Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F0IB35

Protein Details
Accession A0A0F0IB35    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-243YIKGSSDKAKREKARKEKNILEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-68KAIDKPAPRVGKRDAPKEAPSQPRA
95-114REKPTDEREGGARRGGRPRG
227-237KAKREKARKEK
250-281PRGSSGPRGRGGRGGRGARGGRGNGPRAERGE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, extr 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKNLYELLVITSSNVLARFAVAGNDPELDPSRPPAPPTKAIDKPAPRVGKRDAPKEAPSQPRAGQNSRRGNFSGNEAAFRDRNAGRNQNREKPTDEREGGARRGGRPRGDRQSRTGQTDTGKKVTQGWGGQSGEKELDDERAGEKIAQADENEPQTPAEEAEPADKAKSYNDYLAEKAAAGDFSAKPVRAANEGTKADSKWANAKEFKREEDENYIKGSSDKAKREKARKEKNILEVDMRFVEAPRGSSGPRGRGGRGGRGARGGRGNGPRAERGERTERSAPVTVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.1
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.09
12 0.11
13 0.1
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.17
20 0.17
21 0.16
22 0.19
23 0.22
24 0.22
25 0.25
26 0.31
27 0.35
28 0.41
29 0.47
30 0.51
31 0.53
32 0.57
33 0.63
34 0.61
35 0.61
36 0.62
37 0.65
38 0.57
39 0.57
40 0.59
41 0.59
42 0.59
43 0.6
44 0.58
45 0.55
46 0.58
47 0.6
48 0.62
49 0.61
50 0.57
51 0.54
52 0.51
53 0.53
54 0.55
55 0.55
56 0.55
57 0.56
58 0.64
59 0.6
60 0.6
61 0.54
62 0.51
63 0.44
64 0.41
65 0.39
66 0.29
67 0.3
68 0.28
69 0.3
70 0.27
71 0.26
72 0.26
73 0.19
74 0.24
75 0.29
76 0.37
77 0.4
78 0.5
79 0.56
80 0.6
81 0.63
82 0.6
83 0.58
84 0.54
85 0.54
86 0.52
87 0.46
88 0.38
89 0.4
90 0.42
91 0.38
92 0.36
93 0.33
94 0.28
95 0.34
96 0.37
97 0.38
98 0.39
99 0.46
100 0.53
101 0.59
102 0.58
103 0.56
104 0.63
105 0.61
106 0.61
107 0.54
108 0.46
109 0.41
110 0.45
111 0.43
112 0.36
113 0.33
114 0.27
115 0.29
116 0.28
117 0.28
118 0.22
119 0.21
120 0.22
121 0.23
122 0.23
123 0.21
124 0.19
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.08
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.12
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.17
164 0.18
165 0.18
166 0.19
167 0.18
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.07
172 0.06
173 0.08
174 0.07
175 0.1
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.15
182 0.18
183 0.18
184 0.23
185 0.24
186 0.26
187 0.26
188 0.25
189 0.26
190 0.25
191 0.23
192 0.23
193 0.26
194 0.3
195 0.35
196 0.38
197 0.44
198 0.46
199 0.47
200 0.45
201 0.43
202 0.41
203 0.44
204 0.45
205 0.37
206 0.36
207 0.34
208 0.28
209 0.26
210 0.25
211 0.24
212 0.28
213 0.35
214 0.4
215 0.49
216 0.58
217 0.67
218 0.75
219 0.78
220 0.82
221 0.83
222 0.85
223 0.83
224 0.83
225 0.8
226 0.72
227 0.66
228 0.55
229 0.49
230 0.41
231 0.34
232 0.25
233 0.18
234 0.2
235 0.15
236 0.16
237 0.15
238 0.17
239 0.17
240 0.24
241 0.29
242 0.3
243 0.36
244 0.37
245 0.36
246 0.42
247 0.45
248 0.46
249 0.5
250 0.48
251 0.43
252 0.48
253 0.48
254 0.45
255 0.47
256 0.4
257 0.39
258 0.43
259 0.46
260 0.43
261 0.46
262 0.46
263 0.46
264 0.5
265 0.45
266 0.45
267 0.49
268 0.47
269 0.5
270 0.51
271 0.49
272 0.48
273 0.5
274 0.43
275 0.39
276 0.4
277 0.37
278 0.35
279 0.37
280 0.33
281 0.32
282 0.31