Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2RTN4

Protein Details
Accession W2RTN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-67ASGPPRASARPTKRRKLDEDPVNSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-21KKRAAARSVATRGRRSAR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MPPKKRAAARSVATRGRRSARNRPVAESSIPDVYHEMLAEAEASGPPRASARPTKRRKLDEDPVNSTQLHVEPIEELAFALLPSEDEPAEPQHHQPVIYDEFEDSDDDIEFEDVELAVSEEDEKPEQKVFTVDVSAPVETPKRLPKRQIVSAAERRKRLEWHKAHLFLLLLSMWCRNRWCEDGDVQATLKSLVPRKVVKLLHEDESKSQLQRSHSFNKGIEEICLLWRTTWTTIGRGMRRATWRDDIQVEKESGLSEDLDFDDFRSAAQTQRGSRDLGAQMFCALLRSVAVETRLVCSLQALPFSAAAKGQTPEKAMPKYSFAPTQSFGTSTVSTSRKKQKDSAFPVYWVEVFSPAASMWIPLDPLVRNTINKPKTGFEPPASDPLNAMSYVVAIEDDGSARDVTRRYVQWFNAKTRKARVESTKDGEHWWHDTLAHFAKPFPESRDEIEDADLLRRSEAEGMPKNVQDFKGHPIYVLERHLRMNEVIHTKREVGKTAVGSGHNSQKLESVYRRSDVHTCRTSDAWYRRGRDVKQGEVPLKRVVRKIRRNIDADDDNPDAQDDAALYAEFQTEVYMPPPVVNGRIPRNAFGNIDVYVPAMIPAGAVHVQHQLAARAAKLMGVDYVEAVTGFEFKGRQGTAVLNGVVVSSEVRFGLVAVIVGLQTDARTEAQEKRSALLLALWKKWLTALRIRERIQREYGNSNDDEIHDDVSMYNGSDDEEGGGFVPEAGDAPAEDEQAQSSVVSDVTSKVLLTGLPSEPTYSEVVVTESPHQAPRLPEPSIAYPNQPESDTVSSHGQPGHGAGGFFAEDDELGGGFMPEESDPAVLEDSNIDAVVEQSDPGGGFLVDETSAVTSMAEPQQSFDKALADLKDPTISLQSPNPEGSLLYPSEAERRLNIAVSRTSPILPTLSDRNVNVLQSDYTQAPVPISSSTESPSTADRATAGRVAANGADELDSPTSRLSHDPDEDEMEPEWLLDSLGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.68
3 0.67
4 0.69
5 0.67
6 0.7
7 0.72
8 0.76
9 0.74
10 0.73
11 0.72
12 0.68
13 0.63
14 0.56
15 0.49
16 0.43
17 0.4
18 0.34
19 0.29
20 0.26
21 0.23
22 0.19
23 0.15
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.12
35 0.14
36 0.2
37 0.3
38 0.39
39 0.49
40 0.6
41 0.7
42 0.77
43 0.84
44 0.85
45 0.85
46 0.84
47 0.84
48 0.82
49 0.8
50 0.74
51 0.68
52 0.59
53 0.5
54 0.42
55 0.33
56 0.27
57 0.19
58 0.16
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.11
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.14
76 0.18
77 0.19
78 0.21
79 0.27
80 0.28
81 0.28
82 0.28
83 0.3
84 0.3
85 0.29
86 0.28
87 0.21
88 0.2
89 0.21
90 0.21
91 0.15
92 0.11
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.07
107 0.08
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.17
118 0.2
119 0.18
120 0.2
121 0.21
122 0.21
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.18
127 0.23
128 0.28
129 0.36
130 0.42
131 0.49
132 0.56
133 0.62
134 0.69
135 0.74
136 0.7
137 0.71
138 0.75
139 0.78
140 0.75
141 0.71
142 0.66
143 0.6
144 0.62
145 0.61
146 0.62
147 0.59
148 0.62
149 0.67
150 0.67
151 0.64
152 0.57
153 0.49
154 0.38
155 0.32
156 0.23
157 0.14
158 0.11
159 0.16
160 0.15
161 0.17
162 0.19
163 0.2
164 0.24
165 0.26
166 0.28
167 0.28
168 0.3
169 0.36
170 0.35
171 0.34
172 0.3
173 0.27
174 0.25
175 0.21
176 0.2
177 0.18
178 0.21
179 0.24
180 0.29
181 0.32
182 0.35
183 0.43
184 0.43
185 0.42
186 0.45
187 0.44
188 0.45
189 0.46
190 0.44
191 0.39
192 0.42
193 0.41
194 0.33
195 0.33
196 0.3
197 0.32
198 0.36
199 0.4
200 0.42
201 0.45
202 0.49
203 0.47
204 0.47
205 0.45
206 0.4
207 0.33
208 0.28
209 0.23
210 0.21
211 0.21
212 0.17
213 0.13
214 0.14
215 0.16
216 0.16
217 0.21
218 0.19
219 0.2
220 0.26
221 0.33
222 0.35
223 0.36
224 0.37
225 0.37
226 0.43
227 0.44
228 0.44
229 0.44
230 0.42
231 0.42
232 0.44
233 0.41
234 0.38
235 0.38
236 0.33
237 0.27
238 0.25
239 0.21
240 0.18
241 0.15
242 0.12
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.12
255 0.16
256 0.2
257 0.21
258 0.26
259 0.28
260 0.27
261 0.27
262 0.3
263 0.29
264 0.28
265 0.26
266 0.21
267 0.2
268 0.18
269 0.18
270 0.13
271 0.1
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.13
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.19
301 0.25
302 0.27
303 0.27
304 0.28
305 0.3
306 0.32
307 0.32
308 0.32
309 0.28
310 0.29
311 0.28
312 0.29
313 0.25
314 0.23
315 0.21
316 0.2
317 0.18
318 0.15
319 0.2
320 0.22
321 0.23
322 0.3
323 0.39
324 0.41
325 0.45
326 0.52
327 0.54
328 0.61
329 0.68
330 0.7
331 0.61
332 0.57
333 0.54
334 0.48
335 0.39
336 0.29
337 0.21
338 0.12
339 0.1
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.13
354 0.13
355 0.14
356 0.18
357 0.28
358 0.28
359 0.3
360 0.31
361 0.29
362 0.32
363 0.36
364 0.36
365 0.29
366 0.32
367 0.32
368 0.37
369 0.37
370 0.32
371 0.27
372 0.24
373 0.23
374 0.17
375 0.15
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.04
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.07
390 0.08
391 0.1
392 0.14
393 0.16
394 0.19
395 0.24
396 0.27
397 0.35
398 0.38
399 0.45
400 0.49
401 0.5
402 0.49
403 0.51
404 0.54
405 0.48
406 0.5
407 0.5
408 0.5
409 0.53
410 0.55
411 0.5
412 0.44
413 0.42
414 0.38
415 0.31
416 0.26
417 0.2
418 0.16
419 0.14
420 0.14
421 0.17
422 0.17
423 0.16
424 0.14
425 0.13
426 0.15
427 0.16
428 0.17
429 0.16
430 0.18
431 0.18
432 0.2
433 0.25
434 0.24
435 0.23
436 0.22
437 0.2
438 0.16
439 0.16
440 0.15
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.15
448 0.17
449 0.2
450 0.22
451 0.23
452 0.23
453 0.23
454 0.23
455 0.18
456 0.17
457 0.18
458 0.21
459 0.21
460 0.19
461 0.19
462 0.2
463 0.21
464 0.23
465 0.2
466 0.17
467 0.18
468 0.18
469 0.18
470 0.16
471 0.15
472 0.15
473 0.2
474 0.2
475 0.21
476 0.22
477 0.22
478 0.26
479 0.26
480 0.23
481 0.18
482 0.19
483 0.19
484 0.19
485 0.2
486 0.16
487 0.17
488 0.17
489 0.21
490 0.2
491 0.2
492 0.18
493 0.19
494 0.19
495 0.21
496 0.21
497 0.21
498 0.21
499 0.23
500 0.24
501 0.24
502 0.29
503 0.29
504 0.34
505 0.33
506 0.33
507 0.32
508 0.32
509 0.32
510 0.33
511 0.35
512 0.35
513 0.36
514 0.38
515 0.42
516 0.47
517 0.46
518 0.47
519 0.46
520 0.43
521 0.43
522 0.44
523 0.44
524 0.4
525 0.41
526 0.37
527 0.37
528 0.35
529 0.35
530 0.39
531 0.45
532 0.52
533 0.59
534 0.62
535 0.65
536 0.66
537 0.63
538 0.6
539 0.53
540 0.45
541 0.4
542 0.33
543 0.26
544 0.23
545 0.21
546 0.14
547 0.1
548 0.1
549 0.05
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.07
567 0.09
568 0.11
569 0.15
570 0.19
571 0.25
572 0.26
573 0.26
574 0.28
575 0.28
576 0.26
577 0.23
578 0.2
579 0.14
580 0.14
581 0.13
582 0.11
583 0.09
584 0.08
585 0.07
586 0.05
587 0.04
588 0.03
589 0.03
590 0.05
591 0.06
592 0.06
593 0.07
594 0.09
595 0.09
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.11
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.09
606 0.08
607 0.06
608 0.06
609 0.06
610 0.05
611 0.06
612 0.05
613 0.05
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.09
622 0.09
623 0.1
624 0.11
625 0.12
626 0.13
627 0.15
628 0.15
629 0.11
630 0.11
631 0.1
632 0.09
633 0.08
634 0.06
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.03
651 0.04
652 0.05
653 0.05
654 0.06
655 0.09
656 0.16
657 0.2
658 0.25
659 0.25
660 0.25
661 0.27
662 0.26
663 0.23
664 0.2
665 0.24
666 0.23
667 0.24
668 0.24
669 0.22
670 0.22
671 0.24
672 0.24
673 0.22
674 0.25
675 0.33
676 0.4
677 0.48
678 0.51
679 0.56
680 0.57
681 0.58
682 0.56
683 0.51
684 0.46
685 0.45
686 0.45
687 0.42
688 0.37
689 0.34
690 0.29
691 0.25
692 0.25
693 0.19
694 0.17
695 0.13
696 0.13
697 0.11
698 0.11
699 0.11
700 0.07
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.04
716 0.04
717 0.04
718 0.04
719 0.06
720 0.07
721 0.08
722 0.08
723 0.07
724 0.08
725 0.08
726 0.09
727 0.06
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.07
733 0.07
734 0.08
735 0.09
736 0.08
737 0.07
738 0.08
739 0.07
740 0.08
741 0.11
742 0.11
743 0.12
744 0.12
745 0.13
746 0.13
747 0.15
748 0.15
749 0.12
750 0.11
751 0.1
752 0.12
753 0.12
754 0.13
755 0.14
756 0.16
757 0.17
758 0.19
759 0.19
760 0.2
761 0.22
762 0.28
763 0.3
764 0.29
765 0.29
766 0.31
767 0.36
768 0.38
769 0.37
770 0.32
771 0.3
772 0.32
773 0.31
774 0.28
775 0.24
776 0.24
777 0.25
778 0.23
779 0.23
780 0.24
781 0.23
782 0.25
783 0.25
784 0.19
785 0.17
786 0.17
787 0.17
788 0.14
789 0.13
790 0.11
791 0.11
792 0.11
793 0.1
794 0.09
795 0.06
796 0.05
797 0.05
798 0.06
799 0.04
800 0.04
801 0.04
802 0.04
803 0.04
804 0.04
805 0.05
806 0.04
807 0.05
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.08
813 0.07
814 0.08
815 0.07
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.06
820 0.06
821 0.06
822 0.07
823 0.07
824 0.06
825 0.05
826 0.06
827 0.06
828 0.07
829 0.07
830 0.05
831 0.05
832 0.05
833 0.06
834 0.06
835 0.06
836 0.06
837 0.06
838 0.07
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.1
843 0.13
844 0.15
845 0.14
846 0.16
847 0.21
848 0.23
849 0.23
850 0.2
851 0.19
852 0.18
853 0.22
854 0.22
855 0.2
856 0.2
857 0.21
858 0.21
859 0.19
860 0.19
861 0.2
862 0.19
863 0.19
864 0.21
865 0.24
866 0.26
867 0.27
868 0.26
869 0.22
870 0.21
871 0.2
872 0.2
873 0.17
874 0.15
875 0.15
876 0.16
877 0.21
878 0.23
879 0.23
880 0.2
881 0.23
882 0.23
883 0.26
884 0.27
885 0.26
886 0.27
887 0.29
888 0.3
889 0.28
890 0.27
891 0.24
892 0.24
893 0.21
894 0.18
895 0.2
896 0.24
897 0.27
898 0.3
899 0.3
900 0.34
901 0.35
902 0.34
903 0.31
904 0.26
905 0.22
906 0.2
907 0.23
908 0.18
909 0.17
910 0.17
911 0.17
912 0.16
913 0.15
914 0.14
915 0.12
916 0.14
917 0.15
918 0.15
919 0.16
920 0.17
921 0.17
922 0.18
923 0.19
924 0.2
925 0.19
926 0.18
927 0.18
928 0.18
929 0.2
930 0.21
931 0.19
932 0.17
933 0.17
934 0.17
935 0.16
936 0.16
937 0.13
938 0.11
939 0.11
940 0.1
941 0.13
942 0.14
943 0.13
944 0.13
945 0.14
946 0.15
947 0.16
948 0.19
949 0.21
950 0.26
951 0.3
952 0.32
953 0.34
954 0.39
955 0.38
956 0.37
957 0.32
958 0.26
959 0.22
960 0.18
961 0.16
962 0.1