Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F0IME9

Protein Details
Accession A0A0F0IME9    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAPDKKDKKRKAAAATAAADHydrophilic
36-55STNASPKPILKKNKGNDAEKHydrophilic
93-114KTKVETEKKLSNKKTKKADGTAHydrophilic
195-221VPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEBasic
309-336WKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREBasic
406-432KKVADDTPKKAKKDKKKGAQSTDQGTSHydrophilic
445-465ASPATKAGAKAKKAKKTKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-75KKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVEAKPTESTNASPKPILKKNKGNDAEKPAAKLKVNGEPTRQVKPRKR
100-134KKLSNKKTKKADGTAAPAPKEKTTKAKASTKAKKP
200-214DSKKAKRKILKKQKE
311-355GANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREQWSERIDREQKRRLAKAEK
412-425TPKKAKKDKKKGAQ
433-465KEQPKKEIPAATASPATKAGAKAKKAKKTKAKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKKDKKRKAAAATAAADSPAKKTKKVEAKPTESTNASPKPILKKNKGNDAEKPAAKLKVNGEPTRQVKPRKRAADFLSDNDDSESENAPKTKVETEKKLSNKKTKKADGTAAPAPKEKTTKAKASTKAKKPEPVAEESDDGEMDDGESAASGASASEDEEEDDRTAALIRGFESSGDEDESGDEGFNPDQPVPKIPDSKKAKRKILKKQKENKQEAEEPGTVYVGRIPHGFYEHQMKAYFSQFGEISRLRLSRNRITGRSKHYAFIEFTSTSVAKVVAGTMDNYLMYGHILKCKYVPQEQLHPELWKGANRRFKRTPWNRIEKKRLDKAKTREQWSERIDREQKRRLAKAEKLKALGYELELPQLKSVDEVPIQQEESKSIEASETVFDEPVKAIEAPKEEEKKVADDTPKKAKKDKKKGAQSTDQGTSKEQPKKEIPAATASPATKAGAKAKKAKKTKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.74
3 0.66
4 0.56
5 0.47
6 0.39
7 0.3
8 0.27
9 0.27
10 0.26
11 0.28
12 0.32
13 0.42
14 0.51
15 0.59
16 0.65
17 0.67
18 0.73
19 0.76
20 0.77
21 0.73
22 0.65
23 0.59
24 0.57
25 0.51
26 0.46
27 0.42
28 0.42
29 0.46
30 0.53
31 0.6
32 0.61
33 0.65
34 0.7
35 0.78
36 0.81
37 0.77
38 0.76
39 0.75
40 0.74
41 0.66
42 0.63
43 0.57
44 0.54
45 0.5
46 0.47
47 0.42
48 0.42
49 0.49
50 0.48
51 0.48
52 0.52
53 0.54
54 0.58
55 0.61
56 0.62
57 0.64
58 0.69
59 0.74
60 0.75
61 0.76
62 0.75
63 0.73
64 0.73
65 0.67
66 0.61
67 0.59
68 0.49
69 0.45
70 0.38
71 0.32
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.14
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.19
81 0.24
82 0.3
83 0.36
84 0.42
85 0.48
86 0.56
87 0.64
88 0.71
89 0.74
90 0.76
91 0.78
92 0.78
93 0.81
94 0.82
95 0.81
96 0.77
97 0.75
98 0.7
99 0.67
100 0.66
101 0.6
102 0.52
103 0.48
104 0.43
105 0.39
106 0.37
107 0.33
108 0.36
109 0.38
110 0.44
111 0.48
112 0.55
113 0.6
114 0.67
115 0.74
116 0.74
117 0.78
118 0.75
119 0.75
120 0.7
121 0.7
122 0.63
123 0.58
124 0.53
125 0.46
126 0.42
127 0.36
128 0.33
129 0.24
130 0.19
131 0.14
132 0.09
133 0.07
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.02
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.06
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.11
180 0.11
181 0.14
182 0.18
183 0.21
184 0.28
185 0.28
186 0.38
187 0.44
188 0.53
189 0.6
190 0.64
191 0.7
192 0.69
193 0.78
194 0.79
195 0.82
196 0.83
197 0.84
198 0.86
199 0.86
200 0.9
201 0.87
202 0.81
203 0.75
204 0.7
205 0.62
206 0.57
207 0.47
208 0.37
209 0.3
210 0.25
211 0.18
212 0.13
213 0.12
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.17
223 0.17
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.2
229 0.2
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.15
235 0.14
236 0.14
237 0.15
238 0.16
239 0.16
240 0.2
241 0.25
242 0.27
243 0.35
244 0.38
245 0.41
246 0.47
247 0.52
248 0.55
249 0.57
250 0.52
251 0.47
252 0.44
253 0.42
254 0.36
255 0.31
256 0.28
257 0.2
258 0.19
259 0.19
260 0.17
261 0.14
262 0.13
263 0.11
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.07
278 0.07
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.18
284 0.22
285 0.25
286 0.32
287 0.31
288 0.4
289 0.43
290 0.47
291 0.44
292 0.41
293 0.36
294 0.33
295 0.31
296 0.26
297 0.28
298 0.3
299 0.38
300 0.4
301 0.49
302 0.5
303 0.54
304 0.61
305 0.67
306 0.7
307 0.71
308 0.79
309 0.8
310 0.85
311 0.89
312 0.87
313 0.87
314 0.85
315 0.84
316 0.8
317 0.8
318 0.79
319 0.79
320 0.78
321 0.74
322 0.74
323 0.68
324 0.69
325 0.66
326 0.66
327 0.58
328 0.59
329 0.62
330 0.61
331 0.67
332 0.67
333 0.68
334 0.67
335 0.7
336 0.68
337 0.68
338 0.68
339 0.7
340 0.71
341 0.69
342 0.63
343 0.59
344 0.52
345 0.45
346 0.37
347 0.29
348 0.24
349 0.19
350 0.22
351 0.23
352 0.22
353 0.21
354 0.2
355 0.18
356 0.14
357 0.15
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.17
362 0.18
363 0.2
364 0.21
365 0.2
366 0.18
367 0.2
368 0.19
369 0.17
370 0.15
371 0.14
372 0.13
373 0.14
374 0.13
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.1
384 0.11
385 0.14
386 0.18
387 0.22
388 0.3
389 0.35
390 0.33
391 0.36
392 0.37
393 0.36
394 0.37
395 0.39
396 0.4
397 0.42
398 0.48
399 0.55
400 0.61
401 0.62
402 0.67
403 0.71
404 0.73
405 0.77
406 0.81
407 0.81
408 0.85
409 0.91
410 0.91
411 0.91
412 0.87
413 0.82
414 0.8
415 0.73
416 0.63
417 0.57
418 0.55
419 0.54
420 0.55
421 0.5
422 0.49
423 0.52
424 0.59
425 0.62
426 0.6
427 0.53
428 0.53
429 0.53
430 0.49
431 0.48
432 0.4
433 0.35
434 0.31
435 0.3
436 0.25
437 0.26
438 0.32
439 0.35
440 0.41
441 0.5
442 0.58
443 0.67
444 0.73
445 0.8