Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TFA8

Protein Details
Accession A7TFA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-116NNNHRRNATKSAKNRNNKSKNVTKKVHydrophilic
154-173GNNFQKKKFYNRNGNQQRRQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG vpo:Kpol_2000p101  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSVEVAKPIEIAEQAEKVKESEPVFTPAPVPTSSPWKSVSSDIPVTEITLDFSDNNRKRNVPAMKSSNATKWVPIKASIVISGSKSMNNGNNNHRRNATKSAKNRNNKSKNVTKKVQQQKDADVSDESKDGDNSNTNGVKSEKNDGKRLNNNNGNNFQKKKFYNRNGNQQRRQLNNNISRNDQFNRSSNTQNSLPPAFIAVNNVAAQVEYYFSEENLSKDTFLKSKMSKNGLVPLSLISQFYRVVNMSFGGDHNLILAAAREIVANENATVEIVTGKIESSEETESNLLSKYFVRSKNWSSHIPDESASDVEIEDVLVGDVMDAFRISFVPPTEDAPSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.22
4 0.21
5 0.22
6 0.25
7 0.23
8 0.23
9 0.25
10 0.29
11 0.29
12 0.28
13 0.29
14 0.24
15 0.26
16 0.22
17 0.21
18 0.19
19 0.27
20 0.29
21 0.3
22 0.32
23 0.32
24 0.33
25 0.35
26 0.37
27 0.35
28 0.36
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.27
33 0.24
34 0.19
35 0.14
36 0.11
37 0.12
38 0.11
39 0.14
40 0.24
41 0.27
42 0.31
43 0.33
44 0.34
45 0.35
46 0.44
47 0.5
48 0.46
49 0.51
50 0.54
51 0.54
52 0.55
53 0.56
54 0.51
55 0.48
56 0.42
57 0.37
58 0.35
59 0.36
60 0.35
61 0.34
62 0.31
63 0.28
64 0.29
65 0.25
66 0.22
67 0.19
68 0.18
69 0.19
70 0.17
71 0.15
72 0.15
73 0.18
74 0.22
75 0.25
76 0.3
77 0.37
78 0.46
79 0.48
80 0.51
81 0.51
82 0.49
83 0.49
84 0.54
85 0.53
86 0.52
87 0.59
88 0.67
89 0.72
90 0.79
91 0.83
92 0.84
93 0.84
94 0.82
95 0.81
96 0.79
97 0.81
98 0.79
99 0.76
100 0.72
101 0.73
102 0.77
103 0.77
104 0.74
105 0.67
106 0.64
107 0.65
108 0.58
109 0.49
110 0.4
111 0.34
112 0.27
113 0.24
114 0.19
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.26
129 0.27
130 0.29
131 0.35
132 0.38
133 0.43
134 0.5
135 0.54
136 0.56
137 0.58
138 0.58
139 0.57
140 0.59
141 0.57
142 0.54
143 0.51
144 0.44
145 0.43
146 0.42
147 0.46
148 0.5
149 0.54
150 0.6
151 0.62
152 0.72
153 0.76
154 0.83
155 0.8
156 0.77
157 0.75
158 0.67
159 0.65
160 0.61
161 0.59
162 0.59
163 0.59
164 0.53
165 0.49
166 0.46
167 0.46
168 0.41
169 0.36
170 0.29
171 0.27
172 0.31
173 0.31
174 0.34
175 0.31
176 0.34
177 0.32
178 0.31
179 0.3
180 0.25
181 0.22
182 0.18
183 0.18
184 0.14
185 0.12
186 0.12
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.13
207 0.15
208 0.15
209 0.16
210 0.21
211 0.22
212 0.29
213 0.35
214 0.38
215 0.4
216 0.4
217 0.45
218 0.41
219 0.38
220 0.31
221 0.25
222 0.23
223 0.2
224 0.19
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.09
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.12
276 0.1
277 0.12
278 0.16
279 0.24
280 0.29
281 0.33
282 0.4
283 0.46
284 0.54
285 0.58
286 0.58
287 0.57
288 0.6
289 0.58
290 0.53
291 0.47
292 0.4
293 0.37
294 0.31
295 0.24
296 0.17
297 0.13
298 0.11
299 0.1
300 0.08
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.1
316 0.12
317 0.16
318 0.17
319 0.21