FuNGI

W2S3D9

Protein Details

Accession

W2S3D9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
223-245	GSTVEATGRKRKKRWDVATDTTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
231-236	RKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 16, cyto 6, nucl 3, cyto_mito 3, cyto_pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFETVRRLQAERNAAAAAKKDSLSFDPSTQRSSVSAGKVSVTESLDTDLYDASSNGVNKYAGYHTSIAANGDDDEEMPDSDTSRRLIGNYTASKEQMNEFSTGGAEEEDILLGREKSARIADRETDYQKRRFERGPLTPTRADPFAANKHAGAAQEGGSTYREVMQMQDLEREEERVRKLIEEKEAKAALHGDADDDDVVVEHKPTLKEAEDKENADKGSTVEATGRKRKKRWDVATDTTPAAEGEPKKRSRWDQAPGIDGQPAPAKRSRWDQAPALGDGGAAPAAAPAPALLGADGGAKGVWTDEDLDAMLPSEGYTILEPPPGYEPIRQAARRAMPASASSSTGIGGFMMQEPENPRSMGKQLPTEIPGVGDLQFFKAEDMQYFGKLVDGSDENAMSVEDLKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGPLFNQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYTHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIIQQIPILMGCAILPHLKGLVDCIGDNLQDEQAKVRTVTSLAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFQSPDEEMKKVVLRVVSQCASTDGVTAGYLKEHVLADFFKNFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVNNLKDESEAYRKMTVETIEKVIAALGAADIGERLEERLVDGMLFAFQEQSIEDIVMLNGFGTVVNALGVRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGITQMQPPIRDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIVEAIEAIRMAVGTGIVMNYVWAGLFHPARKVRVPYWRLYNDAYVAGADAMVPYYPNLGGEGVARPELEVLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.35
3	0.35
4	0.36
5	0.35
6	0.36
7	0.35
8	0.3
9	0.25
10	0.24
11	0.23
12	0.26
13	0.28
14	0.31
15	0.3
16	0.31
17	0.37
18	0.38
19	0.41
20	0.38
21	0.36
22	0.32
23	0.33
24	0.34
25	0.3
26	0.31
27	0.28
28	0.29
29	0.28
30	0.28
31	0.28
32	0.23
33	0.2
34	0.17
35	0.19
36	0.17
37	0.17
38	0.16
39	0.12
40	0.11
41	0.11
42	0.1
43	0.09
44	0.13
45	0.14
46	0.14
47	0.16
48	0.15
49	0.15
50	0.18
51	0.2
52	0.18
53	0.21
54	0.21
55	0.2
56	0.22
57	0.23
58	0.21
59	0.18
60	0.17
61	0.14
62	0.13
63	0.13
64	0.1
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.12
69	0.12
70	0.12
71	0.14
72	0.16
73	0.15
74	0.16
75	0.17
76	0.16
77	0.2
78	0.23
79	0.31
80	0.33
81	0.37
82	0.37
83	0.37
84	0.37
85	0.35
86	0.34
87	0.31
88	0.28
89	0.25
90	0.22
91	0.22
92	0.21
93	0.19
94	0.16
95	0.11
96	0.08
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.06
101	0.07
102	0.09
103	0.08
104	0.09
105	0.12
106	0.12
107	0.15
108	0.21
109	0.25
110	0.27
111	0.32
112	0.36
113	0.39
114	0.45
115	0.48
116	0.52
117	0.54
118	0.57
119	0.6
120	0.61
121	0.61
122	0.59
123	0.62
124	0.62
125	0.64
126	0.67
127	0.67
128	0.69
129	0.66
130	0.64
131	0.59
132	0.51
133	0.42
134	0.35
135	0.34
136	0.35
137	0.36
138	0.35
139	0.31
140	0.31
141	0.32
142	0.3
143	0.25
144	0.19
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.14
149	0.13
150	0.13
151	0.12
152	0.13
153	0.13
154	0.12
155	0.13
156	0.16
157	0.19
158	0.19
159	0.24
160	0.22
161	0.25
162	0.25
163	0.27
164	0.25
165	0.28
166	0.29
167	0.29
168	0.29
169	0.29
170	0.34
171	0.36
172	0.43
173	0.44
174	0.44
175	0.46
176	0.47
177	0.43
178	0.39
179	0.35
180	0.26
181	0.21
182	0.19
183	0.13
184	0.11
185	0.13
186	0.11
187	0.09
188	0.08
189	0.06
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.11
195	0.11
196	0.13
197	0.16
198	0.18
199	0.25
200	0.28
201	0.37
202	0.37
203	0.4
204	0.42
205	0.43
206	0.4
207	0.34
208	0.31
209	0.23
210	0.22
211	0.19
212	0.16
213	0.17
214	0.22
215	0.29
216	0.38
217	0.46
218	0.51
219	0.57
220	0.66
221	0.72
222	0.78
223	0.8
224	0.81
225	0.81
226	0.8
227	0.8
228	0.73
229	0.62
230	0.51
231	0.42
232	0.31
233	0.23
234	0.21
235	0.19
236	0.23
237	0.31
238	0.35
239	0.38
240	0.45
241	0.5
242	0.54
243	0.59
244	0.6
245	0.6
246	0.61
247	0.61
248	0.56
249	0.51
250	0.43
251	0.34
252	0.28
253	0.25
254	0.22
255	0.22
256	0.25
257	0.26
258	0.27
259	0.35
260	0.38
261	0.38
262	0.43
263	0.42
264	0.44
265	0.46
266	0.43
267	0.35
268	0.3
269	0.24
270	0.18
271	0.15
272	0.09
273	0.05
274	0.04
275	0.03
276	0.04
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.07
296	0.06
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.07
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.09
312	0.09
313	0.1
314	0.13
315	0.15
316	0.17
317	0.17
318	0.19
319	0.23
320	0.31
321	0.3
322	0.29
323	0.33
324	0.36
325	0.38
326	0.37
327	0.32
328	0.25
329	0.26
330	0.28
331	0.23
332	0.2
333	0.16
334	0.15
335	0.14
336	0.13
337	0.11
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.09
345	0.13
346	0.15
347	0.16
348	0.16
349	0.16
350	0.16
351	0.19
352	0.21
353	0.21
354	0.23
355	0.24
356	0.26
357	0.28
358	0.27
359	0.24
360	0.2
361	0.18
362	0.14
363	0.12
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.13
374	0.12
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.09
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.09
393	0.1
394	0.1
395	0.15
396	0.15
397	0.17
398	0.2
399	0.24
400	0.26
401	0.35
402	0.41
403	0.43
404	0.49
405	0.49
406	0.47
407	0.48
408	0.48
409	0.45
410	0.45
411	0.42
412	0.42
413	0.45
414	0.44
415	0.42
416	0.48
417	0.5
418	0.45
419	0.43
420	0.41
421	0.45
422	0.52
423	0.51
424	0.42
425	0.33
426	0.31
427	0.3
428	0.29
429	0.23
430	0.15
431	0.12
432	0.13
433	0.14
434	0.14
435	0.13
436	0.1
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.07
444	0.1
445	0.12
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.16
450	0.17
451	0.18
452	0.16
453	0.15
454	0.14
455	0.18
456	0.2
457	0.17
458	0.18
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.18
463	0.13
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.15
468	0.17
469	0.17
470	0.19
471	0.21
472	0.21
473	0.19
474	0.18
475	0.17
476	0.16
477	0.16
478	0.15
479	0.14
480	0.11
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.07
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.09
495	0.1
496	0.12
497	0.12
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.14
502	0.12
503	0.1
504	0.08
505	0.07
506	0.06
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.08
519	0.1
520	0.11
521	0.1
522	0.13
523	0.14
524	0.15
525	0.15
526	0.14
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.08
537	0.07
538	0.06
539	0.05
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.02
547	0.03
548	0.03
549	0.04
550	0.06
551	0.08
552	0.11
553	0.16
554	0.2
555	0.23
556	0.28
557	0.37
558	0.45
559	0.52
560	0.55
561	0.58
562	0.6
563	0.65
564	0.62
565	0.57
566	0.5
567	0.45
568	0.44
569	0.37
570	0.33
571	0.26
572	0.24
573	0.19
574	0.17
575	0.13
576	0.08
577	0.06
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.06
588	0.07
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.08
595	0.08
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.05
613	0.05
614	0.04
615	0.04
616	0.03
617	0.03
618	0.02
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.04
624	0.04
625	0.05
626	0.05
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.08
636	0.13
637	0.22
638	0.24
639	0.25
640	0.31
641	0.34
642	0.36
643	0.36
644	0.37
645	0.32
646	0.3
647	0.3
648	0.24
649	0.2
650	0.18
651	0.15
652	0.08
653	0.05
654	0.04
655	0.03
656	0.04
657	0.03
658	0.04
659	0.05
660	0.05
661	0.04
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.07
676	0.07
677	0.07
678	0.07
679	0.07
680	0.09
681	0.09
682	0.11
683	0.13
684	0.13
685	0.13
686	0.14
687	0.16
688	0.14
689	0.15
690	0.13
691	0.13
692	0.15
693	0.19
694	0.18
695	0.17
696	0.17
697	0.16
698	0.16
699	0.14
700	0.12
701	0.08
702	0.07
703	0.07
704	0.08
705	0.06
706	0.05
707	0.06
708	0.05
709	0.06
710	0.06
711	0.06
712	0.07
713	0.08
714	0.1
715	0.11
716	0.11
717	0.11
718	0.14
719	0.15
720	0.16
721	0.19
722	0.18
723	0.2
724	0.28
725	0.33
726	0.37
727	0.46
728	0.5
729	0.51
730	0.59
731	0.56
732	0.5
733	0.46
734	0.4
735	0.36
736	0.31
737	0.27
738	0.2
739	0.21
740	0.2
741	0.16
742	0.15
743	0.1
744	0.09
745	0.08
746	0.07
747	0.05
748	0.05
749	0.06
750	0.07
751	0.07
752	0.08
753	0.07
754	0.09
755	0.15
756	0.14
757	0.15
758	0.15
759	0.14
760	0.15
761	0.16
762	0.18
763	0.18
764	0.19
765	0.2
766	0.22
767	0.22
768	0.22
769	0.23
770	0.21
771	0.19
772	0.19
773	0.19
774	0.17
775	0.16
776	0.15
777	0.13
778	0.11
779	0.07
780	0.05
781	0.03
782	0.03
783	0.03
784	0.03
785	0.03
786	0.02
787	0.03
788	0.03
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.05
793	0.06
794	0.06
795	0.05
796	0.06
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.05
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.04
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.05
812	0.05
813	0.04
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.03
818	0.03
819	0.03
820	0.04
821	0.04
822	0.04
823	0.07
824	0.08
825	0.1
826	0.11
827	0.11
828	0.12
829	0.18
830	0.27
831	0.26
832	0.29
833	0.29
834	0.31
835	0.31
836	0.31
837	0.27
838	0.21
839	0.22
840	0.21
841	0.22
842	0.25
843	0.26
844	0.27
845	0.3
846	0.32
847	0.37
848	0.41
849	0.39
850	0.33
851	0.33
852	0.32
853	0.29
854	0.26
855	0.19
856	0.15
857	0.12
858	0.12
859	0.1
860	0.1
861	0.09
862	0.08
863	0.1
864	0.1
865	0.1
866	0.1
867	0.11
868	0.11
869	0.1
870	0.11
871	0.09
872	0.09
873	0.08
874	0.08
875	0.09
876	0.08
877	0.07
878	0.06
879	0.05
880	0.04
881	0.05
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.05
890	0.05
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.05
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.04
902	0.04
903	0.03
904	0.03
905	0.04
906	0.05
907	0.05
908	0.06
909	0.09
910	0.12
911	0.13
912	0.13
913	0.14
914	0.16
915	0.17
916	0.18
917	0.18
918	0.21
919	0.24
920	0.25
921	0.27
922	0.27
923	0.32
924	0.37
925	0.45
926	0.45
927	0.49
928	0.51
929	0.58
930	0.62
931	0.64
932	0.61
933	0.61
934	0.57
935	0.53
936	0.5
937	0.42
938	0.35
939	0.28
940	0.23
941	0.14
942	0.11
943	0.08
944	0.08
945	0.08
946	0.09
947	0.1
948	0.11
949	0.14
950	0.17
951	0.2
952	0.22
953	0.23
954	0.23
955	0.26
956	0.25
957	0.24
958	0.24
959	0.22
960	0.21
961	0.19
962	0.18
963	0.19
964	0.19
965	0.19
966	0.15
967	0.18
968	0.22
969	0.22
970	0.24
971	0.22
972	0.27
973	0.33
974	0.43
975	0.49
976	0.5
977	0.59
978	0.65
979	0.72
980	0.67
981	0.6
982	0.51
983	0.41
984	0.36
985	0.28
986	0.2
987	0.11
988	0.13
989	0.13
990	0.12
991	0.11
992	0.11
993	0.11
994	0.1
995	0.1
996	0.07
997	0.07
998	0.08
999	0.1
1000	0.12
1001	0.12
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.16
1005	0.19
1006	0.26
1007	0.31
1008	0.35
1009	0.38
1010	0.42
1011	0.42
1012	0.41
1013	0.38
1014	0.29
1015	0.25
1016	0.19
1017	0.15
1018	0.11
1019	0.09
1020	0.08
1021	0.07
1022	0.06
1023	0.04
1024	0.04
1025	0.04
1026	0.05
1027	0.05
1028	0.06
1029	0.09
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.16
1034	0.16
1035	0.18
1036	0.18
1037	0.17
1038	0.18
1039	0.18
1040	0.19
1041	0.2
1042	0.23
1043	0.25
1044	0.26
1045	0.25
1046	0.28
1047	0.27
1048	0.26
1049	0.2
1050	0.17
1051	0.14
1052	0.14
1053	0.15
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.13
1059	0.12
1060	0.13
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.09
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.08
1070	0.08
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.07
1076	0.06
1077	0.07
1078	0.1
1079	0.1
1080	0.1
1081	0.11
1082	0.14
1083	0.19
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.2
1087	0.2
1088	0.22
1089	0.27
1090	0.3
1091	0.27
1092	0.27
1093	0.26
1094	0.26
1095	0.25
1096	0.23
1097	0.18
1098	0.11
1099	0.1
1100	0.08
1101	0.06
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.04
1106	0.04
1107	0.04
1108	0.03
1109	0.04
1110	0.05
1111	0.05
1112	0.06
1113	0.06
1114	0.07
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.1
1120	0.11
1121	0.11
1122	0.1
1123	0.14
1124	0.21
1125	0.23
1126	0.24
1127	0.23
1128	0.21
1129	0.22
1130	0.24
1131	0.21
1132	0.14
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.11
1136	0.11
1137	0.1
1138	0.08
1139	0.06
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.04
1145	0.05
1146	0.05
1147	0.05
1148	0.05
1149	0.05
1150	0.05
1151	0.05
1152	0.05
1153	0.04
1154	0.06
1155	0.11
1156	0.15
1157	0.17
1158	0.25
1159	0.3
1160	0.34
1161	0.4
1162	0.45
1163	0.47
1164	0.54
1165	0.58
1166	0.57
1167	0.63
1168	0.63
1169	0.61
1170	0.58
1171	0.55
1172	0.47
1173	0.42
1174	0.35
1175	0.25
1176	0.21
1177	0.17
1178	0.13
1179	0.09
1180	0.07
1181	0.06
1182	0.06
1183	0.06
1184	0.06
1185	0.08
1186	0.08
1187	0.08
1188	0.09
1189	0.09
1190	0.1
1191	0.11
1192	0.15
1193	0.15
1194	0.16
1195	0.15
1196	0.14

W2S3D9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer