
1242	0.17
1243	0.17
1244	0.15
1245	0.11
1246	0.14
1247	0.15
1248	0.15
1249	0.15
1250	0.15
1251	0.18
1252	0.2
1253	0.24
1254	0.26
1255	0.29
1256	0.32
1257	0.33
1258	0.34
1259	0.42
1260	0.44
1261	0.44
1262	0.44
1263	0.51
1264	0.56
1265	0.64
1266	0.68
1267	0.67
1268	0.68
1269	0.7
1270	0.67
1271	0.59
1272	0.52
1273	0.44
1274	0.41
1275	0.32
1276	0.31
1277	0.25
1278	0.25
1279	0.25
1280	0.25
1281	0.3
1282	0.31
1283	0.31
1284	0.29
1285	0.33
1286	0.33
1287	0.35
1288	0.4
1289	0.36
1290	0.33
1291	0.37
1292	0.36
1293	0.33
1294	0.36
1295	0.36
1296	0.29
1297	0.29
1298	0.28
1299	0.29
1300	0.28
1301	0.27
1302	0.27
1303	0.3
1304	0.34
1305	0.36
1306	0.36

A7EM90

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer