FuNGI

W2RZD6

Protein Details

Accession

W2RZD6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-35	RPAPRAGYTRKSKAERERYA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-29	RGRPAPRAGYTRKSKA
210-239	KGKRRADSGTKPRIRKSAGGGGGLRPVRAP
255-266	GKRAGALRKPKR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSNPSSNRSTPIPRGRPAPRAGYTRKSKAERERYAAEQADREKQRNPTPSDPLSSARGRAGARGAGQAGRGGTNREQGHQRGDGTGFSVFGGNIGAAKTRNKDAAQGREEWLAGGARTKEEIEQQAASAAQVQATSSGGKGLVTADVSASGVVTVGKGTSGPGVYEIVVPEDDEGEVERRDIERIWISSDDEAADAEIEDEQEDDIVTSKGKRRADSGTKPRIRKSAGGGGGLRPVRAPRTRVDTDDLQDEDTKGKRAGALRKPKREAAAAQVILDDSDAMEVDPPVISTADNDDGQPLKSPPSSPEVKKKALAATTRRLSGPRTKSAAGHQETQEERAERLRVVDDTNKLLSIFAPNHLTTGTMTAASKNKAKAKATIQALEEGKLFLMQFPPITPLLVNPAAHVETDGDGEGDDVKVKSEHEVGTASTAPQQQKGATTHKSSGQAVPQPSSGLLTADSTAKLPHGRVGKLNVHASGKISLDWGGCSLDVKLGTEVDFLQDAVLLEQRLQPEQGQQDGTAEAAAAARDEDEAMENGEEDTDNEKGKRGKEKDTDEATNAKAYPLGQVHAKLVVTPDFARLFD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.69
3	0.71
4	0.69
5	0.68
6	0.63
7	0.65
8	0.67
9	0.68
10	0.7
11	0.71
12	0.75
13	0.72
14	0.75
15	0.77
16	0.81
17	0.79
18	0.77
19	0.73
20	0.69
21	0.7
22	0.66
23	0.58
24	0.53
25	0.49
26	0.52
27	0.52
28	0.5
29	0.49
30	0.51
31	0.57
32	0.6
33	0.63
34	0.61
35	0.64
36	0.65
37	0.64
38	0.59
39	0.54
40	0.51
41	0.46
42	0.4
43	0.34
44	0.34
45	0.3
46	0.29
47	0.29
48	0.26
49	0.25
50	0.26
51	0.26
52	0.22
53	0.22
54	0.21
55	0.19
56	0.18
57	0.18
58	0.19
59	0.2
60	0.27
61	0.28
62	0.3
63	0.35
64	0.36
65	0.4
66	0.39
67	0.38
68	0.33
69	0.33
70	0.29
71	0.25
72	0.22
73	0.16
74	0.13
75	0.13
76	0.09
77	0.08
78	0.08
79	0.06
80	0.07
81	0.07
82	0.08
83	0.09
84	0.13
85	0.16
86	0.19
87	0.25
88	0.24
89	0.32
90	0.38
91	0.46
92	0.45
93	0.46
94	0.45
95	0.42
96	0.41
97	0.33
98	0.27
99	0.18
100	0.15
101	0.16
102	0.14
103	0.13
104	0.14
105	0.15
106	0.15
107	0.19
108	0.22
109	0.2
110	0.2
111	0.19
112	0.19
113	0.18
114	0.17
115	0.15
116	0.12
117	0.09
118	0.09
119	0.09
120	0.08
121	0.09
122	0.09
123	0.06
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.06
133	0.07
134	0.07
135	0.06
136	0.06
137	0.04
138	0.04
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.03
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.1
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.09
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.07
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.09
167	0.1
168	0.11
169	0.13
170	0.15
171	0.15
172	0.18
173	0.18
174	0.19
175	0.18
176	0.18
177	0.15
178	0.11
179	0.1
180	0.07
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.08
196	0.15
197	0.21
198	0.23
199	0.24
200	0.27
201	0.35
202	0.44
203	0.51
204	0.56
205	0.61
206	0.66
207	0.68
208	0.68
209	0.66
210	0.59
211	0.52
212	0.47
213	0.45
214	0.4
215	0.4
216	0.37
217	0.32
218	0.35
219	0.31
220	0.26
221	0.17
222	0.16
223	0.19
224	0.21
225	0.22
226	0.2
227	0.28
228	0.3
229	0.32
230	0.35
231	0.33
232	0.31
233	0.32
234	0.3
235	0.23
236	0.22
237	0.2
238	0.18
239	0.16
240	0.16
241	0.13
242	0.12
243	0.14
244	0.19
245	0.27
246	0.34
247	0.44
248	0.51
249	0.59
250	0.62
251	0.62
252	0.59
253	0.53
254	0.45
255	0.4
256	0.4
257	0.31
258	0.28
259	0.25
260	0.23
261	0.2
262	0.18
263	0.11
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.06
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.11
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.16
291	0.21
292	0.23
293	0.33
294	0.37
295	0.39
296	0.39
297	0.4
298	0.38
299	0.37
300	0.4
301	0.35
302	0.37
303	0.37
304	0.37
305	0.36
306	0.33
307	0.32
308	0.35
309	0.35
310	0.33
311	0.35
312	0.34
313	0.35
314	0.39
315	0.45
316	0.38
317	0.37
318	0.32
319	0.33
320	0.33
321	0.34
322	0.32
323	0.24
324	0.22
325	0.2
326	0.21
327	0.15
328	0.16
329	0.15
330	0.13
331	0.15
332	0.19
333	0.18
334	0.2
335	0.2
336	0.19
337	0.17
338	0.16
339	0.14
340	0.14
341	0.13
342	0.12
343	0.15
344	0.14
345	0.15
346	0.15
347	0.15
348	0.11
349	0.12
350	0.1
351	0.08
352	0.08
353	0.11
354	0.14
355	0.16
356	0.19
357	0.22
358	0.28
359	0.33
360	0.34
361	0.37
362	0.39
363	0.44
364	0.44
365	0.43
366	0.38
367	0.38
368	0.37
369	0.32
370	0.28
371	0.2
372	0.17
373	0.13
374	0.12
375	0.07
376	0.08
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.11
381	0.1
382	0.11
383	0.1
384	0.09
385	0.14
386	0.16
387	0.16
388	0.14
389	0.16
390	0.16
391	0.15
392	0.15
393	0.11
394	0.08
395	0.09
396	0.09
397	0.07
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.08
406	0.08
407	0.1
408	0.13
409	0.13
410	0.13
411	0.14
412	0.13
413	0.15
414	0.15
415	0.14
416	0.15
417	0.2
418	0.19
419	0.2
420	0.22
421	0.2
422	0.24
423	0.28
424	0.31
425	0.31
426	0.34
427	0.35
428	0.38
429	0.41
430	0.39
431	0.38
432	0.37
433	0.38
434	0.36
435	0.36
436	0.31
437	0.28
438	0.26
439	0.24
440	0.18
441	0.12
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.13
451	0.12
452	0.16
453	0.21
454	0.22
455	0.26
456	0.32
457	0.36
458	0.4
459	0.42
460	0.41
461	0.38
462	0.36
463	0.34
464	0.3
465	0.25
466	0.2
467	0.18
468	0.17
469	0.15
470	0.14
471	0.13
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.12
479	0.12
480	0.12
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.11
486	0.1
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.11
492	0.09
493	0.1
494	0.13
495	0.15
496	0.15
497	0.16
498	0.16
499	0.2
500	0.24
501	0.26
502	0.25
503	0.24
504	0.24
505	0.23
506	0.22
507	0.15
508	0.12
509	0.08
510	0.07
511	0.07
512	0.06
513	0.05
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.08
519	0.09
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.11
528	0.12
529	0.15
530	0.15
531	0.21
532	0.25
533	0.31
534	0.4
535	0.43
536	0.5
537	0.57
538	0.64
539	0.68
540	0.71
541	0.69
542	0.63
543	0.62
544	0.54
545	0.49
546	0.41
547	0.32
548	0.26
549	0.22
550	0.25
551	0.22
552	0.23
553	0.22
554	0.24
555	0.26
556	0.28
557	0.27
558	0.22
559	0.23
560	0.23
561	0.23
562	0.22
563	0.25

W2RZD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer