Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2SC33

Protein Details
Accession W2SC33    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MPPKKKLKGSAAPPRAPRRPRASQAIRPHFNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-22PKKKLKGSAAPPRAPRRPRA
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10.5, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019145  Mediator_Med10  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF09748  Med10  
Amino Acid Sequences MPPKKKLKGSAAPPRAPRRPRASQAIRPHFNTHTTTNGSQFTVHYYLPADPAVPIVRADPERTYNIVGDGETSRTTIFVTLRVPPDKYRHLHRSWSRPIETALPLTPATSFLTLTYRKPTAAREPPQINDAAKGTTNADLDDSAIDVGTPVAGFLDSPGRSAEPGTGVVVPPEPGGHFQPSVGTSSIESPAASAQQRNAVSDSLRPLTLRDQSGVTAKSPFGRSTPTAAINPLQARAAEARKHSAVDSSEGSGHSSTSPVGLRPSGRVGQWSGLQFQQQTQPLGRKVPTNPVLFERQSALVAKPAHSPLIQAQGLTNVDADHQVTTLDLLDSLPSRTSHHDTGTHIASGSEEADVGKTNVPDGRAGEANQRGCPLLASEHPPRPRPLSAFTPVSGLPRRLVVKLKLPIGYTLNENMAPTRDPSDVSGVIKDIVDDLYDVQSKTHGFIPETQNLLIDKIGDMAEKLATLKDLTDPQINPNNPIHDVRIAPEIVDYVDDGRNPDIFTREFVENVQRGNSVINGKKQAFRDFSVIFAKALKQGIGGVDKHVDQIMENAGLEQELDEAMKKDKSKGTENGAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.8
4 0.79
5 0.77
6 0.77
7 0.77
8 0.79
9 0.79
10 0.79
11 0.83
12 0.85
13 0.82
14 0.77
15 0.74
16 0.66
17 0.62
18 0.56
19 0.48
20 0.44
21 0.44
22 0.42
23 0.41
24 0.4
25 0.36
26 0.33
27 0.3
28 0.29
29 0.26
30 0.24
31 0.21
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.21
36 0.15
37 0.12
38 0.15
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.18
44 0.19
45 0.22
46 0.23
47 0.25
48 0.28
49 0.3
50 0.31
51 0.26
52 0.27
53 0.24
54 0.21
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.15
59 0.15
60 0.13
61 0.12
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.21
68 0.27
69 0.3
70 0.32
71 0.34
72 0.41
73 0.46
74 0.48
75 0.52
76 0.55
77 0.56
78 0.64
79 0.67
80 0.71
81 0.73
82 0.77
83 0.7
84 0.63
85 0.6
86 0.55
87 0.5
88 0.42
89 0.33
90 0.27
91 0.24
92 0.22
93 0.2
94 0.16
95 0.15
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.17
100 0.18
101 0.21
102 0.25
103 0.24
104 0.25
105 0.27
106 0.31
107 0.35
108 0.43
109 0.47
110 0.5
111 0.53
112 0.53
113 0.53
114 0.51
115 0.42
116 0.34
117 0.29
118 0.22
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.09
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.16
169 0.15
170 0.13
171 0.11
172 0.13
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.17
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.17
187 0.17
188 0.19
189 0.21
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.19
195 0.23
196 0.21
197 0.19
198 0.18
199 0.19
200 0.23
201 0.22
202 0.19
203 0.16
204 0.15
205 0.18
206 0.19
207 0.18
208 0.15
209 0.18
210 0.19
211 0.22
212 0.24
213 0.23
214 0.22
215 0.23
216 0.23
217 0.22
218 0.22
219 0.18
220 0.15
221 0.12
222 0.13
223 0.15
224 0.18
225 0.17
226 0.18
227 0.21
228 0.21
229 0.22
230 0.2
231 0.2
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.12
240 0.11
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.18
258 0.17
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.18
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.21
269 0.21
270 0.24
271 0.23
272 0.22
273 0.22
274 0.29
275 0.33
276 0.31
277 0.3
278 0.3
279 0.34
280 0.3
281 0.3
282 0.23
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.16
291 0.16
292 0.16
293 0.15
294 0.15
295 0.12
296 0.19
297 0.17
298 0.15
299 0.14
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.13
324 0.18
325 0.19
326 0.21
327 0.23
328 0.24
329 0.27
330 0.26
331 0.22
332 0.18
333 0.16
334 0.14
335 0.12
336 0.1
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.13
351 0.13
352 0.14
353 0.19
354 0.22
355 0.23
356 0.23
357 0.23
358 0.2
359 0.19
360 0.18
361 0.13
362 0.11
363 0.11
364 0.17
365 0.22
366 0.28
367 0.32
368 0.34
369 0.36
370 0.38
371 0.39
372 0.37
373 0.37
374 0.36
375 0.38
376 0.38
377 0.35
378 0.33
379 0.3
380 0.32
381 0.29
382 0.24
383 0.2
384 0.21
385 0.23
386 0.23
387 0.28
388 0.26
389 0.32
390 0.35
391 0.38
392 0.36
393 0.35
394 0.35
395 0.32
396 0.3
397 0.24
398 0.21
399 0.19
400 0.17
401 0.17
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.13
406 0.14
407 0.13
408 0.14
409 0.15
410 0.19
411 0.19
412 0.2
413 0.19
414 0.16
415 0.16
416 0.15
417 0.14
418 0.1
419 0.08
420 0.07
421 0.06
422 0.07
423 0.09
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.13
428 0.13
429 0.15
430 0.18
431 0.17
432 0.17
433 0.24
434 0.3
435 0.33
436 0.36
437 0.34
438 0.31
439 0.29
440 0.28
441 0.21
442 0.16
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.11
457 0.14
458 0.16
459 0.22
460 0.22
461 0.28
462 0.36
463 0.36
464 0.38
465 0.38
466 0.39
467 0.36
468 0.37
469 0.34
470 0.28
471 0.28
472 0.26
473 0.27
474 0.23
475 0.2
476 0.18
477 0.16
478 0.13
479 0.12
480 0.11
481 0.09
482 0.11
483 0.12
484 0.13
485 0.14
486 0.15
487 0.15
488 0.16
489 0.18
490 0.17
491 0.19
492 0.22
493 0.21
494 0.21
495 0.22
496 0.29
497 0.27
498 0.28
499 0.27
500 0.23
501 0.22
502 0.23
503 0.25
504 0.24
505 0.28
506 0.33
507 0.38
508 0.41
509 0.46
510 0.49
511 0.53
512 0.5
513 0.48
514 0.48
515 0.41
516 0.42
517 0.42
518 0.39
519 0.31
520 0.28
521 0.27
522 0.25
523 0.26
524 0.22
525 0.17
526 0.17
527 0.21
528 0.24
529 0.22
530 0.21
531 0.22
532 0.22
533 0.23
534 0.22
535 0.19
536 0.14
537 0.16
538 0.16
539 0.15
540 0.15
541 0.14
542 0.13
543 0.12
544 0.12
545 0.09
546 0.07
547 0.06
548 0.06
549 0.08
550 0.1
551 0.13
552 0.18
553 0.2
554 0.26
555 0.31
556 0.37
557 0.43
558 0.49