Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F0IFN1

Protein Details
Accession A0A0F0IFN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-104EAALKKEREKVKKLSNNEKVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-91R
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013258  Striatin_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0032991  C:protein-containing complex  
GO:0044877  F:protein-containing complex binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08232  Striatin  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MVGAGGYGGPGDGSSNGGQPQGTEYTLQGVMRFLQTEWHRHERDRNAWEIERAEMKSRIGKLEGDVRTSKRLHESLGKHVRLLEAALKKEREKVKKLSNNEKVEDTRDPKDIARESINALKSQRPKPPMELNEAELNDNQPDFRQENEREKSRLYLSKCSQEVTYHVIPASHPPPELSDPELPNHIYGNQQLSQQALEEAYHIQQQRQKQQQQQQQANHMMAREVSLQNHQPIVAQYSESSGIARQPNQFGLPPGSREALERKPLEPQQTPATAVDSRKQAPEHTIVDERTGAEKQAYEVYGAQGGVKEEIQPQQAEQQQQEDSDGWNFDEPSEKEPPTEPMPPHRPDVDAFPNANFVRPKSPSRSGSLSHRRKSSGARSKSEGSSDSIGGAAQKQDTNFKVRFALRGHLDVVRSVIFTGGGSPSEPEICTCSDDGTIKRWIIPATYGNFGSHNANTSNDLDITSYFTHRGHVGAVTALAACSPSRDFSNGGRALGDGWVFSGGQDASVRVWERGRIDPKATLDGHTDAVWGLCVLPGTTGSVFGDSCGHYGGPDRILLASGAADGQILIWAVSAPPQLSSPQAGNRRAGGSRRANSISSGSNFPSSPQPSMATSTPFHYTLIHKITRKDSPSPTCISPLSLAGVNFVVSFSDASIIVYDTRTGEEIVGMASLETYDGTPSTGVNSVVATTVGFDGSAGLDPSRISGEEEVVHGATGSSGVEGVIISGYEDRYIRLFDANSGQCTYTMLAHPSAIASLSLSPDGRELVSAGHDASLRFWNLEKRSCTQEITSHRLMRGEGVCSAVWSRDGRWVVSGGGDGLVKVFSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.15
5 0.15
6 0.14
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.19
13 0.21
14 0.21
15 0.17
16 0.16
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.14
21 0.2
22 0.24
23 0.32
24 0.38
25 0.46
26 0.48
27 0.52
28 0.61
29 0.62
30 0.68
31 0.66
32 0.64
33 0.62
34 0.61
35 0.6
36 0.52
37 0.47
38 0.43
39 0.39
40 0.38
41 0.34
42 0.34
43 0.36
44 0.37
45 0.37
46 0.33
47 0.32
48 0.31
49 0.38
50 0.37
51 0.36
52 0.39
53 0.38
54 0.43
55 0.43
56 0.43
57 0.41
58 0.4
59 0.4
60 0.43
61 0.44
62 0.49
63 0.58
64 0.55
65 0.48
66 0.48
67 0.44
68 0.36
69 0.34
70 0.31
71 0.26
72 0.31
73 0.36
74 0.38
75 0.39
76 0.46
77 0.53
78 0.54
79 0.55
80 0.6
81 0.65
82 0.7
83 0.77
84 0.81
85 0.81
86 0.8
87 0.75
88 0.72
89 0.64
90 0.61
91 0.6
92 0.54
93 0.48
94 0.44
95 0.43
96 0.38
97 0.43
98 0.41
99 0.37
100 0.36
101 0.34
102 0.34
103 0.39
104 0.39
105 0.35
106 0.34
107 0.37
108 0.41
109 0.47
110 0.51
111 0.5
112 0.52
113 0.56
114 0.64
115 0.62
116 0.62
117 0.57
118 0.53
119 0.53
120 0.5
121 0.45
122 0.35
123 0.32
124 0.25
125 0.22
126 0.18
127 0.12
128 0.16
129 0.16
130 0.18
131 0.25
132 0.29
133 0.39
134 0.46
135 0.51
136 0.49
137 0.49
138 0.51
139 0.49
140 0.5
141 0.44
142 0.47
143 0.46
144 0.52
145 0.52
146 0.49
147 0.44
148 0.39
149 0.37
150 0.34
151 0.31
152 0.24
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.26
157 0.26
158 0.21
159 0.19
160 0.18
161 0.22
162 0.25
163 0.26
164 0.25
165 0.28
166 0.28
167 0.29
168 0.31
169 0.28
170 0.25
171 0.24
172 0.2
173 0.16
174 0.17
175 0.2
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.17
182 0.15
183 0.11
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.21
192 0.28
193 0.36
194 0.45
195 0.52
196 0.56
197 0.65
198 0.69
199 0.76
200 0.77
201 0.73
202 0.7
203 0.68
204 0.61
205 0.52
206 0.44
207 0.35
208 0.26
209 0.23
210 0.19
211 0.16
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.22
216 0.22
217 0.2
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.15
222 0.12
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.14
230 0.16
231 0.2
232 0.2
233 0.22
234 0.23
235 0.24
236 0.25
237 0.22
238 0.24
239 0.22
240 0.21
241 0.21
242 0.21
243 0.19
244 0.21
245 0.24
246 0.24
247 0.3
248 0.29
249 0.28
250 0.34
251 0.38
252 0.42
253 0.38
254 0.37
255 0.35
256 0.35
257 0.36
258 0.29
259 0.29
260 0.25
261 0.24
262 0.25
263 0.24
264 0.24
265 0.25
266 0.26
267 0.23
268 0.24
269 0.28
270 0.26
271 0.26
272 0.28
273 0.25
274 0.26
275 0.25
276 0.22
277 0.2
278 0.18
279 0.14
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.12
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.18
302 0.22
303 0.23
304 0.21
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.16
310 0.14
311 0.13
312 0.12
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.14
318 0.14
319 0.17
320 0.21
321 0.21
322 0.21
323 0.22
324 0.25
325 0.22
326 0.27
327 0.24
328 0.29
329 0.36
330 0.37
331 0.39
332 0.36
333 0.34
334 0.29
335 0.34
336 0.31
337 0.27
338 0.26
339 0.23
340 0.28
341 0.26
342 0.29
343 0.23
344 0.19
345 0.21
346 0.24
347 0.27
348 0.29
349 0.36
350 0.35
351 0.39
352 0.41
353 0.38
354 0.45
355 0.52
356 0.54
357 0.52
358 0.52
359 0.5
360 0.48
361 0.52
362 0.53
363 0.52
364 0.5
365 0.48
366 0.49
367 0.51
368 0.5
369 0.45
370 0.36
371 0.28
372 0.23
373 0.2
374 0.16
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.11
384 0.13
385 0.18
386 0.18
387 0.18
388 0.21
389 0.21
390 0.25
391 0.23
392 0.26
393 0.22
394 0.23
395 0.24
396 0.21
397 0.21
398 0.16
399 0.16
400 0.11
401 0.1
402 0.08
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.11
422 0.12
423 0.14
424 0.16
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.15
429 0.14
430 0.15
431 0.15
432 0.15
433 0.16
434 0.16
435 0.15
436 0.15
437 0.16
438 0.16
439 0.13
440 0.12
441 0.11
442 0.12
443 0.13
444 0.14
445 0.13
446 0.11
447 0.11
448 0.1
449 0.09
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.06
464 0.06
465 0.05
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.06
472 0.07
473 0.09
474 0.11
475 0.12
476 0.22
477 0.22
478 0.21
479 0.2
480 0.19
481 0.19
482 0.17
483 0.16
484 0.06
485 0.05
486 0.06
487 0.05
488 0.05
489 0.06
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.06
495 0.09
496 0.1
497 0.09
498 0.1
499 0.12
500 0.15
501 0.22
502 0.26
503 0.26
504 0.28
505 0.3
506 0.31
507 0.34
508 0.31
509 0.26
510 0.24
511 0.23
512 0.22
513 0.18
514 0.17
515 0.11
516 0.11
517 0.09
518 0.06
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.06
526 0.06
527 0.07
528 0.06
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.08
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.1
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.08
547 0.06
548 0.05
549 0.05
550 0.04
551 0.04
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.05
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.08
565 0.08
566 0.1
567 0.12
568 0.12
569 0.19
570 0.27
571 0.29
572 0.29
573 0.31
574 0.32
575 0.33
576 0.34
577 0.36
578 0.37
579 0.38
580 0.42
581 0.42
582 0.4
583 0.39
584 0.38
585 0.34
586 0.27
587 0.27
588 0.23
589 0.22
590 0.22
591 0.22
592 0.27
593 0.25
594 0.24
595 0.23
596 0.23
597 0.23
598 0.27
599 0.27
600 0.23
601 0.21
602 0.22
603 0.23
604 0.22
605 0.21
606 0.19
607 0.2
608 0.24
609 0.3
610 0.33
611 0.33
612 0.37
613 0.42
614 0.47
615 0.49
616 0.49
617 0.51
618 0.51
619 0.53
620 0.54
621 0.5
622 0.46
623 0.42
624 0.37
625 0.29
626 0.23
627 0.21
628 0.18
629 0.16
630 0.14
631 0.14
632 0.12
633 0.11
634 0.1
635 0.08
636 0.06
637 0.06
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.07
644 0.08
645 0.08
646 0.09
647 0.08
648 0.09
649 0.1
650 0.1
651 0.09
652 0.08
653 0.08
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.05
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.08
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.1
675 0.1
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.06
680 0.06
681 0.05
682 0.05
683 0.06
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.07
688 0.07
689 0.09
690 0.1
691 0.09
692 0.11
693 0.11
694 0.13
695 0.13
696 0.15
697 0.15
698 0.14
699 0.13
700 0.11
701 0.1
702 0.08
703 0.07
704 0.06
705 0.04
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.06
715 0.06
716 0.08
717 0.09
718 0.09
719 0.11
720 0.12
721 0.13
722 0.15
723 0.16
724 0.17
725 0.26
726 0.27
727 0.29
728 0.29
729 0.29
730 0.25
731 0.26
732 0.24
733 0.19
734 0.19
735 0.19
736 0.18
737 0.17
738 0.17
739 0.16
740 0.15
741 0.12
742 0.1
743 0.08
744 0.08
745 0.1
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.12
750 0.14
751 0.13
752 0.12
753 0.11
754 0.1
755 0.12
756 0.12
757 0.11
758 0.12
759 0.13
760 0.13
761 0.15
762 0.19
763 0.18
764 0.18
765 0.21
766 0.27
767 0.32
768 0.4
769 0.42
770 0.41
771 0.48
772 0.5
773 0.51
774 0.46
775 0.48
776 0.48
777 0.51
778 0.55
779 0.52
780 0.5
781 0.49
782 0.46
783 0.45
784 0.4
785 0.35
786 0.28
787 0.26
788 0.24
789 0.24
790 0.25
791 0.19
792 0.19
793 0.18
794 0.19
795 0.24
796 0.26
797 0.26
798 0.27
799 0.27
800 0.24
801 0.23
802 0.23
803 0.15
804 0.14
805 0.13
806 0.11
807 0.1