FuNGI

W2RXD6

Protein Details

Accession

W2RXD6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
455-479	NPGGGKKAGKKGKRGKHGNERYGLQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
455-472	NPGGGKKAGKKGKRGKHG

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 10.5, cyto_nucl 8.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRKRWIDKNNAQTYKLLYRSQDDPLIHEEGERALFAVGDPTPSSSKQPATAKDLHIADLEDEVDLESMRENEGEAAQYGVYFDDSKYDYMQHLRDIGEGGGAAHFVDAMPVKYKGKGKAKMMKLEDALAQATLDDEDDAPSLVEGSRYGDAYSSYTAATKDRQLESQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVDPADDEDIFGALGRDGKNGELSLDEFEYDYGAADDDDGWESDATEKAPIQPSTQPRPQLKQLDAPTSDSQPISTNNEFSVEDAEAAAEQDGDWLADFAKYKRDTATGARKATPDVGGASVAAASAAHDQAPTLYTLNGTPLRQKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTDGLQLLDARFDQVEKMYALDEGDEFLDEDDDDDDRDGGMSLASGMTGQSKMSKMSQMSQLSTTSFADEGAVRTDLDGMMDGFLGDWAKANPGGGKKAGKKGKRGKHGNERYGLQQLDEVRKELGPARLRRPVQKGLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.61
3	0.57
4	0.5
5	0.42
6	0.41
7	0.43
8	0.46
9	0.46
10	0.38
11	0.36
12	0.36
13	0.37
14	0.32
15	0.29
16	0.25
17	0.2
18	0.21
19	0.17
20	0.13
21	0.09
22	0.09
23	0.09
24	0.11
25	0.09
26	0.11
27	0.11
28	0.14
29	0.17
30	0.18
31	0.23
32	0.25
33	0.27
34	0.32
35	0.39
36	0.41
37	0.45
38	0.5
39	0.48
40	0.51
41	0.49
42	0.43
43	0.37
44	0.33
45	0.26
46	0.21
47	0.18
48	0.11
49	0.1
50	0.09
51	0.08
52	0.07
53	0.06
54	0.06
55	0.06
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.08
60	0.09
61	0.1
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.07
71	0.11
72	0.12
73	0.14
74	0.15
75	0.16
76	0.17
77	0.22
78	0.24
79	0.21
80	0.23
81	0.22
82	0.22
83	0.21
84	0.19
85	0.14
86	0.12
87	0.1
88	0.08
89	0.07
90	0.06
91	0.04
92	0.04
93	0.04
94	0.05
95	0.06
96	0.07
97	0.1
98	0.12
99	0.14
100	0.19
101	0.24
102	0.32
103	0.4
104	0.47
105	0.53
106	0.6
107	0.66
108	0.7
109	0.68
110	0.64
111	0.56
112	0.51
113	0.43
114	0.35
115	0.28
116	0.19
117	0.16
118	0.1
119	0.09
120	0.07
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.05
129	0.06
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.07
134	0.08
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.1
139	0.11
140	0.12
141	0.1
142	0.09
143	0.1
144	0.11
145	0.12
146	0.13
147	0.16
148	0.2
149	0.21
150	0.24
151	0.25
152	0.29
153	0.32
154	0.36
155	0.33
156	0.28
157	0.27
158	0.24
159	0.22
160	0.18
161	0.13
162	0.08
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.08
167	0.07
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.11
172	0.14
173	0.14
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.13
178	0.12
179	0.12
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.05
186	0.05
187	0.04
188	0.04
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.09
204	0.09
205	0.09
206	0.06
207	0.07
208	0.08
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.03
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.08
233	0.13
234	0.13
235	0.14
236	0.19
237	0.25
238	0.31
239	0.34
240	0.39
241	0.37
242	0.41
243	0.46
244	0.46
245	0.42
246	0.43
247	0.42
248	0.41
249	0.39
250	0.4
251	0.34
252	0.3
253	0.29
254	0.22
255	0.2
256	0.16
257	0.17
258	0.18
259	0.17
260	0.17
261	0.15
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.15
266	0.09
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.05
282	0.06
283	0.07
284	0.14
285	0.15
286	0.16
287	0.17
288	0.18
289	0.2
290	0.27
291	0.37
292	0.36
293	0.38
294	0.4
295	0.39
296	0.39
297	0.38
298	0.31
299	0.21
300	0.15
301	0.13
302	0.1
303	0.1
304	0.09
305	0.07
306	0.06
307	0.04
308	0.03
309	0.03
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.07
322	0.12
323	0.14
324	0.14
325	0.21
326	0.29
327	0.39
328	0.45
329	0.5
330	0.55
331	0.63
332	0.71
333	0.71
334	0.73
335	0.73
336	0.75
337	0.75
338	0.67
339	0.59
340	0.5
341	0.42
342	0.34
343	0.25
344	0.18
345	0.14
346	0.13
347	0.11
348	0.12
349	0.13
350	0.11
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.14
355	0.14
356	0.14
357	0.14
358	0.15
359	0.14
360	0.12
361	0.1
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.09
367	0.1
368	0.09
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.06
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.1
401	0.11
402	0.13
403	0.16
404	0.2
405	0.21
406	0.25
407	0.33
408	0.34
409	0.35
410	0.35
411	0.34
412	0.3
413	0.31
414	0.26
415	0.19
416	0.16
417	0.13
418	0.13
419	0.12
420	0.12
421	0.13
422	0.13
423	0.11
424	0.11
425	0.12
426	0.11
427	0.1
428	0.1
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.09
440	0.1
441	0.11
442	0.15
443	0.19
444	0.23
445	0.27
446	0.35
447	0.39
448	0.49
449	0.57
450	0.59
451	0.65
452	0.72
453	0.77
454	0.79
455	0.83
456	0.84
457	0.86
458	0.9
459	0.88
460	0.84
461	0.78
462	0.71
463	0.68
464	0.58
465	0.47
466	0.41
467	0.38
468	0.41
469	0.39
470	0.36
471	0.31
472	0.3
473	0.32
474	0.33
475	0.35
476	0.36
477	0.41
478	0.48
479	0.55
480	0.6
481	0.66
482	0.69

W2RXD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer