FuNGI

W2S5D4

Protein Details

Accession

W2S5D4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
127-147	ENDFTKPARLHRRNPDWKTQV	Hydrophilic
509-533	GTDASTVRKKKKKSHHSSSQGPTSG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-28	RPLPRKKPAGA
39-41	KKR
474-498	RKEKHPASDREGAMKKSSSSKSLKR
516-522	RKKKKKS

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNQPPPATAVNGAPPAARPLPRKKPAGADGLFKPTNNQKKRYPLGAPPKALVRPPSGRGANLQPDLNAINAFSNARTENTKPTQNSLPQNVPVREFKLVTSKRELLDGLRYHLLQVDDKLPLDIRNENDFTKPARLHRRNPDWKTQVKEGDEPKEADAETEALNKRRDARQKEREANLAQIAPSANSNRRKLFTKKTAQVYHNDYTEEEKRRIQMNYEEKLPWVLEDFDNRHILIGKHNQGSMGVYAAFAHEASADGASSRFRLLPIEKSYRFEKPSNVQANVDFNDVFNAWSKKKNVEPEFLMRKREARRQEIEREREAKINSKLFLADQSLAMTREGEDADLDFEDDFADDEEGDMFGDKDEDEKAAEKKVKEDHLKANIGWQEKDEREVEASEHKEDESERLKGIWSGAMRSKLEKRERNYNLGSDSDDNSSSDSEEERQRLEAEKQANLKKEEEGGKSALSSGANTPSGRKEKHPASDREGAMKKSSSSKSLKRPGSPNLSDASGTDASTVRKKKKKSHHSSSQGPTSGGSRPMSPDGLRPRGAGSDTDGGAMSDGTRIKIKVKKPGSPSSPNSPPTSRAGSPAPGARRNLETGPLPTTEEIRARIPPEGMVAKDFIGLYKTPTDPERKAQWTAFIRKLILTKNGRVYLKDAAPPPVPPGEAAIKSENANPAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.26
3	0.28
4	0.32
5	0.34
6	0.43
7	0.53
8	0.61
9	0.66
10	0.64
11	0.68
12	0.68
13	0.7
14	0.62
15	0.58
16	0.54
17	0.57
18	0.54
19	0.45
20	0.44
21	0.44
22	0.52
23	0.54
24	0.56
25	0.55
26	0.64
27	0.71
28	0.73
29	0.7
30	0.69
31	0.73
32	0.75
33	0.71
34	0.63
35	0.63
36	0.58
37	0.55
38	0.49
39	0.46
40	0.43
41	0.43
42	0.5
43	0.45
44	0.43
45	0.44
46	0.48
47	0.48
48	0.45
49	0.42
50	0.33
51	0.33
52	0.33
53	0.29
54	0.21
55	0.14
56	0.11
57	0.12
58	0.13
59	0.11
60	0.13
61	0.13
62	0.15
63	0.19
64	0.21
65	0.29
66	0.34
67	0.42
68	0.4
69	0.45
70	0.5
71	0.54
72	0.59
73	0.57
74	0.56
75	0.54
76	0.61
77	0.58
78	0.54
79	0.5
80	0.46
81	0.42
82	0.38
83	0.33
84	0.36
85	0.38
86	0.39
87	0.43
88	0.43
89	0.4
90	0.42
91	0.41
92	0.33
93	0.37
94	0.34
95	0.3
96	0.29
97	0.28
98	0.26
99	0.29
100	0.28
101	0.21
102	0.21
103	0.2
104	0.19
105	0.19
106	0.2
107	0.18
108	0.18
109	0.19
110	0.21
111	0.22
112	0.26
113	0.28
114	0.29
115	0.3
116	0.3
117	0.3
118	0.33
119	0.32
120	0.35
121	0.44
122	0.5
123	0.58
124	0.66
125	0.74
126	0.78
127	0.81
128	0.83
129	0.79
130	0.79
131	0.76
132	0.72
133	0.68
134	0.61
135	0.62
136	0.58
137	0.55
138	0.52
139	0.47
140	0.41
141	0.36
142	0.32
143	0.25
144	0.2
145	0.15
146	0.12
147	0.18
148	0.2
149	0.22
150	0.24
151	0.25
152	0.29
153	0.36
154	0.45
155	0.47
156	0.55
157	0.61
158	0.7
159	0.77
160	0.76
161	0.75
162	0.67
163	0.61
164	0.54
165	0.44
166	0.33
167	0.26
168	0.23
169	0.16
170	0.17
171	0.17
172	0.22
173	0.28
174	0.32
175	0.34
176	0.37
177	0.43
178	0.48
179	0.54
180	0.57
181	0.6
182	0.63
183	0.68
184	0.73
185	0.7
186	0.69
187	0.66
188	0.6
189	0.51
190	0.44
191	0.35
192	0.33
193	0.38
194	0.36
195	0.31
196	0.3
197	0.31
198	0.35
199	0.35
200	0.33
201	0.35
202	0.39
203	0.39
204	0.41
205	0.38
206	0.34
207	0.34
208	0.31
209	0.22
210	0.15
211	0.14
212	0.11
213	0.16
214	0.19
215	0.2
216	0.22
217	0.21
218	0.2
219	0.2
220	0.19
221	0.2
222	0.26
223	0.28
224	0.28
225	0.29
226	0.28
227	0.26
228	0.27
229	0.21
230	0.14
231	0.08
232	0.07
233	0.06
234	0.07
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.1
251	0.12
252	0.18
253	0.24
254	0.32
255	0.32
256	0.35
257	0.38
258	0.4
259	0.43
260	0.38
261	0.37
262	0.33
263	0.42
264	0.44
265	0.43
266	0.38
267	0.35
268	0.37
269	0.33
270	0.3
271	0.2
272	0.14
273	0.14
274	0.13
275	0.12
276	0.12
277	0.14
278	0.14
279	0.19
280	0.2
281	0.23
282	0.27
283	0.36
284	0.36
285	0.37
286	0.4
287	0.43
288	0.52
289	0.51
290	0.49
291	0.41
292	0.43
293	0.43
294	0.47
295	0.46
296	0.43
297	0.47
298	0.5
299	0.6
300	0.62
301	0.62
302	0.6
303	0.56
304	0.51
305	0.48
306	0.44
307	0.4
308	0.36
309	0.34
310	0.29
311	0.26
312	0.25
313	0.21
314	0.22
315	0.17
316	0.12
317	0.09
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.1
322	0.09
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.05
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.08
354	0.09
355	0.13
356	0.17
357	0.16
358	0.2
359	0.24
360	0.31
361	0.33
362	0.37
363	0.4
364	0.43
365	0.45
366	0.41
367	0.42
368	0.38
369	0.35
370	0.31
371	0.25
372	0.23
373	0.21
374	0.24
375	0.2
376	0.16
377	0.15
378	0.16
379	0.16
380	0.16
381	0.18
382	0.16
383	0.16
384	0.15
385	0.15
386	0.15
387	0.18
388	0.16
389	0.16
390	0.15
391	0.15
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.14
396	0.11
397	0.12
398	0.16
399	0.19
400	0.2
401	0.23
402	0.28
403	0.34
404	0.43
405	0.46
406	0.47
407	0.54
408	0.58
409	0.61
410	0.58
411	0.52
412	0.45
413	0.39
414	0.37
415	0.28
416	0.26
417	0.2
418	0.18
419	0.16
420	0.15
421	0.14
422	0.12
423	0.1
424	0.09
425	0.11
426	0.14
427	0.16
428	0.15
429	0.16
430	0.17
431	0.19
432	0.2
433	0.23
434	0.22
435	0.25
436	0.31
437	0.35
438	0.38
439	0.38
440	0.37
441	0.32
442	0.35
443	0.36
444	0.32
445	0.3
446	0.27
447	0.24
448	0.23
449	0.22
450	0.19
451	0.13
452	0.12
453	0.1
454	0.12
455	0.14
456	0.15
457	0.16
458	0.21
459	0.28
460	0.29
461	0.31
462	0.36
463	0.4
464	0.5
465	0.56
466	0.55
467	0.56
468	0.62
469	0.59
470	0.6
471	0.57
472	0.49
473	0.43
474	0.39
475	0.33
476	0.33
477	0.34
478	0.33
479	0.36
480	0.43
481	0.5
482	0.58
483	0.63
484	0.62
485	0.66
486	0.67
487	0.69
488	0.63
489	0.55
490	0.48
491	0.43
492	0.36
493	0.3
494	0.28
495	0.19
496	0.17
497	0.16
498	0.16
499	0.17
500	0.24
501	0.31
502	0.35
503	0.41
504	0.49
505	0.57
506	0.67
507	0.76
508	0.79
509	0.83
510	0.84
511	0.86
512	0.89
513	0.86
514	0.83
515	0.74
516	0.63
517	0.53
518	0.44
519	0.39
520	0.33
521	0.27
522	0.2
523	0.21
524	0.23
525	0.26
526	0.24
527	0.28
528	0.33
529	0.37
530	0.37
531	0.35
532	0.34
533	0.33
534	0.34
535	0.27
536	0.23
537	0.22
538	0.21
539	0.21
540	0.19
541	0.16
542	0.15
543	0.14
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.1
548	0.13
549	0.14
550	0.2
551	0.27
552	0.32
553	0.4
554	0.46
555	0.52
556	0.57
557	0.67
558	0.68
559	0.7
560	0.71
561	0.69
562	0.71
563	0.67
564	0.65
565	0.58
566	0.53
567	0.49
568	0.5
569	0.41
570	0.37
571	0.37
572	0.34
573	0.35
574	0.39
575	0.4
576	0.39
577	0.41
578	0.39
579	0.39
580	0.41
581	0.38
582	0.36
583	0.32
584	0.3
585	0.3
586	0.28
587	0.27
588	0.24
589	0.25
590	0.24
591	0.24
592	0.24
593	0.24
594	0.27
595	0.26
596	0.29
597	0.27
598	0.24
599	0.26
600	0.27
601	0.25
602	0.23
603	0.22
604	0.19
605	0.2
606	0.2
607	0.15
608	0.14
609	0.14
610	0.15
611	0.19
612	0.19
613	0.21
614	0.26
615	0.33
616	0.34
617	0.42
618	0.47
619	0.48
620	0.52
621	0.51
622	0.55
623	0.56
624	0.61
625	0.59
626	0.54
627	0.5
628	0.48
629	0.51
630	0.47
631	0.48
632	0.46
633	0.47
634	0.52
635	0.58
636	0.57
637	0.54
638	0.52
639	0.5
640	0.49
641	0.48
642	0.42
643	0.41
644	0.41
645	0.4
646	0.4
647	0.35
648	0.31
649	0.25
650	0.27
651	0.28
652	0.28
653	0.31
654	0.3
655	0.29
656	0.3
657	0.34

W2S5D4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer