Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2RJA1

Protein Details
Accession W2RJA1    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35EFDPSKIKRTPKSERPTGPKLMHydrophilic
244-273KPTRPPVPTFERVKKPKKPLVPVLAKKTADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-261KKPKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVLSKYYPPEFDPSKIKRTPKSERPTGPKLMPVRLMAPFSMKCTSCGEYIYKGRKFNARKETTDEKYLTIPIYRFYIRCTRCSSEITFKTDPKNMDYACERGAKRNFESWRDPESTELKETDEERLDRLEREEAEEAENAERNAMEELEQKMEDSKREMQIADALDEIRTRNARIERGERGNKEEEALALSRQQADEQKAAQELADEEAARKAFQQANVDKARLDEAIELQGDVDAVEAKPTRPPVPTFERVKKPKKPLVPVLAKKTADVVPPLPTAPKTLGLGLGDYDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.52
3 0.53
4 0.52
5 0.53
6 0.56
7 0.61
8 0.62
9 0.68
10 0.73
11 0.74
12 0.77
13 0.79
14 0.81
15 0.82
16 0.81
17 0.79
18 0.71
19 0.69
20 0.63
21 0.59
22 0.53
23 0.46
24 0.42
25 0.38
26 0.37
27 0.3
28 0.3
29 0.26
30 0.26
31 0.29
32 0.26
33 0.25
34 0.28
35 0.3
36 0.25
37 0.27
38 0.26
39 0.27
40 0.35
41 0.42
42 0.42
43 0.43
44 0.46
45 0.52
46 0.55
47 0.59
48 0.61
49 0.58
50 0.57
51 0.62
52 0.67
53 0.62
54 0.63
55 0.55
56 0.45
57 0.4
58 0.39
59 0.32
60 0.26
61 0.22
62 0.17
63 0.2
64 0.2
65 0.19
66 0.21
67 0.29
68 0.29
69 0.32
70 0.38
71 0.38
72 0.39
73 0.42
74 0.43
75 0.44
76 0.46
77 0.49
78 0.46
79 0.45
80 0.46
81 0.47
82 0.43
83 0.36
84 0.38
85 0.3
86 0.3
87 0.3
88 0.28
89 0.26
90 0.31
91 0.29
92 0.31
93 0.36
94 0.36
95 0.36
96 0.42
97 0.42
98 0.41
99 0.47
100 0.43
101 0.43
102 0.41
103 0.39
104 0.35
105 0.35
106 0.32
107 0.27
108 0.24
109 0.2
110 0.19
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.16
115 0.15
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.13
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.12
129 0.13
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.17
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.17
151 0.19
152 0.19
153 0.16
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.14
163 0.16
164 0.2
165 0.24
166 0.28
167 0.32
168 0.4
169 0.46
170 0.43
171 0.45
172 0.45
173 0.4
174 0.36
175 0.3
176 0.22
177 0.18
178 0.17
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.15
186 0.17
187 0.19
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.16
193 0.13
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.14
204 0.16
205 0.19
206 0.27
207 0.27
208 0.35
209 0.38
210 0.38
211 0.33
212 0.31
213 0.3
214 0.21
215 0.2
216 0.13
217 0.12
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.14
232 0.17
233 0.2
234 0.22
235 0.25
236 0.29
237 0.37
238 0.45
239 0.5
240 0.56
241 0.64
242 0.7
243 0.78
244 0.8
245 0.81
246 0.82
247 0.82
248 0.82
249 0.82
250 0.82
251 0.84
252 0.83
253 0.82
254 0.81
255 0.72
256 0.63
257 0.57
258 0.5
259 0.42
260 0.37
261 0.31
262 0.26
263 0.28
264 0.28
265 0.27
266 0.25
267 0.25
268 0.24
269 0.25
270 0.23
271 0.22
272 0.24
273 0.22
274 0.22
275 0.19