Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2SCT5

Protein Details
Accession W2SCT5    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-34MSDKRQTRLQKQGKRKRAQSRTAKMPKRQKASSLHydrophilic
37-56DLPQTEQHPHRTNRNRMMPLHydrophilic
331-355CVHTKLTSSKKPKPRIKEYGEKGRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-30LQKQGKRKRAQSRTAKMPKRQK
340-346KKPKPRI
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
CDD cd08161  SET  
Amino Acid Sequences MSDKRQTRLQKQGKRKRAQSRTAKMPKRQKASSLGLDLPQTEQHPHRTNRNRMMPLIPSHHRGVAPSVLKLISALLSKPTIVAFCDLVRARRSAETPLRYWTADDGAAYQMEQRLINLRSLRDKSAFGRFLVRAEELGLARAMECKRKGRIRNDSNDVRDTLKRCELTYNTFKWHQTQGGKWLRLCRPYPGILCFLLAHGHNVFGISQGDYLGLSDHDLDSFHALLDCEQAQTLNAIGQQFLDSLSPIADDVEFLWEGKEVLWDNLSTTEALTKLATVPWKMENDYAPNDYPGWPRPLDWPDEWGWPMDPTALPAFDQPKCDFCPQSQCDCVHTKLTSSKKPKPRIKEYGEKGRGIQAVATDPGQVAYACGECIGVVWGKVAPVDAHTGSMVMDFVRPDILYEPVACQLYCEDRGSNLRLINHSCRPSARVEPMKVSGKWILVVVAARAIFDREEITAKFGKASFDGPCLCGCANPTEPLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.91
3 0.91
4 0.91
5 0.91
6 0.91
7 0.9
8 0.9
9 0.91
10 0.9
11 0.89
12 0.9
13 0.89
14 0.86
15 0.81
16 0.76
17 0.74
18 0.73
19 0.7
20 0.65
21 0.58
22 0.52
23 0.49
24 0.43
25 0.36
26 0.3
27 0.25
28 0.24
29 0.25
30 0.32
31 0.4
32 0.44
33 0.53
34 0.61
35 0.69
36 0.74
37 0.8
38 0.76
39 0.7
40 0.7
41 0.65
42 0.61
43 0.59
44 0.53
45 0.47
46 0.45
47 0.45
48 0.41
49 0.36
50 0.34
51 0.34
52 0.31
53 0.28
54 0.28
55 0.24
56 0.23
57 0.22
58 0.19
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.18
73 0.19
74 0.22
75 0.24
76 0.24
77 0.24
78 0.27
79 0.28
80 0.31
81 0.38
82 0.39
83 0.39
84 0.42
85 0.43
86 0.39
87 0.38
88 0.31
89 0.25
90 0.2
91 0.19
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.16
102 0.17
103 0.22
104 0.23
105 0.24
106 0.31
107 0.34
108 0.37
109 0.33
110 0.35
111 0.34
112 0.4
113 0.4
114 0.32
115 0.36
116 0.32
117 0.31
118 0.31
119 0.28
120 0.19
121 0.18
122 0.2
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.1
127 0.09
128 0.14
129 0.15
130 0.18
131 0.22
132 0.26
133 0.33
134 0.42
135 0.5
136 0.55
137 0.65
138 0.68
139 0.73
140 0.76
141 0.76
142 0.72
143 0.67
144 0.58
145 0.51
146 0.46
147 0.4
148 0.36
149 0.34
150 0.31
151 0.29
152 0.33
153 0.32
154 0.35
155 0.4
156 0.38
157 0.37
158 0.39
159 0.39
160 0.37
161 0.38
162 0.37
163 0.33
164 0.32
165 0.38
166 0.43
167 0.45
168 0.43
169 0.48
170 0.46
171 0.48
172 0.47
173 0.42
174 0.37
175 0.38
176 0.39
177 0.34
178 0.32
179 0.26
180 0.26
181 0.21
182 0.17
183 0.15
184 0.12
185 0.12
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.08
263 0.1
264 0.09
265 0.11
266 0.13
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.17
271 0.19
272 0.21
273 0.22
274 0.19
275 0.19
276 0.19
277 0.19
278 0.2
279 0.19
280 0.21
281 0.18
282 0.19
283 0.24
284 0.26
285 0.28
286 0.26
287 0.27
288 0.25
289 0.27
290 0.27
291 0.21
292 0.19
293 0.15
294 0.15
295 0.12
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.12
302 0.16
303 0.16
304 0.2
305 0.2
306 0.22
307 0.25
308 0.29
309 0.27
310 0.25
311 0.34
312 0.34
313 0.39
314 0.4
315 0.37
316 0.38
317 0.41
318 0.41
319 0.35
320 0.31
321 0.28
322 0.31
323 0.38
324 0.43
325 0.48
326 0.55
327 0.61
328 0.71
329 0.76
330 0.78
331 0.81
332 0.82
333 0.81
334 0.82
335 0.81
336 0.81
337 0.78
338 0.7
339 0.6
340 0.56
341 0.49
342 0.39
343 0.31
344 0.21
345 0.18
346 0.18
347 0.17
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.12
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.13
391 0.16
392 0.17
393 0.16
394 0.15
395 0.16
396 0.19
397 0.21
398 0.22
399 0.19
400 0.21
401 0.26
402 0.3
403 0.31
404 0.3
405 0.31
406 0.33
407 0.39
408 0.43
409 0.46
410 0.45
411 0.44
412 0.43
413 0.42
414 0.43
415 0.44
416 0.47
417 0.48
418 0.49
419 0.51
420 0.56
421 0.6
422 0.55
423 0.52
424 0.46
425 0.38
426 0.35
427 0.3
428 0.24
429 0.19
430 0.19
431 0.15
432 0.15
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.11
441 0.15
442 0.15
443 0.19
444 0.22
445 0.22
446 0.25
447 0.25
448 0.25
449 0.23
450 0.26
451 0.24
452 0.26
453 0.27
454 0.26
455 0.25
456 0.26
457 0.24
458 0.22
459 0.22
460 0.23
461 0.24