FuNGI

W2SCG1

Protein Details

Accession

W2SCG1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-296	EKAAAIVKRKEKKKNQPHMLNFSA	Hydrophilic
658-699	KDEREEHKSKAARKKERKAEQGKSTTNKEKARKKNFMMTLGK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
261-286	VNKKSKKAGRKLEKAAAIVKRKEKKK
663-728	EHKSKAARKKERKAEQGKSTTNKEKARKKNFMMTLGKARKKGKMSLVEQRKVLKAGENQQRGKKAR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, mito_nucl 12.833, mito 4, cyto_mito 3.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MVKRKLAALEKVEADLPNLQNKIKRDPASYENDFLHQYMQYENQRIIFVQSPSAATDSGLVSFRELIEFVAHVSDCYKEHTKDFSSHLIELLSLYHAQLESQLREKIVGSLMLLRKKEIITSITLLQCLFPILTTTPSKTFRALLFQKILSDLRSANTPTINHRLNRTLQTDLHNLVTSDKSSPKALWAVKITREMWKRQLWTDAKAVEIMKECALAEEEKVIVGGVRFFLGGDKEREELEDESSDEERIDMGKLKHQIGVNKKSKKAGRKLEKAAAIVKRKEKKKNQPHMLNFSALHLLHDPQSFAEDLFSRHLQNTRSKLNLEQKLQVLQLVSRLIGLHKLTVISFYSYFLKYLTPRQPSVTSFLASLAQATHNLVPPDVLEPLLQKIANEFISEAAAGEVAAAGLNAIREICVRQPLAMNETLLQDLVMYRKSKDKGVMMAAKGLMGLYRQVGAEMLKKRDRGKDASLNLKSGDQIQHRYGAEVAGEIEGLDLLEKWKEEERRNKGLEEGEEDDEEDWAAWNIEEDDSDDSGGWINVESDDEINISDSEDERTPKKPKLDENKENEQEKRDKNKPNLAMTRILTPADLAKLQELRTTASVSSLMKGHKSHHQAQQTNAQRHVDDPLTAAEIEGLASLSQGKATRAQKMALLQQQKDEREEHKSKAARKKERKAEQGKSTTNKEKARKKNFMMTLGKARKKGKMSLVEQRKVLKAGENQQRGKKAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.31
3	0.28
4	0.29
5	0.3
6	0.32
7	0.34
8	0.38
9	0.44
10	0.47
11	0.49
12	0.47
13	0.51
14	0.55
15	0.59
16	0.6
17	0.55
18	0.48
19	0.46
20	0.43
21	0.37
22	0.32
23	0.24
24	0.2
25	0.19
26	0.25
27	0.28
28	0.31
29	0.32
30	0.32
31	0.31
32	0.31
33	0.32
34	0.3
35	0.24
36	0.24
37	0.24
38	0.23
39	0.23
40	0.24
41	0.2
42	0.15
43	0.16
44	0.13
45	0.14
46	0.14
47	0.13
48	0.13
49	0.14
50	0.14
51	0.13
52	0.12
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.12
58	0.11
59	0.1
60	0.11
61	0.12
62	0.12
63	0.18
64	0.24
65	0.23
66	0.26
67	0.33
68	0.35
69	0.37
70	0.41
71	0.43
72	0.41
73	0.39
74	0.37
75	0.31
76	0.27
77	0.23
78	0.2
79	0.14
80	0.1
81	0.09
82	0.1
83	0.09
84	0.09
85	0.14
86	0.17
87	0.18
88	0.23
89	0.25
90	0.24
91	0.25
92	0.25
93	0.22
94	0.2
95	0.18
96	0.14
97	0.2
98	0.25
99	0.3
100	0.3
101	0.28
102	0.29
103	0.29
104	0.29
105	0.25
106	0.22
107	0.2
108	0.22
109	0.27
110	0.26
111	0.26
112	0.24
113	0.21
114	0.19
115	0.16
116	0.13
117	0.07
118	0.08
119	0.09
120	0.13
121	0.16
122	0.19
123	0.24
124	0.27
125	0.29
126	0.29
127	0.31
128	0.28
129	0.35
130	0.36
131	0.37
132	0.37
133	0.36
134	0.35
135	0.35
136	0.35
137	0.26
138	0.25
139	0.19
140	0.16
141	0.19
142	0.19
143	0.18
144	0.2
145	0.21
146	0.24
147	0.31
148	0.35
149	0.34
150	0.37
151	0.4
152	0.42
153	0.46
154	0.44
155	0.4
156	0.38
157	0.41
158	0.41
159	0.37
160	0.34
161	0.29
162	0.26
163	0.24
164	0.22
165	0.18
166	0.17
167	0.18
168	0.18
169	0.19
170	0.19
171	0.2
172	0.25
173	0.26
174	0.28
175	0.31
176	0.33
177	0.35
178	0.4
179	0.39
180	0.4
181	0.43
182	0.43
183	0.44
184	0.46
185	0.46
186	0.42
187	0.5
188	0.45
189	0.44
190	0.45
191	0.38
192	0.33
193	0.32
194	0.3
195	0.23
196	0.22
197	0.2
198	0.15
199	0.15
200	0.14
201	0.12
202	0.13
203	0.11
204	0.09
205	0.09
206	0.09
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.08
219	0.11
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.17
226	0.16
227	0.16
228	0.14
229	0.13
230	0.15
231	0.15
232	0.14
233	0.11
234	0.1
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.11
239	0.11
240	0.16
241	0.2
242	0.21
243	0.25
244	0.26
245	0.32
246	0.36
247	0.46
248	0.5
249	0.53
250	0.54
251	0.58
252	0.61
253	0.65
254	0.65
255	0.66
256	0.67
257	0.69
258	0.73
259	0.73
260	0.7
261	0.62
262	0.59
263	0.55
264	0.52
265	0.48
266	0.49
267	0.51
268	0.56
269	0.64
270	0.68
271	0.72
272	0.77
273	0.83
274	0.85
275	0.87
276	0.86
277	0.84
278	0.76
279	0.67
280	0.56
281	0.46
282	0.38
283	0.28
284	0.22
285	0.15
286	0.13
287	0.13
288	0.14
289	0.12
290	0.09
291	0.11
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.07
296	0.08
297	0.11
298	0.12
299	0.12
300	0.13
301	0.17
302	0.19
303	0.25
304	0.29
305	0.29
306	0.3
307	0.31
308	0.36
309	0.42
310	0.45
311	0.41
312	0.39
313	0.37
314	0.37
315	0.36
316	0.3
317	0.21
318	0.15
319	0.14
320	0.11
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.07
331	0.09
332	0.09
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.12
342	0.19
343	0.25
344	0.26
345	0.27
346	0.29
347	0.31
348	0.31
349	0.34
350	0.28
351	0.21
352	0.18
353	0.17
354	0.15
355	0.13
356	0.12
357	0.08
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.09
374	0.09
375	0.07
376	0.08
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.02
391	0.02
392	0.02
393	0.02
394	0.02
395	0.02
396	0.02
397	0.02
398	0.03
399	0.03
400	0.05
401	0.06
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.13
406	0.14
407	0.17
408	0.17
409	0.16
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.11
414	0.1
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.17
422	0.18
423	0.21
424	0.24
425	0.25
426	0.25
427	0.31
428	0.35
429	0.29
430	0.3
431	0.28
432	0.24
433	0.21
434	0.17
435	0.11
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.13
445	0.17
446	0.23
447	0.25
448	0.29
449	0.33
450	0.39
451	0.43
452	0.42
453	0.45
454	0.48
455	0.5
456	0.56
457	0.54
458	0.48
459	0.44
460	0.39
461	0.32
462	0.27
463	0.27
464	0.21
465	0.23
466	0.23
467	0.28
468	0.27
469	0.28
470	0.25
471	0.19
472	0.16
473	0.12
474	0.12
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.07
487	0.12
488	0.19
489	0.27
490	0.37
491	0.44
492	0.53
493	0.55
494	0.54
495	0.52
496	0.49
497	0.43
498	0.38
499	0.34
500	0.26
501	0.24
502	0.24
503	0.21
504	0.17
505	0.15
506	0.1
507	0.07
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.09
517	0.09
518	0.1
519	0.09
520	0.08
521	0.09
522	0.09
523	0.07
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.07
529	0.06
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.08
538	0.1
539	0.12
540	0.15
541	0.16
542	0.22
543	0.27
544	0.32
545	0.39
546	0.42
547	0.5
548	0.59
549	0.68
550	0.71
551	0.74
552	0.79
553	0.79
554	0.78
555	0.7
556	0.66
557	0.64
558	0.63
559	0.65
560	0.63
561	0.65
562	0.68
563	0.75
564	0.75
565	0.76
566	0.74
567	0.68
568	0.66
569	0.58
570	0.54
571	0.46
572	0.39
573	0.29
574	0.22
575	0.2
576	0.16
577	0.16
578	0.12
579	0.14
580	0.17
581	0.18
582	0.19
583	0.18
584	0.19
585	0.19
586	0.21
587	0.17
588	0.16
589	0.18
590	0.16
591	0.17
592	0.18
593	0.18
594	0.2
595	0.22
596	0.23
597	0.29
598	0.36
599	0.42
600	0.47
601	0.55
602	0.56
603	0.58
604	0.65
605	0.67
606	0.65
607	0.61
608	0.55
609	0.45
610	0.42
611	0.43
612	0.34
613	0.25
614	0.21
615	0.18
616	0.18
617	0.17
618	0.16
619	0.11
620	0.1
621	0.09
622	0.08
623	0.07
624	0.04
625	0.05
626	0.06
627	0.05
628	0.08
629	0.09
630	0.11
631	0.19
632	0.22
633	0.3
634	0.31
635	0.33
636	0.34
637	0.37
638	0.44
639	0.43
640	0.48
641	0.42
642	0.47
643	0.53
644	0.52
645	0.51
646	0.47
647	0.43
648	0.45
649	0.49
650	0.45
651	0.48
652	0.52
653	0.58
654	0.64
655	0.7
656	0.72
657	0.77
658	0.84
659	0.86
660	0.9
661	0.91
662	0.91
663	0.9
664	0.89
665	0.88
666	0.86
667	0.83
668	0.81
669	0.8
670	0.78
671	0.77
672	0.77
673	0.77
674	0.8
675	0.83
676	0.85
677	0.82
678	0.83
679	0.81
680	0.81
681	0.78
682	0.73
683	0.74
684	0.74
685	0.73
686	0.7
687	0.68
688	0.66
689	0.64
690	0.66
691	0.64
692	0.64
693	0.65
694	0.69
695	0.75
696	0.73
697	0.71
698	0.69
699	0.63
700	0.55
701	0.49
702	0.46
703	0.44
704	0.48
705	0.55
706	0.59
707	0.63
708	0.68

W2SCG1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer