Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F0IJH5

Protein Details
Accession A0A0F0IJH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-152NIDFKRNPTTPRKRRRRTIPNLKRGPSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-148TTPRKRRRRTIPNLKR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016874  F:ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MQRRRGCIVYGFVFSTHLYIYSSYAIEAKEHPQNHLIETASPRTGSMIIWDTGEYEILPYQPEQTQPETDDSRSDISSDTSISTVDSKTHSEKLHQAFHNRKIRLRLHGTKLPQNYTIILRLDKNIDFKRNPTTPRKRRRRTIPNLKRGPSTSSDSSPPPSKSDSTGTPAPGVSDQTLSASETPGREHSDEEDDIDEHIRANNAYLGAVNSIGSVHQRRWFLTLDRVNSGFVAEAGSGPGRKRWVRKWDPGTGRLLGFEPFYVRGPEVESSVVTGRLGRDVLEDEGVEGFVPRRGWRAVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.23
3 0.16
4 0.13
5 0.11
6 0.11
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.14
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.2
16 0.25
17 0.26
18 0.28
19 0.31
20 0.32
21 0.32
22 0.33
23 0.29
24 0.26
25 0.29
26 0.3
27 0.26
28 0.25
29 0.23
30 0.22
31 0.21
32 0.17
33 0.17
34 0.16
35 0.15
36 0.16
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.15
41 0.1
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.11
48 0.12
49 0.15
50 0.18
51 0.2
52 0.22
53 0.23
54 0.28
55 0.29
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.23
60 0.21
61 0.2
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.14
75 0.17
76 0.22
77 0.22
78 0.24
79 0.31
80 0.35
81 0.42
82 0.42
83 0.47
84 0.49
85 0.58
86 0.64
87 0.58
88 0.57
89 0.56
90 0.57
91 0.57
92 0.58
93 0.57
94 0.55
95 0.59
96 0.59
97 0.58
98 0.57
99 0.52
100 0.44
101 0.37
102 0.32
103 0.28
104 0.27
105 0.22
106 0.19
107 0.17
108 0.17
109 0.19
110 0.19
111 0.24
112 0.24
113 0.28
114 0.27
115 0.29
116 0.35
117 0.37
118 0.41
119 0.45
120 0.53
121 0.58
122 0.68
123 0.77
124 0.78
125 0.83
126 0.88
127 0.88
128 0.88
129 0.89
130 0.89
131 0.88
132 0.88
133 0.81
134 0.72
135 0.62
136 0.55
137 0.47
138 0.41
139 0.33
140 0.27
141 0.27
142 0.26
143 0.27
144 0.28
145 0.26
146 0.22
147 0.22
148 0.21
149 0.22
150 0.24
151 0.23
152 0.23
153 0.25
154 0.23
155 0.21
156 0.2
157 0.18
158 0.16
159 0.15
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.16
176 0.19
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.12
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.07
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.09
201 0.1
202 0.13
203 0.17
204 0.19
205 0.2
206 0.23
207 0.26
208 0.25
209 0.33
210 0.36
211 0.34
212 0.36
213 0.36
214 0.34
215 0.31
216 0.28
217 0.18
218 0.12
219 0.1
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.13
227 0.19
228 0.24
229 0.31
230 0.39
231 0.49
232 0.56
233 0.66
234 0.71
235 0.74
236 0.77
237 0.74
238 0.7
239 0.62
240 0.53
241 0.44
242 0.37
243 0.28
244 0.21
245 0.18
246 0.15
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.16
256 0.15
257 0.15
258 0.16
259 0.16
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.12
266 0.13
267 0.15
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.11
278 0.13
279 0.13
280 0.17
281 0.19