Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7EXI2

Protein Details
Accession A7EXI2    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-407EELREREKMRQEKRRDEERKLRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-237KFKHKKIPRGPPS
348-359RAGAGAGSRRRD
392-402RQEKRRDEERK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ssl:SS1G_10047  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATSLTRALPKPKYTGEKEEIPQHAQQRGPRILGAGALDDTQIVLKTLQKTGPPPYGNRTGWRPRGQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGRKSTSSNNALALQVDGEGKVKYDAIARQGHNDKRIVHASFKDLIPLRQRADAGDINLDRPSEEEVAASTERTKNALATLVSGAVAAQKPKNVNVGARKDPTYVRYTPANQMGDNSRKNDRIMKIVERQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPAPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRALMQQRLAEKEKAQKEDHLRMLAQKAREERAGAGAGSRRRDSRSSRSRSGSYSDSDSERSNSDDEELREREKMRQEKRRDEERKLRQSRMGTERRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSAETMFDSRLFNRTSGFDSGFNEDQAYDKPLFAAQDAISSIYRPRQNMDDDDDEAAAEGEMAKIQKSNRFGDALGKGTFKGAADVEAREGPVQFEKDTGDVFNVDDFLNKVGESSNKREYGLQEGEERSHKRARMDEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.66
3 0.64
4 0.64
5 0.65
6 0.67
7 0.64
8 0.59
9 0.57
10 0.54
11 0.53
12 0.49
13 0.49
14 0.5
15 0.5
16 0.47
17 0.42
18 0.38
19 0.33
20 0.31
21 0.27
22 0.19
23 0.15
24 0.13
25 0.13
26 0.11
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.13
33 0.16
34 0.2
35 0.23
36 0.26
37 0.31
38 0.37
39 0.45
40 0.44
41 0.44
42 0.47
43 0.54
44 0.53
45 0.54
46 0.56
47 0.57
48 0.63
49 0.67
50 0.64
51 0.59
52 0.64
53 0.61
54 0.55
55 0.5
56 0.44
57 0.35
58 0.32
59 0.27
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.19
74 0.18
75 0.2
76 0.2
77 0.22
78 0.24
79 0.29
80 0.31
81 0.31
82 0.33
83 0.34
84 0.32
85 0.31
86 0.29
87 0.24
88 0.17
89 0.14
90 0.12
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.15
100 0.19
101 0.27
102 0.27
103 0.34
104 0.42
105 0.46
106 0.47
107 0.48
108 0.43
109 0.42
110 0.47
111 0.42
112 0.38
113 0.36
114 0.36
115 0.36
116 0.35
117 0.35
118 0.31
119 0.33
120 0.35
121 0.37
122 0.35
123 0.34
124 0.34
125 0.29
126 0.33
127 0.31
128 0.25
129 0.27
130 0.25
131 0.23
132 0.24
133 0.23
134 0.17
135 0.15
136 0.17
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.13
142 0.14
143 0.13
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.17
148 0.17
149 0.14
150 0.14
151 0.17
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.22
167 0.21
168 0.25
169 0.32
170 0.38
171 0.41
172 0.43
173 0.43
174 0.4
175 0.41
176 0.39
177 0.36
178 0.3
179 0.27
180 0.29
181 0.31
182 0.33
183 0.38
184 0.36
185 0.3
186 0.31
187 0.35
188 0.37
189 0.37
190 0.35
191 0.33
192 0.33
193 0.35
194 0.4
195 0.35
196 0.34
197 0.36
198 0.38
199 0.41
200 0.46
201 0.51
202 0.45
203 0.46
204 0.4
205 0.39
206 0.36
207 0.38
208 0.37
209 0.31
210 0.31
211 0.4
212 0.46
213 0.44
214 0.52
215 0.53
216 0.59
217 0.67
218 0.76
219 0.75
220 0.77
221 0.78
222 0.76
223 0.71
224 0.65
225 0.57
226 0.48
