Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2S8D8

Protein Details
Accession W2S8D8    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MARPNKKKKTGQVPPAANAKPHydrophilic
235-255DATEQRKREKRKDGRPLPNLGBasic
368-408VELDSRWKVRRQEKEERRRLQKENVERKRRAREKDGKGGAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-26NKKKKTGQVPPAANAKPGGARP
239-249QRKREKRKDGR
299-310RRERQRRREAEA
315-328TPAAKPKSRVEKRA
375-405KVRRQEKEERRRLQKENVERKRRAREKDGKG
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARPNKKKKTGQVPPAANAKPGGARPPKSLVLRLNPHVSGLSLTNLVSDYRLLMSPDTSARLRERRANRLKDYLAMCGPLGVTHLFMFSRSKAGNVHLRVALTPRGPTLTYRVENYVLAKDVLRQQKRPRQGGKAGEYLRAPLVVMNNFSHTPKEGETKDPVEKQLESLMTTVWQGIFPAITPSTTPLGSIKRILLLNRENTSKSEGEGQYVISLRHYAITTRESGVSKRVRRFDATEQRKREKRKDGRPLPNLGGLEDAADYVLGGDEAGYTSASDTELDSENEVEVLETEAQRVVGRRERQRRREAEANGEETPAAKPKSRVEKRAVKLLELGPRMRLRLVKVEEGICEGRVMWNEFVHKTEEEKVELDSRWKVRRQEKEERRRLQKENVERKRRAREKDGKGGAEGEDDEDMQYGSDLEPEDFDDDDDEGDDVDVEGGAVDDGWEDDEASENDDMQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.8
3 0.71
4 0.62
5 0.52
6 0.44
7 0.38
8 0.33
9 0.37
10 0.37
11 0.39
12 0.42
13 0.47
14 0.52
15 0.51
16 0.55
17 0.53
18 0.54
19 0.58
20 0.59
21 0.59
22 0.52
23 0.49
24 0.43
25 0.36
26 0.28
27 0.22
28 0.19
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.15
43 0.16
44 0.19
45 0.18
46 0.21
47 0.27
48 0.33
49 0.37
50 0.44
51 0.5
52 0.57
53 0.67
54 0.72
55 0.71
56 0.72
57 0.69
58 0.66
59 0.6
60 0.54
61 0.45
62 0.38
63 0.31
64 0.23
65 0.21
66 0.15
67 0.14
68 0.1
69 0.09
70 0.08
71 0.1
72 0.09
73 0.1
74 0.13
75 0.12
76 0.17
77 0.16
78 0.17
79 0.18
80 0.23
81 0.31
82 0.31
83 0.34
84 0.3
85 0.31
86 0.3
87 0.31
88 0.3
89 0.23
90 0.21
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.22
96 0.26
97 0.26
98 0.28
99 0.29
100 0.28
101 0.29
102 0.3
103 0.26
104 0.2
105 0.18
106 0.16
107 0.17
108 0.23
109 0.31
110 0.34
111 0.39
112 0.47
113 0.55
114 0.64
115 0.71
116 0.7
117 0.69
118 0.72
119 0.74
120 0.69
121 0.69
122 0.61
123 0.55
124 0.48
125 0.42
126 0.34
127 0.25
128 0.2
129 0.12
130 0.14
131 0.12
132 0.14
133 0.14
134 0.16
135 0.17
136 0.18
137 0.17
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.21
142 0.2
143 0.23
144 0.27
145 0.3
146 0.34
147 0.34
148 0.35
149 0.32
150 0.3
151 0.27
152 0.27
153 0.23
154 0.18
155 0.16
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.14
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.21
183 0.23
184 0.26
185 0.27
186 0.29
187 0.27
188 0.26
189 0.3
190 0.24
191 0.2
192 0.23
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.18
197 0.16
198 0.17
199 0.16
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.21
214 0.26
215 0.31
216 0.35
217 0.38
218 0.38
219 0.4
220 0.44
221 0.47
222 0.5
223 0.55
224 0.58
225 0.6
226 0.66
227 0.69
228 0.72
229 0.7
230 0.7
231 0.7
232 0.72
233 0.77
234 0.79
235 0.84
236 0.82
237 0.79
238 0.7
239 0.63
240 0.53
241 0.42
242 0.32
243 0.21
244 0.16
245 0.11
246 0.09
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.06
274 0.04
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.09
283 0.12
284 0.18
285 0.25
286 0.35
287 0.45
288 0.55
289 0.64
290 0.73
291 0.74
292 0.75
293 0.76
294 0.7
295 0.69
296 0.64
297 0.59
298 0.49
299 0.44
300 0.36
301 0.28
302 0.26
303 0.21
304 0.18
305 0.16
306 0.18
307 0.25
308 0.37
309 0.43
310 0.48
311 0.52
312 0.61
313 0.61
314 0.68
315 0.62
316 0.52
317 0.5
318 0.48
319 0.46
320 0.4
321 0.37
322 0.33
323 0.34
324 0.34
325 0.31
326 0.29
327 0.25
328 0.3
329 0.34
330 0.32
331 0.34
332 0.34
333 0.32
334 0.33
335 0.31
336 0.22
337 0.19
338 0.15
339 0.14
340 0.15
341 0.18
342 0.15
343 0.16
344 0.2
345 0.2
346 0.22
347 0.23
348 0.21
349 0.21
350 0.26
351 0.26
352 0.25
353 0.25
354 0.25
355 0.26
356 0.26
357 0.27
358 0.28
359 0.32
360 0.37
361 0.42
362 0.49
363 0.54
364 0.64
365 0.68
366 0.73
367 0.78
368 0.82
369 0.87
370 0.88
371 0.89
372 0.87
373 0.85
374 0.83
375 0.82
376 0.82
377 0.82
378 0.83
379 0.83
380 0.83
381 0.85
382 0.86
383 0.86
384 0.83
385 0.83
386 0.82
387 0.82
388 0.85
389 0.84
390 0.74
391 0.67
392 0.6
393 0.5
394 0.41
395 0.32
396 0.23
397 0.16
398 0.14
399 0.13
400 0.11
401 0.1
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.06
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.11
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.11
438 0.11
439 0.14
440 0.14