Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7EDC7

Protein Details
Accession A7EDC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-64ALPVMGKRKAKRKDDSPLDIIHydrophilic
85-104LTHICFPKARRHTRKFFELSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-55KRKAKR
Subcellular Location(s) plas 23, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
KEGG ssl:SS1G_03317  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
Amino Acid Sequences MSSNFPIDAIQDGTNKAAPEWAHQNGDTTLPVEKKLDSSTHYPALPVMGKRKAKRKDDSPLDIICRFVVDHQTGLSVNLLMLLSLTHICFPKARRHTRKFFELSYYNPESGEYCAGWNDAWLVFYWIVIFTGLRAAFMDYVLRPLARKGGVKTARDETRFAEQAWLMVYYSVFWSLGMYIYVNSDYWWNLTELWTNWPNREVGGLRKWYILVQYAFWLQQIMVINLEARRKDHWQMFTHHIVTTALIFTIANVILCLMDVFAKCLKYLGYDKLCDFMFGLFMLSWVMARHAFYLIICYSVWADIPKVINYGCYQGKNGSISGPFPAPDRFGHLFKPFQDPAGIICWNNNIKWGFLSALLFLQGITLMWFWMIIQVAIKVIRGGQADDTRSDNEEGEEEIDLDEEALNEEVHLLEGEPYEEEVGVEELNLKGRTSRNSRYKKTTSSASGVSIPGHSDRKELLGRIGCDKGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.19
4 0.2
5 0.18
6 0.22
7 0.28
8 0.3
9 0.31
10 0.31
11 0.34
12 0.31
13 0.33
14 0.28
15 0.22
16 0.23
17 0.2
18 0.22
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.24
23 0.26
24 0.25
25 0.29
26 0.34
27 0.37
28 0.36
29 0.33
30 0.3
31 0.32
32 0.32
33 0.31
34 0.32
35 0.37
36 0.45
37 0.51
38 0.61
39 0.66
40 0.7
41 0.75
42 0.76
43 0.78
44 0.8
45 0.81
46 0.77
47 0.73
48 0.69
49 0.6
50 0.52
51 0.41
52 0.32
53 0.24
54 0.21
55 0.22
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.19
60 0.18
61 0.19
62 0.17
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.15
77 0.18
78 0.27
79 0.37
80 0.48
81 0.56
82 0.65
83 0.74
84 0.78
85 0.85
86 0.8
87 0.72
88 0.69
89 0.62
90 0.56
91 0.54
92 0.51
93 0.41
94 0.35
95 0.33
96 0.26
97 0.25
98 0.23
99 0.15
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.05
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.12
126 0.08
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.14
133 0.16
134 0.19
135 0.19
136 0.29
137 0.35
138 0.37
139 0.4
140 0.43
141 0.46
142 0.44
143 0.44
144 0.36
145 0.36
146 0.36
147 0.32
148 0.28
149 0.22
150 0.2
151 0.2
152 0.18
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.11
179 0.11
180 0.15
181 0.2
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.2
186 0.17
187 0.19
188 0.15
189 0.16
190 0.21
191 0.23
192 0.23
193 0.23
194 0.23
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.15
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.07
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.13
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.16
218 0.21
219 0.25
220 0.29
221 0.3
222 0.34
223 0.38
224 0.39
225 0.37
226 0.33
227 0.29
228 0.23
229 0.19
230 0.15
231 0.1
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.06
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.11
254 0.14
255 0.19
256 0.21
257 0.22
258 0.23
259 0.25
260 0.25
261 0.22
262 0.19
263 0.12
264 0.09
265 0.07
266 0.08
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.13
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.18
302 0.21
303 0.21
304 0.2
305 0.17
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.2
316 0.21
317 0.22
318 0.26
319 0.28
320 0.3
321 0.3
322 0.38
323 0.31
324 0.28
325 0.28
326 0.24
327 0.22
328 0.23
329 0.22
330 0.14
331 0.15
332 0.19
333 0.2
334 0.2
335 0.23
336 0.2
337 0.19
338 0.2
339 0.2
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.08
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.06
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.08
366 0.08
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.17
371 0.21
372 0.23
373 0.24
374 0.27
375 0.25
376 0.26
377 0.26
378 0.22
379 0.18
380 0.17
381 0.16
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.13
415 0.14
416 0.13
417 0.17
418 0.21
419 0.3
420 0.36
421 0.46
422 0.52
423 0.62
424 0.7
425 0.76
426 0.8
427 0.79
428 0.77
429 0.75
430 0.71
431 0.66
432 0.61
433 0.54
434 0.49
435 0.42
436 0.37
437 0.29
438 0.25
439 0.25
440 0.27
441 0.25
442 0.25
443 0.25
444 0.3
445 0.34
446 0.33
447 0.36
448 0.38
449 0.4
450 0.43