227 0.43
228 0.37
229 0.39
230 0.4
231 0.4
232 0.37
233 0.38
234 0.4
235 0.36
236 0.36
237 0.35
238 0.34
239 0.35
240 0.35
241 0.34
242 0.32
243 0.32
244 0.3
245 0.28
246 0.21
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.27
251 0.3
252 0.38
253 0.42
254 0.47
255 0.52
256 0.49
257 0.49
258 0.42
259 0.41
260 0.37
261 0.4
262 0.37
263 0.38
264 0.39
265 0.35
266 0.32
267 0.32
268 0.28
269 0.19
270 0.17
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.11
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.16
300 0.25
301 0.3
302 0.32
303 0.33
304 0.32
305 0.37
306 0.41
307 0.4
308 0.34
309 0.33
310 0.32
311 0.36
312 0.38
313 0.32
314 0.3
315 0.35
316 0.38
317 0.38
318 0.36
319 0.37
320 0.41
321 0.46
322 0.46
323 0.4
324 0.35
325 0.33
326 0.37
327 0.34
328 0.29
329 0.26
330 0.26
331 0.26
332 0.26
333 0.25
334 0.2
335 0.2
336 0.19
337 0.15
338 0.14
339 0.16
340 0.18
341 0.2
342 0.21
343 0.2
344 0.23
345 0.28
346 0.32
347 0.39
348 0.46
349 0.52
350 0.57
351 0.6
352 0.59
353 0.57
354 0.54
355 0.46
356 0.38
357 0.34
358 0.3
359 0.26
360 0.26
361 0.24
362 0.22
363 0.2
364 0.19
365 0.15
366 0.14
367 0.14
368 0.16
369 0.17
370 0.21
371 0.22
372 0.22
373 0.25
374 0.26
375 0.29
376 0.34
377 0.42
378 0.46
379 0.54
380 0.61
381 0.69
382 0.75
383 0.81
384 0.79
385 0.79
386 0.8
387 0.81
388 0.84
389 0.8
390 0.76
391 0.7
392 0.68
393 0.67
394 0.66
395 0.64
396 0.58
397 0.57
398 0.59
399 0.55
400 0.52
401 0.44
402 0.38
403 0.4
404 0.43
405 0.42
406 0.41
407 0.39
408 0.42
409 0.44
410 0.43
411 0.34
412 0.27
413 0.24
414 0.19
415 0.19
416 0.16
417 0.14
418 0.12
419 0.14
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.13
424 0.12
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.17
429 0.18
430 0.19
431 0.21
432 0.22
433 0.22
434 0.25
435 0.24
436 0.19
437 0.19
438 0.2
439 0.21
440 0.23
441 0.24
442 0.22
443 0.23
444 0.28
445 0.27
446 0.25
447 0.22
448 0.18
449 0.18
450 0.17
451 0.19
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.14
456 0.15
457 0.14
458 0.15
459 0.11
460 0.13
461 0.13
462 0.15
463 0.14
464 0.14
465 0.16
466 0.2
467 0.23
468 0.22
469 0.25
470 0.27
471 0.32
472 0.36
473 0.4
474 0.37
475 0.36
476 0.36
477 0.33
478 0.28
479 0.23
480 0.19
481 0.12
482 0.08
483 0.06
484 0.04
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.1
489 0.13
490 0.19
491 0.24
492 0.27
493 0.29
494 0.31
495 0.31
496 0.36
497 0.37
498 0.36
499 0.33
500 0.3
501 0.27
502 0.26
503 0.27
504 0.19
505 0.17
506 0.13
507 0.15
508 0.16
509 0.17
510 0.19
511 0.19
512 0.2
513 0.18
514 0.18
515 0.16
516 0.19
517 0.21
518 0.18
519 0.18
520 0.19
521 0.19
522 0.2
523 0.19
524 0.15
525 0.14
526 0.14
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.11
535 0.11
536 0.12
537 0.2
538 0.25
539 0.31
540 0.38
541 0.39
542 0.41
543 0.44
544 0.44
545 0.45
546 0.44
547 0.4
548 0.38
549 0.38
550 0.41
551 0.45
552 0.46
553 0.43
554 0.45
555 0.45
556 0.44
557 0.49
558 0.54