FuNGI

W2RKA1

Protein Details

Accession

W2RKA1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
116-140	VPLAKSKPNGKVAKKPPRASNQQIG	Hydrophilic
165-191	EKDAQKIRKADKPKKVKKEESSDDDKP	Basic
779-802	AAKELEKKYKKENKTKKVEAEGKS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
123-131	PNGKVAKKP
157-226	KQKIEAKAEKDAQKIRKADKPKKVKKEESSDDDKPLKKTKPAPAAKAKTKVKVESPAPKKAAGKKAAVKK
364-376	KKALPAAEKKKLK
494-508	KARELKKHIDKIRKD
758-795	EKLKAEGEKEMKHKELEERLEAAKELEKKYKKENKTKK

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_nucl 13, nucl 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011010 DNA_brk_join_enz IPR013034 DNA_topo_DNA_db_N_dom1 IPR013030 DNA_topo_DNA_db_N_dom2 IPR001631 TopoI IPR025834 TopoI_C_dom IPR014711 TopoI_cat_a-hlx-sub_euk IPR014727 TopoI_cat_a/b-sub_euk IPR013500 TopoI_cat_euk IPR008336 TopoI_DNA-bd_euk IPR036202 TopoI_DNA-bd_euk_N_sf IPR013499 TopoI_euk
Gene Ontology	GO:0005694 C:chromosome GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003917 F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity GO:0006265 P:DNA topological change
Pfam	View protein in Pfam PF14370 Topo_C_assoc PF01028 Topoisom_I PF02919 Topoisom_I_N
CDD	cd00659 Topo_IB_C

Amino Acid Sequences

MASSSDDDMPISKARKNGVNGTSAPPVSSAKIPSSLDRQMDKTLPTNGEIQPGISIRNGPLTEDVEMKDTNGSAAPAKRKVSRPSYAEEESSDDDKPIIKKRKTQPETAVESDSDVPLAKSKPNGKVAKKPPRASNQQIGEDSDSDVPIQKKLIHEKQKIEAKAEKDAQKIRKADKPKKVKKEESSDDDKPLKKTKPAPAAKAKTKVKVESPAPKKAAGKKAAVKKEETEDPEEDDEDEGTNWWDDPTKGDGTNKWETLQHSGVVFPPPYQPLPKNVKLKYDGIPLTLHPDAEEVAGFFGGMLNSTHNVENPTFQKNFFNDFKEILKKTGGAKGPNGEKVDVKDFKKCDFKPIFDHYDAERAAKKALPAAEKKKLKAEKDAAEAPYMYCTWDGKKQKVGNFRVEPPGLFRGRGEHPKTGHVKTRVPPEQITLNIGKEATVPAPPEGHKWKEIKHDKQGTWLAMWQENINGNYKYVMLAANSDVKGQSDYKKFEKARELKKHIDKIRKDYRKNLKAEMMADRQKATAMYFIDQFALRAGNEKGDDEAETVGCCSLKYEHITLKEPNKVIFDFLGKDSIRFHEEFDVDQQVFKNLKIFKKAPKGEGDDIFDRLTTTQLNNHLKNYMPGLTAKVFRTYNASYTMATLLKDMKAEGTHAEKVKAYNDANRKVAILCNHKRTVAASHENTMEKLSERIKAVKYQQWRLKHMILDLDPKQKKKKGAEWFELPDDMDEEWVKEHQAFLVEEAKNKITKKFEKDNEKLKAEGEKEMKHKELEERLEAAKELEKKYKKENKTKKVEAEGKSITVEKLEENIKKFDQRIENMTVQAEDKESNKEVALGTSKINYIDPRLTVVFTKKFNVPIEKFFSKTLREKFEWAIKSVEEDWEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.38
3	0.42
4	0.48
5	0.46
6	0.5
7	0.49
8	0.5
9	0.51
10	0.44
11	0.39
12	0.32
13	0.3
14	0.26
15	0.27
16	0.26
17	0.22
18	0.28
19	0.29
20	0.32
21	0.37
22	0.4
23	0.42
24	0.43
25	0.43
26	0.43
27	0.45
28	0.44
29	0.41
30	0.42
31	0.38
32	0.36
33	0.38
34	0.34
35	0.36
36	0.32
37	0.28
38	0.25
39	0.24
40	0.24
41	0.19
42	0.2
43	0.15
44	0.22
45	0.22
46	0.2
47	0.23
48	0.24
49	0.24
50	0.25
51	0.25
52	0.21
53	0.21
54	0.2
55	0.18
56	0.16
57	0.15
58	0.13
59	0.13
60	0.15
61	0.21
62	0.27
63	0.32
64	0.37
65	0.43
66	0.5
67	0.58
68	0.61
69	0.64
70	0.61
71	0.61
72	0.64
73	0.61
74	0.55
75	0.47
76	0.43
77	0.39
78	0.37
79	0.31
80	0.23
81	0.2
82	0.23
83	0.26
84	0.32
85	0.38
86	0.41
87	0.5
88	0.6
89	0.71
90	0.72
91	0.76
92	0.75
93	0.74
94	0.77
95	0.71
96	0.63
97	0.52
98	0.5
99	0.42
100	0.33
101	0.24
102	0.16
103	0.13
104	0.15
105	0.16
106	0.16
107	0.22
108	0.29
109	0.36
110	0.45
111	0.54
112	0.56
113	0.65
114	0.74
115	0.78
116	0.81
117	0.8
118	0.79
119	0.8
120	0.83
121	0.81
122	0.79
123	0.75
124	0.71
125	0.66
126	0.6
127	0.53
128	0.44
129	0.38
130	0.3
131	0.23
132	0.17
133	0.2
134	0.18
135	0.17
136	0.18
137	0.18
138	0.23
139	0.33
140	0.42
141	0.48
142	0.54
143	0.58
144	0.65
145	0.7
146	0.67
147	0.63
148	0.59
149	0.51
150	0.53
151	0.55
152	0.51
153	0.5
154	0.55
155	0.57
156	0.58
157	0.62
158	0.58
159	0.59
160	0.64
161	0.68
162	0.7
163	0.75
164	0.78
165	0.82
166	0.87
167	0.89
168	0.87
169	0.88
170	0.86
171	0.83
172	0.81
173	0.73
174	0.7
175	0.67
176	0.62
177	0.56
178	0.55
179	0.52
180	0.5
181	0.55
182	0.57
183	0.61
184	0.65
185	0.69
186	0.71
187	0.76
188	0.77
189	0.78
190	0.74
191	0.72
192	0.7
193	0.65
194	0.59
195	0.58
196	0.57
197	0.58
198	0.59
199	0.6
200	0.57
201	0.57
202	0.58
203	0.58
204	0.6
205	0.55
206	0.56
207	0.55
208	0.63
209	0.67
210	0.64
211	0.58
212	0.52
213	0.52
214	0.51
215	0.47
216	0.43
217	0.36
218	0.36
219	0.35
220	0.32
221	0.27
222	0.21
223	0.17
224	0.13
225	0.12
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.1
234	0.14
235	0.16
236	0.17
237	0.19
238	0.22
239	0.27
240	0.33
241	0.31
242	0.28
243	0.29
244	0.29
245	0.32
246	0.31
247	0.25
248	0.2
249	0.2
250	0.2
251	0.21
252	0.19
253	0.14
254	0.15
255	0.16
256	0.18
257	0.22
258	0.22
259	0.27
260	0.36
261	0.43
262	0.49
263	0.48
264	0.53
265	0.52
266	0.54
267	0.49
268	0.48
269	0.41
270	0.34
271	0.33
272	0.27
273	0.28
274	0.25
275	0.21
276	0.13
277	0.13
278	0.12
279	0.11
280	0.11
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.11
296	0.11
297	0.15
298	0.17
299	0.21
300	0.21
301	0.21
302	0.25
303	0.25
304	0.31
305	0.3
306	0.31
307	0.28
308	0.29
309	0.32
310	0.34
311	0.33
312	0.29
313	0.26
314	0.25
315	0.25
316	0.3
317	0.3
318	0.25
319	0.26
320	0.3
321	0.32
322	0.35
323	0.34
324	0.29
325	0.26
326	0.27
327	0.32
328	0.33
329	0.3
330	0.32
331	0.32
332	0.35
333	0.43
334	0.41
335	0.44
336	0.42
337	0.43
338	0.44
339	0.49
340	0.5
341	0.42
342	0.44
343	0.35
344	0.36
345	0.34
346	0.29
347	0.24
348	0.19
349	0.19
350	0.18
351	0.17
352	0.15
353	0.18
354	0.22
355	0.26
356	0.32
357	0.4
358	0.43
359	0.44
360	0.49
361	0.52
362	0.48
363	0.5
364	0.5
365	0.45
366	0.47
367	0.5
368	0.42
369	0.37
370	0.35
371	0.26
372	0.21
373	0.16
374	0.12
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.17
379	0.22
380	0.23
381	0.31
382	0.35
383	0.4
384	0.48
385	0.51
386	0.52
387	0.51
388	0.51
389	0.49
390	0.45
391	0.4
392	0.33
393	0.35
394	0.26
395	0.23
396	0.2
397	0.19
398	0.23
399	0.31
400	0.31
401	0.3
402	0.31
403	0.37
404	0.42
405	0.41
406	0.43
407	0.39
408	0.41
409	0.4
410	0.49
411	0.47
412	0.45
413	0.42
414	0.37
415	0.36
416	0.31
417	0.3
418	0.22
419	0.17
420	0.15
421	0.14
422	0.12
423	0.1
424	0.1
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.1
431	0.14
432	0.18
433	0.19
434	0.23
435	0.24
436	0.27
437	0.36
438	0.45
439	0.47
440	0.52
441	0.58
442	0.53
443	0.58
444	0.58
445	0.48
446	0.39
447	0.36
448	0.28
449	0.21
450	0.21
451	0.15
452	0.13
453	0.14
454	0.15
455	0.16
456	0.14
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.11
461	0.09
462	0.09
463	0.06
464	0.07
465	0.08
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.12
472	0.13
473	0.18
474	0.19
475	0.23
476	0.25
477	0.34
478	0.34
479	0.37
480	0.46
481	0.48
482	0.54
483	0.61
484	0.65
485	0.65
486	0.72
487	0.76
488	0.73
489	0.74
490	0.68
491	0.67
492	0.71
493	0.72
494	0.68
495	0.7
496	0.73
497	0.72
498	0.71
499	0.65
500	0.59
501	0.52
502	0.51
503	0.47
504	0.43
505	0.39
506	0.37
507	0.33
508	0.28
509	0.26
510	0.24
511	0.18
512	0.15
513	0.11
514	0.12
515	0.12
516	0.12
517	0.13
518	0.12
519	0.12
520	0.09
521	0.09
522	0.07
523	0.09
524	0.09
525	0.1
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.09
532	0.1
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.07
541	0.09
542	0.12
543	0.15
544	0.18
545	0.21
546	0.25
547	0.29
548	0.33
549	0.36
550	0.35
551	0.33
552	0.32
553	0.29
554	0.27
555	0.23
556	0.19
557	0.16
558	0.15
559	0.2
560	0.17
561	0.17
562	0.18
563	0.19
564	0.21
565	0.19
566	0.2
567	0.18
568	0.19
569	0.2
570	0.21
571	0.23
572	0.19
573	0.2
574	0.19
575	0.18
576	0.19
577	0.18
578	0.21
579	0.21
580	0.25
581	0.31
582	0.35
583	0.39
584	0.49
585	0.53
586	0.52
587	0.53
588	0.57
589	0.54
590	0.54
591	0.5
592	0.41
593	0.39
594	0.34
595	0.27
596	0.21
597	0.16
598	0.14
599	0.11
600	0.1
601	0.13
602	0.21
603	0.29
604	0.3
605	0.31
606	0.32
607	0.31
608	0.31
609	0.3
610	0.23
611	0.17
612	0.16
613	0.18
614	0.19
615	0.22
616	0.22
617	0.24
618	0.22
619	0.21
620	0.27
621	0.25
622	0.25
623	0.25
624	0.26
625	0.21
626	0.22
627	0.24
628	0.19
629	0.17
630	0.16
631	0.14
632	0.13
633	0.13
634	0.12
635	0.11
636	0.11
637	0.11
638	0.13
639	0.15
640	0.2
641	0.21
642	0.22
643	0.22
644	0.23
645	0.24
646	0.27
647	0.24
648	0.27
649	0.34
650	0.38
651	0.39
652	0.38
653	0.37
654	0.32
655	0.35
656	0.34
657	0.36
658	0.38
659	0.44
660	0.45
661	0.44
662	0.44
663	0.42
664	0.4
665	0.38
666	0.4
667	0.34
668	0.36
669	0.39
670	0.39
671	0.38
672	0.33
673	0.26
674	0.18
675	0.19
676	0.19
677	0.19
678	0.21
679	0.26
680	0.27
681	0.33
682	0.38
683	0.41
684	0.47
685	0.53
686	0.58
687	0.6
688	0.63
689	0.62
690	0.61
691	0.56
692	0.51
693	0.47
694	0.43
695	0.43
696	0.43
697	0.47
698	0.47
699	0.51
700	0.57
701	0.56
702	0.61
703	0.62
704	0.65
705	0.66
706	0.71
707	0.73
708	0.72
709	0.71
710	0.66
711	0.59
712	0.5
713	0.39
714	0.31
715	0.23
716	0.18
717	0.13
718	0.11
719	0.11
720	0.11
721	0.11
722	0.1
723	0.11
724	0.1
725	0.13
726	0.13
727	0.14
728	0.22
729	0.22
730	0.25
731	0.28
732	0.29
733	0.3
734	0.32
735	0.35
736	0.36
737	0.43
738	0.49
739	0.56
740	0.62
741	0.69
742	0.76
743	0.8
744	0.79
745	0.74
746	0.66
747	0.58
748	0.57
749	0.48
750	0.48
751	0.44
752	0.42
753	0.45
754	0.5
755	0.5
756	0.44
757	0.45
758	0.44
759	0.47
760	0.46
761	0.43
762	0.41
763	0.4
764	0.4
765	0.37
766	0.31
767	0.28
768	0.29
769	0.29
770	0.35
771	0.4
772	0.43
773	0.53
774	0.62
775	0.67
776	0.72
777	0.79
778	0.8
779	0.84
780	0.9
781	0.87
782	0.88
783	0.86
784	0.79
785	0.77
786	0.69
787	0.59
788	0.53
789	0.46
790	0.35
791	0.28
792	0.24
793	0.17
794	0.19
795	0.24
796	0.27
797	0.29
798	0.34
799	0.36
800	0.41
801	0.42
802	0.46
803	0.47
804	0.46
805	0.49
806	0.51
807	0.5
808	0.47
809	0.46
810	0.39
811	0.31
812	0.28
813	0.23
814	0.19
815	0.17
816	0.21
817	0.22
818	0.22
819	0.21
820	0.22
821	0.21
822	0.23
823	0.26
824	0.21
825	0.21
826	0.22
827	0.23
828	0.22
829	0.24
830	0.22
831	0.23
832	0.25
833	0.24
834	0.27
835	0.27
836	0.28
837	0.29
838	0.35
839	0.36
840	0.35
841	0.38
842	0.37
843	0.42
844	0.47
845	0.53
846	0.49
847	0.51
848	0.57
849	0.57
850	0.55
851	0.53
852	0.52
853	0.5
854	0.54
855	0.55
856	0.55
857	0.54
858	0.57
859	0.59
860	0.63
861	0.59
862	0.53
863	0.48
864	0.39
865	0.41
866	0.38

W2RKA1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer