Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2SD78

Protein Details
Accession W2SD78    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-109WWNHRVKAGKDDRKREFKRNVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-104KRKKKLYAGSWWNHRVKAGKDDRKRE
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR003591  Leu-rich_rpt_typical-subtyp  
IPR032675  LRR_dom_sf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51450  LRR  
Amino Acid Sequences MSDNESNEPTLPPLPAPPSSSLTARRSTRPSLLTRKRTHSSYASDWDTTELPQSAASSDPALFSGDEAAPGLESYASGKRKKKLYAGSWWNHRVKAGKDDRKREFKRNVDSGVWMGSEDQLSSDSLGSMEEAFLGDQGVLVGKRSDGFSEERTGQEEEELVVEQRSATNQRITRSFPRISDLVTTPAFLPQREQVKDIVRQHLNSGKEDISFDGMGLVDLPDEVIELATLTKEPILVPGMLDTGRSFATRLHILLGNNLLTRMPCQLLELENLQYLSLRGNRLKSIPVGIRRLVNLQNLNISNNELRYLPFEVLELARNHSLSNLRTTANPWAETPAGLHVEAEEEPWPGTNSPLAAQRSKGPSSVVVSSSMPSLTEVVLRQLQRISPRDDLRDFMPEHTPARVLGALDDFRLTQVEGERRCTACWRPMVQPGEEWLEWWFVRISRMYVPFKRAKCYSGCDGKENMWVDTGVGHKNVVIQEDGTVTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.28
4 0.29
5 0.31
6 0.33
7 0.37
8 0.4
9 0.4
10 0.46
11 0.47
12 0.5
13 0.51
14 0.54
15 0.57
16 0.56
17 0.6
18 0.63
19 0.7
20 0.73
21 0.75
22 0.77
23 0.76
24 0.72
25 0.7
26 0.65
27 0.62
28 0.59
29 0.59
30 0.55
31 0.49
32 0.46
33 0.42
34 0.36
35 0.3
36 0.26
37 0.19
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.13
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.05
60 0.05
61 0.08
62 0.15
63 0.21
64 0.28
65 0.35
66 0.41
67 0.48
68 0.54
69 0.6
70 0.62
71 0.64
72 0.67
73 0.71
74 0.73
75 0.75
76 0.79
77 0.74
78 0.65
79 0.6
80 0.55
81 0.48
82 0.51
83 0.52
84 0.54
85 0.59
86 0.68
87 0.74
88 0.79
89 0.82
90 0.81
91 0.8
92 0.79
93 0.79
94 0.76
95 0.72
96 0.63
97 0.59
98 0.5
99 0.42
100 0.33
101 0.23
102 0.17
103 0.13
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.13
135 0.14
136 0.18
137 0.2
138 0.19
139 0.22
140 0.22
141 0.19
142 0.17
143 0.15
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.11
154 0.12
155 0.19
156 0.21
157 0.24
158 0.27
159 0.32
160 0.37
161 0.41
162 0.41
163 0.35
164 0.36
165 0.34
166 0.32
167 0.3
168 0.25
169 0.22
170 0.19
171 0.19
172 0.16
173 0.19
174 0.19
175 0.15
176 0.16
177 0.17
178 0.24
179 0.25
180 0.26
181 0.26
182 0.3
183 0.37
184 0.39
185 0.42
186 0.36
187 0.36
188 0.37
189 0.39
190 0.36
191 0.3
192 0.28
193 0.21
194 0.19
195 0.19
196 0.17
197 0.14
198 0.12
199 0.11
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.02
210 0.03
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.14
267 0.16
268 0.17
269 0.18
270 0.2
271 0.18
272 0.21
273 0.23
274 0.26
275 0.28
276 0.28
277 0.29
278 0.28
279 0.31
280 0.29
281 0.29
282 0.25
283 0.22
284 0.26
285 0.25
286 0.25
287 0.21
288 0.21
289 0.17
290 0.15
291 0.15
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.12
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.15
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.14
307 0.15
308 0.18
309 0.16
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.19
314 0.22
315 0.27
316 0.26
317 0.26
318 0.22
319 0.23
320 0.22
321 0.22
322 0.2
323 0.16
324 0.14
325 0.13
326 0.12
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.17
342 0.2
343 0.2
344 0.21
345 0.27
346 0.31
347 0.32
348 0.31
349 0.26
350 0.25
351 0.27
352 0.29
353 0.24
354 0.2
355 0.2
356 0.19
357 0.19
358 0.16
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.17
367 0.18
368 0.19
369 0.2
370 0.22
371 0.28
372 0.32
373 0.34
374 0.37
375 0.41
376 0.45
377 0.45
378 0.44
379 0.39
380 0.41
381 0.37
382 0.32
383 0.32
384 0.28
385 0.28
386 0.28
387 0.26
388 0.19
389 0.21
390 0.2
391 0.15
392 0.14
393 0.17
394 0.16
395 0.16
396 0.16
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.12
401 0.1
402 0.16
403 0.23
404 0.24
405 0.3
406 0.35
407 0.35
408 0.36
409 0.4
410 0.39
411 0.39
412 0.44
413 0.43
414 0.43
415 0.51
416 0.53
417 0.49
418 0.46
419 0.42
420 0.41
421 0.37
422 0.32
423 0.25
424 0.25
425 0.23
426 0.23
427 0.21
428 0.15
429 0.19
430 0.2
431 0.21
432 0.24
433 0.33
434 0.39
435 0.43
436 0.5
437 0.55
438 0.56
439 0.61
440 0.57
441 0.53
442 0.51
443 0.53
444 0.54
445 0.56
446 0.56
447 0.53
448 0.53
449 0.51
450 0.53
451 0.48
452 0.39
453 0.3
454 0.27
455 0.22
456 0.22
457 0.23
458 0.19
459 0.18
460 0.17
461 0.16
462 0.2
463 0.22
464 0.21
465 0.19
466 0.16
467 0.16