FuNGI

W2RLC5

Protein Details

Accession

W2RLC5

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-112	LQASKARVKRDEERPRKRRRVDNEELEDV	Basic
385-427	FPPLLPRKLRVMRAKKPATKPTSNAKRPQARNRRNEVQGRGKA	Hydrophilic
456-488	YRASKPVAKDKVSKSKPKKRPVNRSAKRGAEFK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
89-103	ARVKRDEERPRKRRR
321-327	RKRPKAK
388-500	LLPRKLRVMRAKKPATKPTSNAKRPQARNRRNEVQGRGKAVQKSRDRDATKGKGLRGGNQAKGIVFEGYRASKPVAKDKVSKSKPKKRPVNRSAKRGAEFKAGGGKKKRDMKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM

Amino Acid Sequences

MGKKSSKATKQVESKDQPTVSGSSTAFDPTLSSLFASSLGPVKVPEKPVTKPIKESRQSVTPPELPTPEETPSDSESSSEPDDLQASKARVKRDEERPRKRRRVDNEELEDVYFRRLAKEEERDLQQRQEQQDDGDEVSDSPSNDLEDLSENESEAGVASVLPVHESLTGAKAQELADETKRTIFLSNVSTTAIKDKASKKALLTLLESAIPKDTSDKIESIRFRSTPYASGTGPKRAAFATKALMDETAASTHAYVVLSTEIAAKAIAAKLNGSVVLDRHLHIDQLGAPSQTVHRRCVFVGNLPFVDEETLEANDEENPRKRPKAKMRADAEEGLWRTFAKAGKVENVRMVRDKATRIGKGFAYVQFADENAVEAALLMNDKKFPPLLPRKLRVMRAKKPATKPTSNAKRPQARNRRNEVQGRGKAVQKSRDRDATKGKGLRGGNQAKGIVFEGYRASKPVAKDKVSKSKPKKRPVNRSAKRGAEFKAGGGKKKRDMKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.71
3	0.65
4	0.56
5	0.5
6	0.44
7	0.35
8	0.32
9	0.28
10	0.21
11	0.22
12	0.22
13	0.19
14	0.16
15	0.15
16	0.12
17	0.13
18	0.12
19	0.12
20	0.1
21	0.11
22	0.12
23	0.11
24	0.1
25	0.13
26	0.13
27	0.14
28	0.15
29	0.17
30	0.21
31	0.26
32	0.31
33	0.31
34	0.34
35	0.44
36	0.52
37	0.53
38	0.58
39	0.63
40	0.67
41	0.68
42	0.69
43	0.65
44	0.64
45	0.64
46	0.6
47	0.58
48	0.52
49	0.5
50	0.49
51	0.45
52	0.38
53	0.39
54	0.36
55	0.31
56	0.28
57	0.26
58	0.25
59	0.26
60	0.27
61	0.22
62	0.2
63	0.19
64	0.21
65	0.21
66	0.19
67	0.16
68	0.15
69	0.17
70	0.16
71	0.18
72	0.19
73	0.19
74	0.25
75	0.28
76	0.32
77	0.36
78	0.41
79	0.48
80	0.54
81	0.63
82	0.68
83	0.76
84	0.81
85	0.87
86	0.91
87	0.91
88	0.9
89	0.88
90	0.88
91	0.86
92	0.87
93	0.82
94	0.76
95	0.68
96	0.59
97	0.5
98	0.4
99	0.31
100	0.23
101	0.16
102	0.14
103	0.14
104	0.18
105	0.24
106	0.31
107	0.35
108	0.38
109	0.43
110	0.46
111	0.47
112	0.48
113	0.45
114	0.44
115	0.42
116	0.4
117	0.35
118	0.32
119	0.32
120	0.29
121	0.24
122	0.18
123	0.15
124	0.12
125	0.13
126	0.13
127	0.11
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.09
132	0.09
133	0.08
134	0.09
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.08
143	0.06
144	0.04
145	0.03
146	0.03
147	0.04
148	0.04
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.06
154	0.07
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.09
159	0.1
160	0.09
161	0.1
162	0.12
163	0.13
164	0.15
165	0.16
166	0.16
167	0.16
168	0.16
169	0.16
170	0.15
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.16
175	0.15
176	0.16
177	0.16
178	0.15
179	0.18
180	0.16
181	0.13
182	0.18
183	0.21
184	0.28
185	0.32
186	0.33
187	0.31
188	0.37
189	0.38
190	0.34
191	0.32
192	0.25
193	0.22
194	0.22
195	0.21
196	0.15
197	0.13
198	0.11
199	0.1
200	0.11
201	0.12
202	0.13
203	0.14
204	0.15
205	0.16
206	0.22
207	0.24
208	0.25
209	0.27
210	0.24
211	0.25
212	0.27
213	0.26
214	0.24
215	0.25
216	0.24
217	0.21
218	0.26
219	0.26
220	0.27
221	0.28
222	0.25
223	0.23
224	0.2
225	0.22
226	0.17
227	0.17
228	0.15
229	0.14
230	0.14
231	0.13
232	0.13
233	0.11
234	0.1
235	0.09
236	0.07
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.04
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.08
265	0.09
266	0.09
267	0.11
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.11
272	0.1
273	0.11
274	0.12
275	0.1
276	0.09
277	0.1
278	0.13
279	0.19
280	0.2
281	0.21
282	0.22
283	0.23
284	0.24
285	0.28
286	0.26
287	0.26
288	0.28
289	0.27
290	0.25
291	0.24
292	0.24
293	0.19
294	0.18
295	0.11
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.1
303	0.12
304	0.16
305	0.19
306	0.24
307	0.28
308	0.34
309	0.39
310	0.47
311	0.55
312	0.61
313	0.66
314	0.71
315	0.73
316	0.73
317	0.72
318	0.64
319	0.54
320	0.49
321	0.41
322	0.31
323	0.25
324	0.19
325	0.16
326	0.17
327	0.18
328	0.15
329	0.16
330	0.18
331	0.25
332	0.28
333	0.29
334	0.33
335	0.33
336	0.33
337	0.33
338	0.34
339	0.31
340	0.31
341	0.32
342	0.33
343	0.36
344	0.38
345	0.36
346	0.37
347	0.33
348	0.32
349	0.33
350	0.28
351	0.26
352	0.23
353	0.22
354	0.19
355	0.18
356	0.17
357	0.13
358	0.13
359	0.08
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.08
369	0.08
370	0.1
371	0.1
372	0.11
373	0.22
374	0.32
375	0.42
376	0.49
377	0.54
378	0.62
379	0.68
380	0.75
381	0.75
382	0.75
383	0.74
384	0.75
385	0.8
386	0.79
387	0.82
388	0.83
389	0.81
390	0.78
391	0.74
392	0.74
393	0.76
394	0.75
395	0.75
396	0.74
397	0.76
398	0.79
399	0.85
400	0.85
401	0.84
402	0.86
403	0.87
404	0.86
405	0.84
406	0.83
407	0.81
408	0.8
409	0.76
410	0.73
411	0.67
412	0.64
413	0.62
414	0.6
415	0.61
416	0.59
417	0.59
418	0.6
419	0.65
420	0.63
421	0.63
422	0.66
423	0.65
424	0.66
425	0.65
426	0.59
427	0.57
428	0.56
429	0.56
430	0.56
431	0.55
432	0.49
433	0.48
434	0.48
435	0.4
436	0.41
437	0.35
438	0.26
439	0.19
440	0.17
441	0.18
442	0.2
443	0.21
444	0.21
445	0.23
446	0.24
447	0.28
448	0.37
449	0.41
450	0.43
451	0.51
452	0.58
453	0.66
454	0.72
455	0.79
456	0.8
457	0.83
458	0.87
459	0.89
460	0.91
461	0.91
462	0.93
463	0.93
464	0.94
465	0.92
466	0.92
467	0.91
468	0.89
469	0.83
470	0.77
471	0.7
472	0.68
473	0.59
474	0.52
475	0.52
476	0.47
477	0.51
478	0.55
479	0.58
480	0.58

W2RLC5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer