FuNGI

A0A0F0I0J4

Protein Details

Accession

A0A0F0I0J4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
912-940	DEGWAEMMKKREKKRNNWKMKKETSSFGD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
920-932	KKREKKRNNWKMK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037685 RBP11 IPR036603 RBP11-like IPR009025 RBP11-like_dimer IPR008193 RNA_pol_Rpb11_13-16kDa_CS
Gene Ontology	GO:0005665 C:RNA polymerase II, core complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0046983 F:protein dimerization activity GO:0001055 F:RNA polymerase II activity
Pfam	View protein in Pfam PF13656 RNA_pol_L_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS01154 RNA_POL_L_13KD
CDD	cd06926 RNAP_II_RPB11

Amino Acid Sequences

MPIKLPKGFARRKSSGNALEEGENPPPQSFRVFERPSVDKKSYSEGNLLAKRLSDGQRFYPTAEDSDNIFAEIDSPGQRSPGGMHERPKSATHRLTDGPNPSDTPTSHSRNLYDIPIPPLSGALRAAGRTFSFGGRFSRASAQTPPPQPSTPGPSRSRAMTASTTSTATPPKLLDTDLQLGQGEDEFHNMFDEVGKMEASRERSGELFPSSPELVARKQEKSPRPTPINTDRSKEIEPSPYSWDSRHSGEGLLMASDSPQDHTPALQQTLNSQPVSPEGRRRSLPLSSAVPRTTAHRSLEQPQAMPDKSLRRSVLYPSKRASTPVEDEDAKLIMESLYTNKRSSQILLTSEHEDSDAERDTPLFSNSHAITADGSGRSDAKPMVTHKSLGVAEDHPDPSIAAHARLAAQYEERQPAPTASSNKVMTPSQFEHYRQQQELRRSNSDASKSEDSAESEFDEEDEAEKNREVERQRRKQEAHLSVYRQQMMKVTGQESPAPALRSEVDQANNSTPNLTVTPFNSGLRSGSGKSSEGDEDEEIPLGILAAHGFPNRNRPPSRLVPSNSIPNLRASFHQPYISSSSSVADHEPGNRSSLPVFARNLPRDPYFGASLVNPSNRESLAFGGGSSVYGGPAATAGPSPALPPGGLVGVIATEERARAMRRGSPNTQAMYEYQGGPSTVPTPASGIPRPYTMMSINPPVPSGPQSGISATEQAQIQLSQQMSSMMQMQMQWMQQMIQMQSGQVPPQQLAPPGGSPPTASANANMRPSSMPSAGGLNNTPVAYRNDQRTLSMLDPNVSSRLNSPATPYNVAGNRPSTPAGQGYAPSIAPSERSNVGLAPRYRPVSMLQPESGPAAFPFMSKSWNDENQKLTLPVPPDRSLQTKPTIDQISSGDKSAIISTTGHGADPDDDDDEGWAEMMKKREKKRNNWKMKKETSSFGDLLNAPTIALTRLYGESNSGTTIGCTYESFVLANGENKVEMEIDTRIPSSAIFTFNKEDHTLGNLIRSRLLQSSHVLFAAYKVPHPLVPKFELRVQTDGEITPKEAVIAACHELVRDLGILSREFTKEYELRKMVGATQQQQDGVQDGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.69
3	0.64
4	0.57
5	0.5
6	0.48
7	0.44
8	0.41
9	0.36
10	0.29
11	0.26
12	0.24
13	0.22
14	0.21
15	0.23
16	0.22
17	0.25
18	0.34
19	0.37
20	0.4
21	0.46
22	0.51
23	0.55
24	0.61
25	0.57
26	0.5
27	0.49
28	0.52
29	0.51
30	0.47
31	0.45
32	0.41
33	0.47
34	0.47
35	0.46
36	0.4
37	0.35
38	0.33
39	0.36
40	0.38
41	0.35
42	0.35
43	0.4
44	0.47
45	0.48
46	0.47
47	0.45
48	0.39
49	0.36
50	0.34
51	0.29
52	0.23
53	0.26
54	0.24
55	0.2
56	0.18
57	0.15
58	0.14
59	0.13
60	0.13
61	0.12
62	0.13
63	0.13
64	0.14
65	0.14
66	0.14
67	0.15
68	0.22
69	0.29
70	0.31
71	0.39
72	0.44
73	0.48
74	0.5
75	0.53
76	0.51
77	0.51
78	0.53
79	0.49
80	0.49
81	0.48
82	0.51
83	0.53
84	0.54
85	0.48
86	0.43
87	0.42
88	0.38
89	0.38
90	0.33
91	0.32
92	0.33
93	0.37
94	0.4
95	0.41
96	0.4
97	0.41
98	0.43
99	0.41
100	0.37
101	0.34
102	0.33
103	0.31
104	0.3
105	0.25
106	0.25
107	0.21
108	0.19
109	0.16
110	0.13
111	0.14
112	0.14
113	0.15
114	0.15
115	0.15
116	0.16
117	0.17
118	0.17
119	0.18
120	0.19
121	0.22
122	0.25
123	0.25
124	0.25
125	0.31
126	0.31
127	0.33
128	0.37
129	0.41
130	0.45
131	0.5
132	0.52
133	0.49
134	0.47
135	0.48
136	0.46
137	0.48
138	0.47
139	0.5
140	0.49
141	0.49
142	0.51
143	0.5
144	0.48
145	0.41
146	0.38
147	0.33
148	0.32
149	0.31
150	0.31
151	0.29
152	0.26
153	0.27
154	0.26
155	0.23
156	0.22
157	0.18
158	0.19
159	0.19
160	0.2
161	0.19
162	0.21
163	0.25
164	0.23
165	0.24
166	0.21
167	0.2
168	0.18
169	0.17
170	0.14
171	0.1
172	0.12
173	0.11
174	0.11
175	0.12
176	0.12
177	0.11
178	0.09
179	0.1
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.1
185	0.14
186	0.18
187	0.19
188	0.19
189	0.19
190	0.2
191	0.22
192	0.23
193	0.22
194	0.18
195	0.17
196	0.21
197	0.2
198	0.19
199	0.19
200	0.19
201	0.19
202	0.26
203	0.3
204	0.29
205	0.35
206	0.44
207	0.51
208	0.57
209	0.61
210	0.63
211	0.65
212	0.65
213	0.67
214	0.68
215	0.69
216	0.65
217	0.62
218	0.56
219	0.54
220	0.52
221	0.47
222	0.4
223	0.39
224	0.37
225	0.36
226	0.38
227	0.37
228	0.37
229	0.34
230	0.35
231	0.3
232	0.3
233	0.3
234	0.24
235	0.21
236	0.2
237	0.21
238	0.17
239	0.13
240	0.1
241	0.08
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.09
247	0.1
248	0.1
249	0.11
250	0.15
251	0.18
252	0.2
253	0.19
254	0.19
255	0.21
256	0.27
257	0.31
258	0.27
259	0.23
260	0.21
261	0.24
262	0.3
263	0.29
264	0.31
265	0.33
266	0.38
267	0.39
268	0.42
269	0.42
270	0.39
271	0.39
272	0.34
273	0.35
274	0.34
275	0.38
276	0.34
277	0.31
278	0.29
279	0.3
280	0.32
281	0.31
282	0.3
283	0.3
284	0.34
285	0.38
286	0.45
287	0.42
288	0.37
289	0.36
290	0.39
291	0.34
292	0.32
293	0.31
294	0.31
295	0.32
296	0.37
297	0.34
298	0.32
299	0.33
300	0.4
301	0.46
302	0.44
303	0.47
304	0.44
305	0.47
306	0.44
307	0.45
308	0.41
309	0.37
310	0.36
311	0.33
312	0.34
313	0.31
314	0.31
315	0.29
316	0.25
317	0.18
318	0.13
319	0.11
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.09
324	0.15
325	0.17
326	0.18
327	0.19
328	0.21
329	0.22
330	0.24
331	0.24
332	0.23
333	0.24
334	0.26
335	0.27
336	0.28
337	0.27
338	0.25
339	0.2
340	0.16
341	0.14
342	0.14
343	0.12
344	0.1
345	0.09
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.13
350	0.1
351	0.1
352	0.14
353	0.14
354	0.16
355	0.14
356	0.13
357	0.12
358	0.13
359	0.14
360	0.1
361	0.1
362	0.09
363	0.1
364	0.1
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.13
369	0.15
370	0.21
371	0.21
372	0.22
373	0.21
374	0.25
375	0.24
376	0.21
377	0.2
378	0.15
379	0.16
380	0.18
381	0.18
382	0.13
383	0.13
384	0.12
385	0.1
386	0.13
387	0.11
388	0.09
389	0.09
390	0.1
391	0.1
392	0.11
393	0.12
394	0.09
395	0.1
396	0.12
397	0.15
398	0.17
399	0.17
400	0.18
401	0.18
402	0.18
403	0.19
404	0.21
405	0.22
406	0.22
407	0.26
408	0.25
409	0.25
410	0.27
411	0.25
412	0.21
413	0.23
414	0.22
415	0.22
416	0.25
417	0.27
418	0.31
419	0.37
420	0.42
421	0.38
422	0.42
423	0.44
424	0.49
425	0.55
426	0.53
427	0.5
428	0.47
429	0.49
430	0.47
431	0.45
432	0.38
433	0.36
434	0.33
435	0.3
436	0.29
437	0.26
438	0.23
439	0.2
440	0.18
441	0.13
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.15
455	0.18
456	0.26
457	0.37
458	0.45
459	0.51
460	0.58
461	0.59
462	0.62
463	0.68
464	0.66
465	0.62
466	0.57
467	0.55
468	0.53
469	0.54
470	0.49
471	0.39
472	0.32
473	0.28
474	0.25
475	0.23
476	0.2
477	0.18
478	0.18
479	0.19
480	0.19
481	0.17
482	0.16
483	0.16
484	0.14
485	0.13
486	0.12
487	0.11
488	0.11
489	0.13
490	0.13
491	0.13
492	0.13
493	0.15
494	0.16
495	0.16
496	0.15
497	0.14
498	0.11
499	0.11
500	0.11
501	0.1
502	0.09
503	0.09
504	0.13
505	0.14
506	0.14
507	0.13
508	0.13
509	0.13
510	0.13
511	0.14
512	0.1
513	0.11
514	0.12
515	0.12
516	0.12
517	0.13
518	0.12
519	0.11
520	0.12
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.09
525	0.07
526	0.07
527	0.06
528	0.04
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.04
534	0.05
535	0.06
536	0.07
537	0.16
538	0.2
539	0.26
540	0.27
541	0.29
542	0.35
543	0.42
544	0.47
545	0.45
546	0.44
547	0.43
548	0.44
549	0.47
550	0.42
551	0.36
552	0.31
553	0.27
554	0.26
555	0.21
556	0.2
557	0.19
558	0.21
559	0.21
560	0.22
561	0.2
562	0.21
563	0.25
564	0.25
565	0.2
566	0.16
567	0.16
568	0.15
569	0.15
570	0.13
571	0.1
572	0.09
573	0.11
574	0.13
575	0.13
576	0.14
577	0.14
578	0.14
579	0.13
580	0.16
581	0.15
582	0.16
583	0.17
584	0.2
585	0.27
586	0.28
587	0.3
588	0.29
589	0.29
590	0.27
591	0.27
592	0.24
593	0.18
594	0.17
595	0.15
596	0.12
597	0.14
598	0.15
599	0.15
600	0.14
601	0.14
602	0.15
603	0.14
604	0.14
605	0.12
606	0.11
607	0.11
608	0.1
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.04
625	0.04
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.04
635	0.04
636	0.03
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.03
642	0.04
643	0.06
644	0.07
645	0.09
646	0.11
647	0.18
648	0.25
649	0.31
650	0.34
651	0.39
652	0.42
653	0.41
654	0.39
655	0.34
656	0.27
657	0.25
658	0.23
659	0.18
660	0.14
661	0.13
662	0.13
663	0.12
664	0.12
665	0.09
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.09
670	0.12
671	0.16
672	0.17
673	0.18
674	0.19
675	0.19
676	0.21
677	0.19
678	0.19
679	0.15
680	0.16
681	0.17
682	0.2
683	0.21
684	0.19
685	0.19
686	0.17
687	0.18
688	0.17
689	0.16
690	0.13
691	0.13
692	0.14
693	0.14
694	0.15
695	0.15
696	0.14
697	0.13
698	0.14
699	0.12
700	0.12
701	0.12
702	0.11
703	0.11
704	0.13
705	0.12
706	0.1
707	0.1
708	0.11
709	0.1
710	0.11
711	0.13
712	0.09
713	0.1
714	0.1
715	0.11
716	0.13
717	0.13
718	0.12
719	0.1
720	0.1
721	0.1
722	0.14
723	0.13
724	0.12
725	0.12
726	0.12
727	0.14
728	0.15
729	0.14
730	0.13
731	0.13
732	0.11
733	0.15
734	0.16
735	0.15
736	0.16
737	0.17
738	0.16
739	0.16
740	0.17
741	0.13
742	0.12
743	0.12
744	0.14
745	0.15
746	0.14
747	0.16
748	0.2
749	0.24
750	0.27
751	0.25
752	0.22
753	0.21
754	0.24
755	0.25
756	0.21
757	0.17
758	0.15
759	0.19
760	0.18
761	0.19
762	0.16
763	0.13
764	0.14
765	0.13
766	0.13
767	0.12
768	0.16
769	0.19
770	0.22
771	0.27
772	0.3
773	0.31
774	0.32
775	0.32
776	0.31
777	0.29
778	0.29
779	0.24
780	0.21
781	0.21
782	0.21
783	0.21
784	0.17
785	0.16
786	0.13
787	0.18
788	0.18
789	0.18
790	0.21
791	0.25
792	0.29
793	0.3
794	0.29
795	0.3
796	0.31
797	0.32
798	0.31
799	0.27
800	0.25
801	0.24
802	0.25
803	0.2
804	0.19
805	0.19
806	0.18
807	0.16
808	0.15
809	0.15
810	0.15
811	0.14
812	0.12
813	0.12
814	0.1
815	0.11
816	0.11
817	0.13
818	0.13
819	0.14
820	0.15
821	0.15
822	0.18
823	0.24
824	0.25
825	0.25
826	0.29
827	0.3
828	0.29
829	0.29
830	0.28
831	0.3
832	0.34
833	0.34
834	0.3
835	0.29
836	0.29
837	0.3
838	0.27
839	0.18
840	0.13
841	0.12
842	0.11
843	0.11
844	0.13
845	0.12
846	0.15
847	0.15
848	0.2
849	0.24
850	0.32
851	0.37
852	0.38
853	0.4
854	0.4
855	0.42
856	0.38
857	0.33
858	0.28
859	0.27
860	0.29
861	0.31
862	0.31
863	0.31
864	0.33
865	0.38
866	0.37
867	0.38
868	0.4
869	0.38
870	0.37
871	0.42
872	0.41
873	0.36
874	0.35
875	0.33
876	0.33
877	0.31
878	0.3
879	0.23
880	0.2
881	0.21
882	0.19
883	0.17
884	0.1
885	0.1
886	0.1
887	0.14
888	0.14
889	0.13
890	0.12
891	0.12
892	0.12
893	0.14
894	0.14
895	0.11
896	0.11
897	0.11
898	0.11
899	0.11
900	0.1
901	0.08
902	0.07
903	0.08
904	0.12
905	0.19
906	0.27
907	0.34
908	0.43
909	0.54
910	0.63
911	0.72
912	0.8
913	0.85
914	0.88
915	0.91
916	0.93
917	0.93
918	0.93
919	0.92
920	0.85
921	0.8
922	0.74
923	0.7
924	0.6
925	0.49
926	0.44
927	0.35
928	0.32
929	0.27
930	0.22
931	0.15
932	0.14
933	0.14
934	0.1
935	0.1
936	0.08
937	0.09
938	0.11
939	0.12
940	0.12
941	0.14
942	0.14
943	0.14
944	0.15
945	0.13
946	0.12
947	0.11
948	0.11
949	0.1
950	0.1
951	0.09
952	0.11
953	0.12
954	0.12
955	0.12
956	0.12
957	0.13
958	0.13
959	0.16
960	0.15
961	0.15
962	0.14
963	0.14
964	0.14
965	0.12
966	0.12
967	0.11
968	0.12
969	0.14
970	0.15
971	0.16
972	0.15
973	0.15
974	0.14
975	0.15
976	0.16
977	0.19
978	0.19
979	0.22
980	0.26
981	0.27
982	0.31
983	0.29
984	0.27
985	0.23
986	0.25
987	0.25
988	0.21
989	0.28
990	0.28
991	0.27
992	0.28
993	0.28
994	0.27
995	0.28
996	0.3
997	0.25
998	0.26
999	0.29
1000	0.28
1001	0.27
1002	0.25
1003	0.22
1004	0.21
1005	0.25
1006	0.21
1007	0.19
1008	0.21
1009	0.22
1010	0.25
1011	0.3
1012	0.33
1013	0.32
1014	0.36
1015	0.4
1016	0.4
1017	0.45
1018	0.49
1019	0.48
1020	0.47
1021	0.43
1022	0.39
1023	0.36
1024	0.34
1025	0.31
1026	0.26
1027	0.24
1028	0.21
1029	0.19
1030	0.17
1031	0.17
1032	0.16
1033	0.14
1034	0.17
1035	0.17
1036	0.18
1037	0.18
1038	0.17
1039	0.16
1040	0.16
1041	0.15
1042	0.11
1043	0.09
1044	0.1
1045	0.13
1046	0.14
1047	0.15
1048	0.19
1049	0.19
1050	0.19
1051	0.2
1052	0.25
1053	0.27
1054	0.32
1055	0.4
1056	0.38
1057	0.38
1058	0.4
1059	0.4
1060	0.37
1061	0.4
1062	0.43
1063	0.39
1064	0.42
1065	0.43
1066	0.41
1067	0.4
1068	0.37

A0A0F0I0J4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer