Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2SDE3

Protein Details
Accession W2SDE3    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-51APAQAGNESRKRKRPDRDSGVSRKIEHydrophilic
65-86DEKSTKKAGKEDRHDDRRRDSHBasic
94-116LATKRSTHPENKKKLYQRDHSSPHydrophilic
122-147SKSTTTTIKHDKNKKQGRGQKSNAHNHydrophilic
374-397AHSVGKQRKPLKGKKAKNTKGGGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-42RKRKRPDR
362-393GGDGKYKKGEAVAHSVGKQRKPLKGKKAKNTK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007823  RRP8  
IPR042036  RRP8_N  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05148  Methyltransf_8  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MFAVQGWNVSTSGLVQQQAKRSATGAPAQAGNESRKRKRPDRDSGVSRKIEGGELEKLWNQRFGDEKSTKKAGKEDRHDDRRRDSHETTQSPALATKRSTHPENKKKLYQRDHSSPGKANGSKSTTTTIKHDKNKKQGRGQKSNAHNASESTDTSSIVDTLPPPPPPATNLTPLQAKMRAKLTSARFRHLNETLYTTPSSTALSLFTNTPSLFAEYHAGFSQQVSSSWPHNPVLDFIAAIKARGPLSPAPPDPLPRRKTGSCTIADLGCGDAPLARGLIPGPAKKMKLTIHSYDLHAPNQHVTVADIANLPLRDGEADIAVFSLSLMGTNWIDFVEEAWRVLRGDGKGEVWVAEVKSRFARGGDGKYKKGEAVAHSVGKQRKPLKGKKAKNTKGGGEEEEGDEADLPVDLFTSEASIQPLGDTPDLRPFINIWTSRGFQLKPNSIDAKNKMFVSMTFFKSGIPTVGKHRGMKWNGKEYERIGKANGEDDTDTATEGKVLKPCVYKLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.27
4 0.35
5 0.42
6 0.42
7 0.39
8 0.37
9 0.38
10 0.37
11 0.38
12 0.33
13 0.29
14 0.3
15 0.29
16 0.32
17 0.32
18 0.34
19 0.36
20 0.43
21 0.49
22 0.56
23 0.65
24 0.7
25 0.78
26 0.81
27 0.84
28 0.85
29 0.87
30 0.87
31 0.88
32 0.88
33 0.79
34 0.7
35 0.62
36 0.53
37 0.45
38 0.37
39 0.31
40 0.26
41 0.25
42 0.27
43 0.27
44 0.3
45 0.3
46 0.33
47 0.29
48 0.28
49 0.32
50 0.34
51 0.4
52 0.43
53 0.46
54 0.48
55 0.56
56 0.55
57 0.52
58 0.57
59 0.57
60 0.6
61 0.65
62 0.68
63 0.71
64 0.79
65 0.84
66 0.81
67 0.81
68 0.79
69 0.75
70 0.74
71 0.67
72 0.66
73 0.68
74 0.65
75 0.6
76 0.55
77 0.49
78 0.42
79 0.41
80 0.33
81 0.27
82 0.26
83 0.27
84 0.31
85 0.36
86 0.41
87 0.47
88 0.56
89 0.63
90 0.72
91 0.74
92 0.76
93 0.8
94 0.84
95 0.83
96 0.82
97 0.81
98 0.79
99 0.79
100 0.76
101 0.73
102 0.68
103 0.63
104 0.62
105 0.55
106 0.49
107 0.47
108 0.46
109 0.41
110 0.37
111 0.37
112 0.32
113 0.31
114 0.35
115 0.39
116 0.43
117 0.51
118 0.6
119 0.63
120 0.71
121 0.8
122 0.82
123 0.82
124 0.83
125 0.84
126 0.84
127 0.82
128 0.81
129 0.78
130 0.8
131 0.72
132 0.65
133 0.56
134 0.46
135 0.42
136 0.34
137 0.27
138 0.2
139 0.18
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.12
144 0.1
145 0.11
146 0.08
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.18
154 0.23
155 0.23
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.28
160 0.28
161 0.28
162 0.28
163 0.26
164 0.24
165 0.27
166 0.26
167 0.25
168 0.32
169 0.36
170 0.4
171 0.42
172 0.43
173 0.42
174 0.43
175 0.47
176 0.43
177 0.38
178 0.29
179 0.33
180 0.3
181 0.29
182 0.27
183 0.21
184 0.19
185 0.16
186 0.16
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.1
200 0.11
201 0.13
202 0.11
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.11
213 0.13
214 0.15
215 0.17
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.15
221 0.13
222 0.11
223 0.09
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.11
233 0.15
234 0.19
235 0.19
236 0.2
237 0.2
238 0.25
239 0.29
240 0.35
241 0.35
242 0.34
243 0.39
244 0.37
245 0.42
246 0.43
247 0.42
248 0.35
249 0.35
250 0.33
251 0.28
252 0.26
253 0.21
254 0.16
255 0.1
256 0.08
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.08
266 0.1
267 0.11
268 0.14
269 0.17
270 0.18
271 0.18
272 0.23
273 0.22
274 0.27
275 0.31
276 0.3
277 0.32
278 0.33
279 0.34
280 0.36
281 0.35
282 0.3
283 0.26
284 0.24
285 0.2
286 0.19
287 0.17
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.09
297 0.09
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.13
330 0.11
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.11
338 0.13
339 0.11
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.15
344 0.16
345 0.16
346 0.14
347 0.2
348 0.21
349 0.29
350 0.37
351 0.4
352 0.42
353 0.44
354 0.45
355 0.39
356 0.37
357 0.33
358 0.26
359 0.29
360 0.3
361 0.3
362 0.31
363 0.38
364 0.4
365 0.39
366 0.43
367 0.42
368 0.45
369 0.53
370 0.6
371 0.65
372 0.71
373 0.78
374 0.81
375 0.86
376 0.86
377 0.86
378 0.82
379 0.76
380 0.72
381 0.66
382 0.58
383 0.49
384 0.43
385 0.34
386 0.29
387 0.24
388 0.17
389 0.13
390 0.1
391 0.08
392 0.06
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.13
411 0.21
412 0.23
413 0.23
414 0.22
415 0.2
416 0.23
417 0.3
418 0.3
419 0.25
420 0.28
421 0.29
422 0.32
423 0.36
424 0.32
425 0.31
426 0.39
427 0.44
428 0.43
429 0.48
430 0.51
431 0.49
432 0.56
433 0.55
434 0.53
435 0.49
436 0.46
437 0.41
438 0.36
439 0.34
440 0.34
441 0.35
442 0.31
443 0.3
444 0.29
445 0.28
446 0.29
447 0.3
448 0.26
449 0.22
450 0.21
451 0.26
452 0.36
453 0.41
454 0.42
455 0.48
456 0.53
457 0.58
458 0.66
459 0.67
460 0.67
461 0.68
462 0.68
463 0.67
464 0.61
465 0.64
466 0.59
467 0.52
468 0.44
469 0.42
470 0.41
471 0.41
472 0.37
473 0.3
474 0.26
475 0.24
476 0.26
477 0.21
478 0.2
479 0.16
480 0.15
481 0.14
482 0.15
483 0.18
484 0.19
485 0.22
486 0.27
487 0.31