Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F0IRP6

Protein Details
Accession A0A0F0IRP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-64QPSNGASKPAKPPKQPKSKDAPPAAHydrophilic
74-93SPAELKKKAKAEKAARRAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-140SKPAKPPKQPKSKDAPPAAGGAPGEEKLSPAELKKKAKAEKAARRAKERAEREASGGAGAGPGPNAAPPKKGSTGGGAGGKEAPGQPYKSQRHRR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000649  IF-2B-related  
IPR042529  IF_2B-like_C  
IPR037171  NagB/RpiA_transferase-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01008  IF-2B  
Amino Acid Sequences MANPVDPAQTSPPSTSPNPAPATQQSTDMSSQQAPSQPPQPSNGASKPAKPPKQPKSKDAPPAAGGAPGEEKLSPAELKKKAKAEKAARRAKERAEREASGGAGAGPGPNAAPPKKGSTGGGAGGKEAPGQPYKSQRHRRGSATQASATEQKKKQEDKNVAVFGHLYGQPRRTTIAGAGKEVHPAVLALGLQMRDYVVCGSSARCVATLLAFKRVIEAYTTPLGTSLSRHLTTHLSHQITYLSTCRPLSISQGNAIRALKLAISSIDPSVPEASAKATLSDFIDNFIREKITVADQVIATSAAEKIQDGDVIVTFAGSSIVKQTLLTAYKQGKKFRVSIIDSRPLFEGKNLARTLANAGLEVQYSLVNGISHAIKDATKVFLGAHAMTSNGRLYSRVGTALVAMSAKERAGGVEVPVIVCCETVKFTDRVALDSIVVNEIADADELVPSHPLKQVTGLPDPGDEADTKKGDAKKGGNKAAANAPPAESTPLPEGASPLTNWKETPNLQLLNIMYDVTPAEYVDMVVTEMGSLPPSAVPIVHRMSTNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.37
4 0.41
5 0.43
6 0.41
7 0.44
8 0.44
9 0.49
10 0.44
11 0.44
12 0.37
13 0.37
14 0.37
15 0.33
16 0.3
17 0.26
18 0.26
19 0.25
20 0.3
21 0.29
22 0.31
23 0.37
24 0.39
25 0.38
26 0.41
27 0.42
28 0.4
29 0.44
30 0.45
31 0.46
32 0.43
33 0.48
34 0.55
35 0.61
36 0.65
37 0.68
38 0.74
39 0.76
40 0.84
41 0.84
42 0.83
43 0.82
44 0.83
45 0.83
46 0.79
47 0.74
48 0.64
49 0.62
50 0.53
51 0.45
52 0.35
53 0.27
54 0.22
55 0.17
56 0.16
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.14
61 0.14
62 0.17
63 0.25
64 0.32
65 0.39
66 0.45
67 0.53
68 0.57
69 0.63
70 0.69
71 0.71
72 0.74
73 0.78
74 0.81
75 0.79
76 0.79
77 0.77
78 0.75
79 0.75
80 0.69
81 0.68
82 0.65
83 0.6
84 0.56
85 0.53
86 0.44
87 0.34
88 0.28
89 0.19
90 0.12
91 0.1
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.07
97 0.12
98 0.13
99 0.16
100 0.18
101 0.23
102 0.26
103 0.28
104 0.27
105 0.27
106 0.28
107 0.29
108 0.31
109 0.25
110 0.23
111 0.22
112 0.21
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.15
117 0.18
118 0.21
119 0.3
120 0.39
121 0.49
122 0.59
123 0.65
124 0.72
125 0.75
126 0.77
127 0.75
128 0.75
129 0.73
130 0.67
131 0.59
132 0.5
133 0.48
134 0.48
135 0.43
136 0.43
137 0.38
138 0.4
139 0.45
140 0.51
141 0.55
142 0.58
143 0.64
144 0.62
145 0.66
146 0.64
147 0.56
148 0.5
149 0.43
150 0.33
151 0.29
152 0.24
153 0.2
154 0.18
155 0.22
156 0.22
157 0.23
158 0.24
159 0.2
160 0.19
161 0.21
162 0.27
163 0.24
164 0.25
165 0.26
166 0.25
167 0.26
168 0.25
169 0.19
170 0.11
171 0.1
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.1
195 0.15
196 0.14
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.19
201 0.19
202 0.17
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.14
207 0.14
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.15
217 0.16
218 0.18
219 0.19
220 0.24
221 0.28
222 0.25
223 0.24
224 0.24
225 0.24
226 0.21
227 0.22
228 0.17
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.19
239 0.22
240 0.22
241 0.23
242 0.23
243 0.18
244 0.15
245 0.14
246 0.1
247 0.07
248 0.07
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.1
312 0.12
313 0.13
314 0.17
315 0.23
316 0.29
317 0.34
318 0.39
319 0.4
320 0.42
321 0.44
322 0.43
323 0.45
324 0.43
325 0.46
326 0.47
327 0.51
328 0.48
329 0.46
330 0.42
331 0.35
332 0.31
333 0.24
334 0.24
335 0.16
336 0.23
337 0.22
338 0.22
339 0.21
340 0.22
341 0.24
342 0.2
343 0.19
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.09
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.11
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.09
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.11
381 0.13
382 0.14
383 0.13
384 0.13
385 0.12
386 0.13
387 0.12
388 0.11
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.06
409 0.08
410 0.09
411 0.13
412 0.14
413 0.14
414 0.2
415 0.2
416 0.21
417 0.22
418 0.21
419 0.18
420 0.18
421 0.18
422 0.14
423 0.13
424 0.11
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.14
438 0.14
439 0.14
440 0.18
441 0.22
442 0.25
443 0.29
444 0.29
445 0.26
446 0.25
447 0.26
448 0.23
449 0.2
450 0.16
451 0.14
452 0.18
453 0.18
454 0.19
455 0.24
456 0.27
457 0.3
458 0.36
459 0.42
460 0.46
461 0.54
462 0.6
463 0.6
464 0.57
465 0.56
466 0.58
467 0.53
468 0.46
469 0.38
470 0.32
471 0.28
472 0.28
473 0.28
474 0.2
475 0.2
476 0.2
477 0.21
478 0.21
479 0.2
480 0.2
481 0.18
482 0.2
483 0.17
484 0.22
485 0.23
486 0.23
487 0.24
488 0.25
489 0.29
490 0.29
491 0.36
492 0.36
493 0.35
494 0.34
495 0.38
496 0.35
497 0.31
498 0.3
499 0.23
500 0.15
501 0.14
502 0.14
503 0.11
504 0.11
505 0.08
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.09
523 0.09
524 0.11
525 0.16
526 0.2
527 0.22