Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F0IJQ0

Protein Details
Accession A0A0F0IJQ0    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-68AREVASKGEKSKRKKKEPTPSSSSESHydrophilic
127-152SEEEKPAKKQKQESKKESKKAKESSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-59KALSKVKDSGVAKASQSPKTKSKQIAREVASKGEKSKRKKKE
131-148KPAKKQKQESKKESKKAK
467-514GGGGGRGRGGFGGGRGGPRGGGGRGGGGRGRGGFGGRGGGPPNKARGG
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, cysk 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKSVTKKGAEKPVDKALSKVKDSGVAKASQSPKTKSKQIAREVASKGEKSKRKKKEPTPSSSSESDSDEEMESSSSSSESESEEEKPAKKEVKKAAKSSSESSSESESDSDSDEEMEDASSSESEEEKPAKKQKQESKKESKKAKESSTESSDSSESESESEDEKPAKKEVKKAAESSDSSESDSSDEEEAPKKAAKEASDSDSSESDSDSEEAPKKESSDSSDSDSSESESESEDSEESAKDSKKRKAEEDVSATPKKTKTEEPAAGASANLFVGNLSWNVDEAWLQSEFEEFGELSGVRIMTERDTGRSRGFGYVEYVNAVDAAKAFEAKRDTEIDGRKINLDYATGRPANREQGGFQDRAQARARSFGDQASPESDTLFVGNIPFSANEDSLHEVFGQKGSVMGIRLPTDPESGRPKGFGYVQFSSVEEAREAFNELNGAEIDGRPVRLDFSTPRANNGGGGGGGRGRGGFGGGRGGPRGGGGRGGGGRGRGGFGGRGGGPPNKARGGIPEYKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.73
3 0.71
4 0.61
5 0.57
6 0.56
7 0.55
8 0.53
9 0.51
10 0.42
11 0.43
12 0.44
13 0.46
14 0.41
15 0.37
16 0.35
17 0.4
18 0.45
19 0.44
20 0.5
21 0.5
22 0.54
23 0.58
24 0.65
25 0.66
26 0.7
27 0.72
28 0.74
29 0.78
30 0.74
31 0.75
32 0.69
33 0.68
34 0.64
35 0.56
36 0.55
37 0.55
38 0.58
39 0.6
40 0.68
41 0.7
42 0.76
43 0.84
44 0.88
45 0.89
46 0.91
47 0.91
48 0.89
49 0.84
50 0.79
51 0.71
52 0.63
53 0.54
54 0.47
55 0.39
56 0.31
57 0.27
58 0.21
59 0.19
60 0.16
61 0.14
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.11
71 0.13
72 0.15
73 0.2
74 0.24
75 0.27
76 0.29
77 0.33
78 0.39
79 0.41
80 0.47
81 0.53
82 0.6
83 0.64
84 0.68
85 0.71
86 0.71
87 0.71
88 0.66
89 0.62
90 0.55
91 0.49
92 0.44
93 0.39
94 0.32
95 0.28
96 0.24
97 0.19
98 0.16
99 0.16
100 0.15
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.12
116 0.16
117 0.18
118 0.26
119 0.35
120 0.41
121 0.46
122 0.55
123 0.62
124 0.68
125 0.77
126 0.79
127 0.82
128 0.85
129 0.88
130 0.88
131 0.87
132 0.85
133 0.82
134 0.79
135 0.76
136 0.71
137 0.69
138 0.65
139 0.59
140 0.5
141 0.44
142 0.37
143 0.29
144 0.26
145 0.19
146 0.13
147 0.11
148 0.12
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.23
157 0.29
158 0.31
159 0.38
160 0.45
161 0.52
162 0.53
163 0.54
164 0.54
165 0.52
166 0.5
167 0.46
168 0.43
169 0.33
170 0.3
171 0.28
172 0.23
173 0.18
174 0.17
175 0.14
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.16
185 0.18
186 0.17
187 0.2
188 0.23
189 0.26
190 0.27
191 0.27
192 0.26
193 0.23
194 0.23
195 0.18
196 0.15
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.11
202 0.14
203 0.14
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.2
210 0.21
211 0.22
212 0.24
213 0.26
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.19
218 0.14
219 0.13
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.1
231 0.12
232 0.17
233 0.23
234 0.29
235 0.34
236 0.37
237 0.4
238 0.45
239 0.49
240 0.49
241 0.5
242 0.49
243 0.49
244 0.47
245 0.44
246 0.39
247 0.35
248 0.31
249 0.26
250 0.25
251 0.25
252 0.32
253 0.34
254 0.33
255 0.33
256 0.32
257 0.29
258 0.25
259 0.19
260 0.11
261 0.08
262 0.05
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.05
284 0.04
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.1
295 0.11
296 0.13
297 0.16
298 0.18
299 0.18
300 0.2
301 0.2
302 0.19
303 0.19
304 0.16
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.14
309 0.13
310 0.1
311 0.1
312 0.09
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.15
323 0.17
324 0.18
325 0.23
326 0.27
327 0.29
328 0.29
329 0.29
330 0.29
331 0.27
332 0.26
333 0.2
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.19
338 0.2
339 0.19
340 0.21
341 0.23
342 0.27
343 0.27
344 0.26
345 0.21
346 0.28
347 0.32
348 0.3
349 0.28
350 0.32
351 0.3
352 0.34
353 0.37
354 0.32
355 0.28
356 0.34
357 0.36
358 0.29
359 0.3
360 0.27
361 0.26
362 0.24
363 0.25
364 0.21
365 0.2
366 0.17
367 0.17
368 0.15
369 0.12
370 0.11
371 0.1
372 0.07
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.08
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.16
384 0.16
385 0.16
386 0.14
387 0.13
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.11
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.16
402 0.18
403 0.18
404 0.22
405 0.27
406 0.29
407 0.29
408 0.28
409 0.28
410 0.28
411 0.32
412 0.32
413 0.32
414 0.31
415 0.32
416 0.31
417 0.31
418 0.3
419 0.26
420 0.22
421 0.15
422 0.14
423 0.12
424 0.12
425 0.14
426 0.12
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.12
439 0.13
440 0.14
441 0.14
442 0.18
443 0.17
444 0.23
445 0.33
446 0.32
447 0.36
448 0.37
449 0.36
450 0.33
451 0.31
452 0.25
453 0.15
454 0.15
455 0.12
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.13
466 0.15
467 0.17
468 0.18
469 0.18
470 0.17
471 0.17
472 0.19
473 0.15
474 0.15
475 0.14
476 0.17
477 0.17
478 0.2
479 0.2
480 0.18
481 0.19
482 0.18
483 0.19
484 0.16
485 0.16
486 0.15
487 0.15
488 0.18
489 0.16
490 0.18
491 0.21
492 0.24
493 0.27
494 0.3
495 0.35
496 0.34
497 0.34
498 0.32
499 0.36
500 0.4
501 0.44
502 0.43
503 0.47
504 0.47
505 0.48