Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2SBP0

Protein Details
Accession W2SBP0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
844-865GARPEGRKKRVFDVHKKKVITKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
847-868PEGRKKRVFDVHKKKVITKGKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021665  Mediator_Med16  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF11635  Med16  
Amino Acid Sequences MENEFNADPFFNDGPLQQINEGSLQQIDQIDPAGVGIDALNNVPLPVNPLIVQRILNLHQGGSSTRLCWSRQGHIANISEDGSSIDLHCLVFDRTRRTWVVGAKRTEHVGLGELASLAWSPMATDIAVVDTRGRLSILRPTGTAANRLSEVRSGTIDDIQDLGQAIGMGWLSQDRAERPKQVVQFTSKQEGGDKWVHNLVKAMPMQPLYQRAIVVINRQGTMALVYEKPDSTFAKTTSQLAPKTDTIFTHAAFSPTTEGKLMVALHAHDGTLSAYHVSIDFSPMRQDPDALPLLNSQLAASRFPRIGNTSIDGQMYDSDSQCLTHLGIIPTSEIEKTAPQPPTVYGIYANINKNMGATDGGFISSGTIRRWTLSSVHQTLLPKFNHLPDKATNSAPVFTTSVQLLPEKEEQGITNAGVLDNGQGLFITTLDGRTDFLATEDLSSLSFAASENTTSSLAQSGFNFPLLSNQTSISLSPNVCCSAVLSPASTVSLVPADFHPPTAESSQSLDPTSSSADAAAAVIVLSFARSCWTNSNIDDLLSMVLHTFSASMATPLIVSLYHTLFREGEFMHEKDSRSELEKVVQKPVLTKVFSFHYGVAFLSIKDVPPSSPIPLSAQWVWVAANLRFVAQLLYISIREVQNPSAEPSSELVEMVCGNIKWTLDLVRYIAASIFEVSDRETNPEFFDKPQGGHVVDGSQGLVALLLNCHWSRQFFIAIVRAMRVLCKLPEPRSAQQTEIIRTIMQWSQGKGLSLIAVEALLDPRWSGWADNELEGDLAKISSRQIRMMATGVVEGGFQGTVRRVLGKLFNVKGGMRDKGAVDRLKLWSHKVDLGWVLLDDEWEGARPEGRKKRVFDVHKKKVITKGKREIISGESGEEMIKRCVRCGRHNEDVNGMGKEFPRHVAGLMMRCVCDGPWIVEPWAKAIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.21
4 0.17
5 0.17
6 0.18
7 0.19
8 0.19
9 0.16
10 0.14
11 0.12
12 0.14
13 0.15
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.1
19 0.1
20 0.08
21 0.07
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.08
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.18
37 0.2
38 0.22
39 0.22
40 0.19
41 0.23
42 0.24
43 0.28
44 0.26
45 0.23
46 0.22
47 0.23
48 0.22
49 0.22
50 0.21
51 0.16
52 0.21
53 0.24
54 0.24
55 0.31
56 0.34
57 0.36
58 0.43
59 0.46
60 0.45
61 0.49
62 0.51
63 0.44
64 0.41
65 0.35
66 0.27
67 0.23
68 0.19
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.17
79 0.21
80 0.27
81 0.29
82 0.35
83 0.36
84 0.38
85 0.42
86 0.45
87 0.5
88 0.51
89 0.55
90 0.53
91 0.54
92 0.52
93 0.47
94 0.4
95 0.3
96 0.24
97 0.2
98 0.16
99 0.14
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.06
105 0.05
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.09
122 0.11
123 0.19
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.26
128 0.32
129 0.33
130 0.36
131 0.29
132 0.26
133 0.26
134 0.27
135 0.26
136 0.22
137 0.22
138 0.18
139 0.18
140 0.18
141 0.18
142 0.2
143 0.19
144 0.16
145 0.16
146 0.14
147 0.14
148 0.12
149 0.1
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.1
161 0.12
162 0.19
163 0.24
164 0.29
165 0.33
166 0.39
167 0.43
168 0.46
169 0.47
170 0.48
171 0.51
172 0.51
173 0.53
174 0.47
175 0.42
176 0.4
177 0.36
178 0.35
179 0.35
180 0.31
181 0.28
182 0.33
183 0.32
184 0.3
185 0.31
186 0.26
187 0.25
188 0.26
189 0.25
190 0.21
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.28
195 0.24
196 0.24
197 0.22
198 0.2
199 0.23
200 0.23
201 0.24
202 0.24
203 0.24
204 0.23
205 0.23
206 0.22
207 0.17
208 0.17
209 0.14
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.16
218 0.19
219 0.22
220 0.22
221 0.25
222 0.26
223 0.29
224 0.33
225 0.37
226 0.34
227 0.33
228 0.35
229 0.32
230 0.35
231 0.33
232 0.27
233 0.26
234 0.26
235 0.24
236 0.23
237 0.22
238 0.2
239 0.18
240 0.18
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.13
248 0.12
249 0.09
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.13
270 0.14
271 0.17
272 0.16
273 0.17
274 0.15
275 0.19
276 0.21
277 0.18
278 0.18
279 0.15
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.18
292 0.18
293 0.2
294 0.2
295 0.21
296 0.21
297 0.21
298 0.21
299 0.19
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.1
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.11
324 0.17
325 0.18
326 0.18
327 0.19
328 0.19
329 0.23
330 0.21
331 0.19
332 0.13
333 0.14
334 0.17
335 0.21
336 0.21
337 0.18
338 0.18
339 0.17
340 0.17
341 0.15
342 0.12
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.14
360 0.19
361 0.25
362 0.26
363 0.26
364 0.28
365 0.29
366 0.3
367 0.34
368 0.29
369 0.25
370 0.23
371 0.28
372 0.32
373 0.3
374 0.32
375 0.27
376 0.33
377 0.33
378 0.32
379 0.3
380 0.24
381 0.24
382 0.21
383 0.2
384 0.15
385 0.13
386 0.13
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.1
392 0.12
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.1
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.1
449 0.11
450 0.11
451 0.09
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.12
456 0.12
457 0.13
458 0.13
459 0.14
460 0.11
461 0.12
462 0.11
463 0.11
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.1
469 0.08
470 0.1
471 0.1
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.08
477 0.06
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.06
483 0.09
484 0.09
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.09
492 0.12
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.12
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.08
501 0.07
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.04
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.02
512 0.02
513 0.02
514 0.02
515 0.04
516 0.05
517 0.06
518 0.09
519 0.12
520 0.15
521 0.15
522 0.2
523 0.19
524 0.19
525 0.17
526 0.15
527 0.12
528 0.09
529 0.09
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.03
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.05
544 0.04
545 0.05
546 0.06
547 0.07
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.12
554 0.1
555 0.13
556 0.16
557 0.16
558 0.19
559 0.22
560 0.22
561 0.21
562 0.23
563 0.21
564 0.21
565 0.23
566 0.19
567 0.23
568 0.29
569 0.29
570 0.32
571 0.32
572 0.28
573 0.28
574 0.33
575 0.32
576 0.27
577 0.25
578 0.23
579 0.24
580 0.26
581 0.25
582 0.19
583 0.15
584 0.14
585 0.14
586 0.14
587 0.12
588 0.1
589 0.11
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.09
595 0.12
596 0.13
597 0.13
598 0.13
599 0.14
600 0.16
601 0.17
602 0.21
603 0.18
604 0.18
605 0.16
606 0.16
607 0.15
608 0.14
609 0.15
610 0.11
611 0.14
612 0.13
613 0.13
614 0.13
615 0.13
616 0.11
617 0.08
618 0.08
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.08
623 0.1
624 0.1
625 0.12
626 0.13
627 0.14
628 0.15
629 0.16
630 0.18
631 0.17
632 0.16
633 0.16
634 0.16
635 0.17
636 0.14
637 0.13
638 0.1
639 0.09
640 0.09
641 0.08
642 0.09
643 0.06
644 0.07
645 0.08
646 0.09
647 0.08
648 0.09
649 0.11
650 0.11
651 0.12
652 0.12
653 0.12
654 0.12
655 0.12
656 0.11
657 0.09
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.07
662 0.07
663 0.09
664 0.11
665 0.11
666 0.15
667 0.15
668 0.16
669 0.18
670 0.22
671 0.21
672 0.2
673 0.26
674 0.23
675 0.22
676 0.25
677 0.25
678 0.22
679 0.21
680 0.2
681 0.15
682 0.15
683 0.14
684 0.11
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.05
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.08
694 0.08
695 0.09
696 0.1
697 0.11
698 0.13
699 0.16
700 0.17
701 0.15
702 0.18
703 0.21
704 0.23
705 0.22
706 0.2
707 0.19
708 0.17
709 0.17
710 0.17
711 0.15
712 0.14
713 0.2
714 0.26
715 0.28
716 0.37
717 0.43
718 0.46
719 0.51
720 0.52
721 0.47
722 0.46
723 0.48
724 0.43
725 0.38
726 0.33
727 0.25
728 0.23
729 0.25
730 0.21
731 0.22
732 0.22
733 0.21
734 0.24
735 0.25
736 0.26
737 0.23
738 0.21
739 0.16
740 0.13
741 0.12
742 0.08
743 0.06
744 0.06
745 0.06
746 0.06
747 0.06
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.08
752 0.09
753 0.09
754 0.1
755 0.16
756 0.18
757 0.19
758 0.19
759 0.17
760 0.17
761 0.16
762 0.15
763 0.09
764 0.07
765 0.06
766 0.06
767 0.09
768 0.15
769 0.17
770 0.19
771 0.21
772 0.22
773 0.24
774 0.25
775 0.23
776 0.17
777 0.16
778 0.14
779 0.12
780 0.1
781 0.08
782 0.07
783 0.05
784 0.05
785 0.06
786 0.07
787 0.09
788 0.1
789 0.12
790 0.12
791 0.16
792 0.22
793 0.27
794 0.34
795 0.33
796 0.36
797 0.36
798 0.36
799 0.39
800 0.38
801 0.34
802 0.27
803 0.28
804 0.26
805 0.3
806 0.37
807 0.34
808 0.32
809 0.34
810 0.37
811 0.41
812 0.42
813 0.4
814 0.39
815 0.39
816 0.41
817 0.36
818 0.36
819 0.31
820 0.3
821 0.27
822 0.21
823 0.19
824 0.14
825 0.14
826 0.1
827 0.09
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.09
832 0.12
833 0.16
834 0.26
835 0.35
836 0.44
837 0.5
838 0.53
839 0.62
840 0.69
841 0.76
842 0.77
843 0.79
844 0.81
845 0.82
846 0.81
847 0.76
848 0.76
849 0.77
850 0.76
851 0.75
852 0.75
853 0.76
854 0.75
855 0.71
856 0.65
857 0.58
858 0.54
859 0.44
860 0.35
861 0.27
862 0.24
863 0.23
864 0.21
865 0.2
866 0.19
867 0.23
868 0.22
869 0.26
870 0.33
871 0.39
872 0.47
873 0.54
874 0.57
875 0.62
876 0.69
877 0.68
878 0.66
879 0.65
880 0.58
881 0.5
882 0.42
883 0.35
884 0.3
885 0.3
886 0.27
887 0.24
888 0.24
889 0.23
890 0.23
891 0.26
892 0.29
893 0.31
894 0.35
895 0.34
896 0.32
897 0.31
898 0.31
899 0.25
900 0.24
901 0.21
902 0.18
903 0.21
904 0.23
905 0.25
906 0.27
907 0.27