FuNGI

W2SB56

Protein Details

Accession

W2SB56

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-30	SSPPINPGKRSREKLPTRLPVA	Hydrophilic
43-66	DLDFHGEQPKKRRKPSPAPEAVIA	Hydrophilic
456-476	GPPASSQARKRKRAPASRHLA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
52-57	KKRRKP
221-280	KKKSQASRADKEAQSTASKREREAAKEAEKQRKNDAKLEREKEKQKAKDMAEVNKSKANK
464-470	RKRKRAP

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 6, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042530 EME1/EME2_C IPR006166 ERCC4_domain IPR033310 Mms4/EME1/EME2 IPR047521 XPF_nuclease_EME1_ascomycetes
Gene Ontology	GO:0048476 C:Holliday junction resolvase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0004518 F:nuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0051321 P:meiotic cell cycle
Pfam	View protein in Pfam PF02732 ERCC4
CDD	cd20085 XPF_nuclease_Mms4

Amino Acid Sequences

MAEVISLLSSPPINPGKRSREKLPTRLPVADLFGSDDFDTTGDLDFHGEQPKKRRKPSPAPEAVIAARSGPQTLIAELDLSSEPDLPPSSAPADPGPSRPSFLDAFADDDEDDIEFSSSAPAISKNHRSKLDAVVHILSSDSITADDGARTRESAAPAAPAFSARVMEVLGAANISLRDDSGSKRIGKAANTSYKPTKPVRRSKNAIDDIIVSSPPSAASKKKSQASRADKEAQSTASKREREAAKEAEKQRKNDAKLEREKEKQKAKDMAEVNKSKANKKETSKEMILEMHGSLESTSIGDQVEEYMRQHEIQFSYTREEVSLSESAQHLDAGKTLRWKRKIEAAYDEDEGQWVPLDRSRIDLIDHVVILISGSEFASVALGSSDPDDLSESPSLEAMKRNLDRHMEHTRRQHKDRRLIYLIQGLHAWIKKNQNAKNREYTAAVRAQVAEETSNGPPASSQARKRKRAPASRHLAAVTADLAEDLQLYLQINHQPLVIHHTTSDAATASQILSFTQSLSARPYRLAELEHNLKSSSFYMGSGQFKTGDGVQETFCRMLEGQQRVTPSIAQSIAAEWPSPRELVAAFRTSDNLMLENVRKSTNKDGGYSDKRIGPVISKRMYKVFLGRIPEATDGMS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.41
3	0.5
4	0.6
5	0.66
6	0.67
7	0.7
8	0.77
9	0.82
10	0.83
11	0.82
12	0.77
13	0.74
14	0.68
15	0.6
16	0.55
17	0.46
18	0.36
19	0.31
20	0.25
21	0.24
22	0.21
23	0.18
24	0.13
25	0.12
26	0.12
27	0.09
28	0.1
29	0.08
30	0.08
31	0.1
32	0.11
33	0.14
34	0.22
35	0.26
36	0.3
37	0.4
38	0.51
39	0.59
40	0.67
41	0.74
42	0.76
43	0.83
44	0.88
45	0.89
46	0.88
47	0.83
48	0.75
49	0.7
50	0.6
51	0.51
52	0.4
53	0.3
54	0.22
55	0.18
56	0.17
57	0.12
58	0.14
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.11
63	0.11
64	0.11
65	0.13
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.11
71	0.13
72	0.14
73	0.12
74	0.12
75	0.14
76	0.16
77	0.15
78	0.17
79	0.17
80	0.21
81	0.22
82	0.26
83	0.28
84	0.26
85	0.28
86	0.26
87	0.28
88	0.24
89	0.24
90	0.23
91	0.19
92	0.21
93	0.19
94	0.2
95	0.16
96	0.15
97	0.14
98	0.1
99	0.1
100	0.07
101	0.07
102	0.05
103	0.06
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.09
109	0.12
110	0.19
111	0.29
112	0.36
113	0.43
114	0.46
115	0.48
116	0.5
117	0.55
118	0.57
119	0.49
120	0.45
121	0.4
122	0.37
123	0.33
124	0.3
125	0.21
126	0.12
127	0.1
128	0.07
129	0.05
130	0.06
131	0.06
132	0.07
133	0.08
134	0.09
135	0.11
136	0.11
137	0.11
138	0.13
139	0.15
140	0.17
141	0.17
142	0.17
143	0.18
144	0.17
145	0.18
146	0.15
147	0.13
148	0.12
149	0.11
150	0.11
151	0.07
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.06
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.1
168	0.13
169	0.18
170	0.19
171	0.2
172	0.25
173	0.27
174	0.28
175	0.32
176	0.36
177	0.4
178	0.41
179	0.45
180	0.46
181	0.46
182	0.49
183	0.51
184	0.53
185	0.53
186	0.62
187	0.67
188	0.71
189	0.74
190	0.77
191	0.8
192	0.74
193	0.65
194	0.56
195	0.48
196	0.4
197	0.35
198	0.27
199	0.16
200	0.11
201	0.1
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.13
206	0.18
207	0.26
208	0.33
209	0.39
210	0.43
211	0.48
212	0.57
213	0.62
214	0.62
215	0.61
216	0.63
217	0.57
218	0.55
219	0.49
220	0.41
221	0.36
222	0.32
223	0.32
224	0.31
225	0.32
226	0.3
227	0.35
228	0.36
229	0.36
230	0.4
231	0.4
232	0.4
233	0.47
234	0.54
235	0.57
236	0.58
237	0.56
238	0.6
239	0.6
240	0.57
241	0.57
242	0.57
243	0.57
244	0.62
245	0.65
246	0.62
247	0.63
248	0.66
249	0.66
250	0.67
251	0.62
252	0.6
253	0.62
254	0.57
255	0.57
256	0.55
257	0.54
258	0.54
259	0.51
260	0.46
261	0.42
262	0.42
263	0.39
264	0.4
265	0.4
266	0.38
267	0.41
268	0.48
269	0.49
270	0.54
271	0.51
272	0.45
273	0.41
274	0.35
275	0.29
276	0.22
277	0.17
278	0.1
279	0.09
280	0.08
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.1
299	0.1
300	0.12
301	0.14
302	0.14
303	0.16
304	0.16
305	0.16
306	0.13
307	0.14
308	0.12
309	0.13
310	0.12
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.07
318	0.06
319	0.08
320	0.09
321	0.1
322	0.17
323	0.23
324	0.3
325	0.35
326	0.38
327	0.38
328	0.45
329	0.47
330	0.43
331	0.44
332	0.41
333	0.37
334	0.36
335	0.35
336	0.26
337	0.22
338	0.19
339	0.11
340	0.08
341	0.06
342	0.05
343	0.07
344	0.09
345	0.08
346	0.11
347	0.12
348	0.12
349	0.13
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.12
354	0.09
355	0.08
356	0.08
357	0.07
358	0.05
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.04
372	0.05
373	0.04
374	0.05
375	0.06
376	0.06
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.1
384	0.13
385	0.12
386	0.18
387	0.22
388	0.23
389	0.26
390	0.3
391	0.3
392	0.34
393	0.44
394	0.42
395	0.44
396	0.52
397	0.59
398	0.62
399	0.68
400	0.7
401	0.69
402	0.74
403	0.73
404	0.71
405	0.67
406	0.61
407	0.57
408	0.54
409	0.45
410	0.36
411	0.3
412	0.22
413	0.21
414	0.2
415	0.19
416	0.18
417	0.24
418	0.28
419	0.36
420	0.43
421	0.48
422	0.53
423	0.57
424	0.61
425	0.58
426	0.56
427	0.5
428	0.46
429	0.42
430	0.39
431	0.34
432	0.26
433	0.22
434	0.21
435	0.18
436	0.17
437	0.12
438	0.09
439	0.11
440	0.11
441	0.14
442	0.13
443	0.12
444	0.11
445	0.13
446	0.19
447	0.23
448	0.31
449	0.39
450	0.49
451	0.58
452	0.65
453	0.72
454	0.76
455	0.8
456	0.8
457	0.8
458	0.8
459	0.74
460	0.7
461	0.6
462	0.51
463	0.41
464	0.33
465	0.23
466	0.13
467	0.1
468	0.08
469	0.07
470	0.05
471	0.05
472	0.04
473	0.03
474	0.04
475	0.05
476	0.06
477	0.09
478	0.13
479	0.14
480	0.14
481	0.15
482	0.14
483	0.14
484	0.22
485	0.2
486	0.17
487	0.16
488	0.17
489	0.17
490	0.17
491	0.17
492	0.1
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.13
504	0.13
505	0.14
506	0.2
507	0.23
508	0.22
509	0.23
510	0.25
511	0.23
512	0.24
513	0.27
514	0.25
515	0.29
516	0.36
517	0.36
518	0.35
519	0.33
520	0.31
521	0.3
522	0.27
523	0.22
524	0.16
525	0.15
526	0.17
527	0.22
528	0.26
529	0.25
530	0.25
531	0.22
532	0.22
533	0.23
534	0.21
535	0.19
536	0.18
537	0.18
538	0.19
539	0.2
540	0.22
541	0.21
542	0.19
543	0.17
544	0.15
545	0.21
546	0.27
547	0.31
548	0.33
549	0.35
550	0.37
551	0.37
552	0.38
553	0.33
554	0.26
555	0.24
556	0.21
557	0.19
558	0.17
559	0.17
560	0.19
561	0.17
562	0.17
563	0.12
564	0.15
565	0.16
566	0.16
567	0.15
568	0.13
569	0.13
570	0.18
571	0.23
572	0.23
573	0.22
574	0.23
575	0.25
576	0.24
577	0.26
578	0.21
579	0.17
580	0.16
581	0.19
582	0.21
583	0.23
584	0.24
585	0.26
586	0.27
587	0.31
588	0.38
589	0.42
590	0.42
591	0.41
592	0.44
593	0.51
594	0.56
595	0.56
596	0.52
597	0.48
598	0.46
599	0.45
600	0.41
601	0.39
602	0.4
603	0.45
604	0.47
605	0.48
606	0.5
607	0.53
608	0.55
609	0.51
610	0.49
611	0.49
612	0.47
613	0.49
614	0.49
615	0.46
616	0.46
617	0.44

W2SB56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer