FuNGI

W2RM42

Protein Details

Accession

W2RM42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-29	SPPPSTSPWKPLQRSRRPQLSLPPLH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
456-472	SKPPRLGGLKGKPKPKP
649-669	RRRAELKSTAAKAPAKKKRRF

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 11, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF

Amino Acid Sequences

MAGSPPPSTSPWKPLQRSRRPQLSLPPLHHKLITTTDKSARLTLHVTDLTTLYTATLSHSAITAEATRSHSPIDPAESAKQFTVLLTYLSQSLAGQGNTLARSDDDDDDEETANLALRTSIALPKPLPPLTFTFRLTRQSPAAFSGIVLRPALHATQVLRGKLQKLLEVVRDKDHVIARLLERVGSQASGDMSLVFPTLTGRKGRGGEKVGVEEAGRWVPGLREFDGEEWEGEEGEGDGVDGLVLQGAAEGNVESEDWVGRLPGLEALEDGGKEKAGLSRQVTKETTMAPQMEQSDEDATDSEDEFERQPTPPSARKGGRTTASPQATTKEKRPTKSPETSSDDSDAPPAKKQKTSAADGKRGTKLGGLGRNKTGASVTPAQDSSSPEPEAQHRRRQPSTSPASEGRRASNASTATATESDDEPQPLWPTTRSNARDQHQSSFPPASSPPATRATSKPPRLGGLKGKPKPKPADSATSTPSPEPVSPVKRSESVSTTPLARKGKLGRLGVGRRTRTPSVEPEATRNSPAQPASETPTHRLGKLGMRRKGMGRGATPEMETVEETEGGHGSRQSLSEEEEDLDQGSTANQRHSARQSGTAAAELHRDTQHRPITEEAKSQHNGRKGQDTEQEDEVSRDREPETAEQAAARRRAELKSTAAKAPAKKKRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.75
3	0.79
4	0.85
5	0.87
6	0.88
7	0.83
8	0.81
9	0.82
10	0.81
11	0.78
12	0.75
13	0.74
14	0.69
15	0.66
16	0.61
17	0.51
18	0.44
19	0.45
20	0.46
21	0.4
22	0.42
23	0.45
24	0.49
25	0.5
26	0.49
27	0.41
28	0.37
29	0.35
30	0.31
31	0.31
32	0.28
33	0.27
34	0.25
35	0.24
36	0.21
37	0.18
38	0.16
39	0.1
40	0.09
41	0.08
42	0.1
43	0.12
44	0.11
45	0.11
46	0.12
47	0.11
48	0.11
49	0.13
50	0.13
51	0.12
52	0.15
53	0.2
54	0.21
55	0.22
56	0.24
57	0.24
58	0.24
59	0.25
60	0.28
61	0.25
62	0.27
63	0.33
64	0.33
65	0.33
66	0.3
67	0.28
68	0.23
69	0.2
70	0.19
71	0.13
72	0.12
73	0.11
74	0.12
75	0.12
76	0.12
77	0.12
78	0.09
79	0.12
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.12
84	0.15
85	0.16
86	0.16
87	0.14
88	0.11
89	0.14
90	0.17
91	0.17
92	0.17
93	0.18
94	0.19
95	0.2
96	0.2
97	0.17
98	0.14
99	0.12
100	0.11
101	0.09
102	0.08
103	0.07
104	0.06
105	0.07
106	0.09
107	0.14
108	0.14
109	0.18
110	0.19
111	0.23
112	0.29
113	0.31
114	0.29
115	0.27
116	0.31
117	0.34
118	0.37
119	0.35
120	0.34
121	0.35
122	0.41
123	0.4
124	0.39
125	0.37
126	0.35
127	0.34
128	0.32
129	0.3
130	0.23
131	0.22
132	0.24
133	0.21
134	0.2
135	0.19
136	0.16
137	0.15
138	0.17
139	0.17
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.18
144	0.22
145	0.22
146	0.23
147	0.26
148	0.27
149	0.29
150	0.29
151	0.24
152	0.23
153	0.26
154	0.3
155	0.34
156	0.34
157	0.33
158	0.33
159	0.31
160	0.32
161	0.31
162	0.26
163	0.23
164	0.24
165	0.22
166	0.26
167	0.25
168	0.21
169	0.19
170	0.18
171	0.16
172	0.13
173	0.12
174	0.08
175	0.08
176	0.08
177	0.08
178	0.07
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.08
186	0.1
187	0.12
188	0.13
189	0.18
190	0.22
191	0.24
192	0.29
193	0.31
194	0.32
195	0.32
196	0.33
197	0.29
198	0.26
199	0.23
200	0.18
201	0.16
202	0.12
203	0.1
204	0.08
205	0.08
206	0.08
207	0.12
208	0.14
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.16
213	0.18
214	0.18
215	0.14
216	0.11
217	0.1
218	0.09
219	0.08
220	0.07
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.02
229	0.02
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.02
234	0.02
235	0.03
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.03
241	0.03
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.08
263	0.1
264	0.13
265	0.15
266	0.23
267	0.25
268	0.3
269	0.3
270	0.28
271	0.28
272	0.26
273	0.25
274	0.2
275	0.19
276	0.15
277	0.16
278	0.16
279	0.15
280	0.13
281	0.13
282	0.1
283	0.1
284	0.1
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.06
291	0.07
292	0.07
293	0.08
294	0.09
295	0.09
296	0.11
297	0.13
298	0.18
299	0.22
300	0.25
301	0.31
302	0.33
303	0.38
304	0.39
305	0.41
306	0.38
307	0.35
308	0.36
309	0.37
310	0.35
311	0.31
312	0.28
313	0.27
314	0.31
315	0.31
316	0.32
317	0.35
318	0.37
319	0.39
320	0.44
321	0.49
322	0.52
323	0.57
324	0.55
325	0.53
326	0.57
327	0.56
328	0.52
329	0.46
330	0.39
331	0.31
332	0.29
333	0.25
334	0.18
335	0.2
336	0.24
337	0.24
338	0.25
339	0.26
340	0.32
341	0.33
342	0.38
343	0.43
344	0.43
345	0.48
346	0.48
347	0.51
348	0.45
349	0.4
350	0.35
351	0.27
352	0.24
353	0.23
354	0.28
355	0.27
356	0.27
357	0.28
358	0.29
359	0.28
360	0.25
361	0.2
362	0.14
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.17
367	0.18
368	0.18
369	0.19
370	0.22
371	0.2
372	0.19
373	0.19
374	0.18
375	0.19
376	0.24
377	0.33
378	0.35
379	0.41
380	0.44
381	0.5
382	0.53
383	0.56
384	0.54
385	0.53
386	0.56
387	0.49
388	0.47
389	0.46
390	0.47
391	0.48
392	0.45
393	0.37
394	0.33
395	0.31
396	0.27
397	0.26
398	0.23
399	0.19
400	0.18
401	0.16
402	0.15
403	0.14
404	0.14
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.1
411	0.11
412	0.13
413	0.12
414	0.13
415	0.13
416	0.15
417	0.17
418	0.26
419	0.28
420	0.33
421	0.4
422	0.42
423	0.5
424	0.49
425	0.51
426	0.46
427	0.44
428	0.41
429	0.36
430	0.33
431	0.26
432	0.24
433	0.23
434	0.22
435	0.22
436	0.22
437	0.26
438	0.27
439	0.28
440	0.31
441	0.36
442	0.43
443	0.48
444	0.48
445	0.44
446	0.46
447	0.46
448	0.48
449	0.48
450	0.48
451	0.53
452	0.54
453	0.61
454	0.61
455	0.67
456	0.69
457	0.63
458	0.62
459	0.56
460	0.59
461	0.56
462	0.56
463	0.52
464	0.47
465	0.45
466	0.36
467	0.33
468	0.26
469	0.22
470	0.21
471	0.25
472	0.28
473	0.3
474	0.33
475	0.35
476	0.36
477	0.38
478	0.37
479	0.35
480	0.32
481	0.3
482	0.29
483	0.3
484	0.29
485	0.34
486	0.33
487	0.29
488	0.31
489	0.36
490	0.41
491	0.45
492	0.44
493	0.42
494	0.48
495	0.53
496	0.56
497	0.58
498	0.54
499	0.51
500	0.56
501	0.53
502	0.48
503	0.47
504	0.45
505	0.45
506	0.48
507	0.45
508	0.44
509	0.49
510	0.46
511	0.44
512	0.39
513	0.33
514	0.3
515	0.3
516	0.26
517	0.22
518	0.22
519	0.25
520	0.3
521	0.3
522	0.3
523	0.38
524	0.38
525	0.35
526	0.34
527	0.32
528	0.35
529	0.43
530	0.49
531	0.46
532	0.48
533	0.51
534	0.53
535	0.57
536	0.54
537	0.5
538	0.43
539	0.42
540	0.43
541	0.41
542	0.39
543	0.32
544	0.27
545	0.22
546	0.19
547	0.15
548	0.13
549	0.12
550	0.11
551	0.11
552	0.11
553	0.1
554	0.11
555	0.1
556	0.1
557	0.11
558	0.12
559	0.13
560	0.14
561	0.17
562	0.17
563	0.18
564	0.18
565	0.17
566	0.16
567	0.15
568	0.14
569	0.11
570	0.09
571	0.09
572	0.13
573	0.14
574	0.16
575	0.21
576	0.23
577	0.3
578	0.35
579	0.41
580	0.39
581	0.43
582	0.44
583	0.41
584	0.4
585	0.37
586	0.33
587	0.26
588	0.28
589	0.22
590	0.23
591	0.23
592	0.24
593	0.24
594	0.32
595	0.38
596	0.35
597	0.37
598	0.4
599	0.43
600	0.45
601	0.49
602	0.43
603	0.44
604	0.45
605	0.49
606	0.49
607	0.51
608	0.52
609	0.49
610	0.57
611	0.52
612	0.56
613	0.58
614	0.56
615	0.53
616	0.51
617	0.49
618	0.4
619	0.4
620	0.36
621	0.3
622	0.25
623	0.23
624	0.2
625	0.2
626	0.23
627	0.25
628	0.28
629	0.28
630	0.28
631	0.28
632	0.33
633	0.37
634	0.38
635	0.34
636	0.33
637	0.35
638	0.38
639	0.4
640	0.41
641	0.42
642	0.46
643	0.49
644	0.49
645	0.52
646	0.54
647	0.57
648	0.63
649	0.66

W2RM42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer