FuNGI

W2S4E4

Protein Details

Accession

W2S4E4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-52	HTLPDTPSSSKSKKRKHEGKDERSSDKKKRKHDRATQSTDAT	Basic
59-85	VEDSHSSSKTPKKRKGKETPSAAKDEE	Hydrophilic
105-132	EDAARTPRTEKQKRKSKKDKSISLEETP	Hydrophilic
156-186	VESQSRSNKKDKKEKKKKKSKSKDTTEHTSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-42	KSKKRKHEGKDERSSDKKKRKH
69-75	PKKRKGK
112-123	RTEKQKRKSKKD
162-178	SNKKDKKEKKKKKSKSK
408-414	RKKAKKG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSVQLGNSTPHTLPDTPSSSKSKKRKHEGKDERSSDKKKRKHDRATQSTDATAAPALEVEDSHSSSKTPKKRKGKETPSAAKDEEASAAVATHNAAAAEAVNEAEDAARTPRTEKQKRKSKKDKSISLEETPVKDSTHNATEDEPASEFATPHQEVESQSRSNKKDKKEKKKKKSKSKDTTEHTSDEPSVVTANGIAAAPVLAGDNSDIELLDAPPLSTATPVTSTDIPSDTITVLDPDLLSSIKPSPFYSTRLSLLLSLPAIAHSPSSALSSLLATHITPLLLNYFAPARGVVLAFSDPVLSARAGDGLGAPLTTPSATSAAVRNVHNAYDVLAKTADEFGASWAWLTVTLLVFCPEHNDELAGWANVVSEGFVGVIAYNYFQAGIGKARVPKGWQWMGATGSQHQRKKAKKGRLGDGVVPSQDNDADDPPASMQSGPVYGTRTDDDAGYFVDEKGEKVPDVLKFRVVDTDMAPAHEASGGSSWSLQIDGTLLDEEAEQRLLEEEKDKFERQQQSRGRSRAAAAGGDAVMMSGGLARSRHGSVMSSIAGGP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.35
3	0.35
4	0.4
5	0.46
6	0.49
7	0.57
8	0.65
9	0.68
10	0.73
11	0.8
12	0.85
13	0.86
14	0.9
15	0.91
16	0.92
17	0.93
18	0.89
19	0.86
20	0.86
21	0.85
22	0.85
23	0.84
24	0.81
25	0.81
26	0.85
27	0.87
28	0.88
29	0.9
30	0.91
31	0.91
32	0.92
33	0.88
34	0.8
35	0.69
36	0.59
37	0.49
38	0.38
39	0.28
40	0.18
41	0.11
42	0.09
43	0.08
44	0.07
45	0.07
46	0.09
47	0.11
48	0.14
49	0.15
50	0.15
51	0.15
52	0.22
53	0.31
54	0.38
55	0.46
56	0.54
57	0.64
58	0.74
59	0.84
60	0.89
61	0.91
62	0.91
63	0.91
64	0.91
65	0.85
66	0.81
67	0.71
68	0.61
69	0.51
70	0.42
71	0.33
72	0.23
73	0.18
74	0.12
75	0.11
76	0.1
77	0.09
78	0.08
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.05
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.05
91	0.05
92	0.05
93	0.05
94	0.07
95	0.09
96	0.1
97	0.13
98	0.2
99	0.31
100	0.41
101	0.51
102	0.59
103	0.68
104	0.78
105	0.87
106	0.91
107	0.91
108	0.92
109	0.92
110	0.91
111	0.88
112	0.88
113	0.83
114	0.75
115	0.71
116	0.63
117	0.54
118	0.47
119	0.41
120	0.31
121	0.26
122	0.24
123	0.22
124	0.24
125	0.22
126	0.21
127	0.21
128	0.24
129	0.24
130	0.23
131	0.18
132	0.15
133	0.15
134	0.14
135	0.13
136	0.11
137	0.17
138	0.16
139	0.15
140	0.15
141	0.16
142	0.17
143	0.23
144	0.27
145	0.23
146	0.27
147	0.34
148	0.37
149	0.45
150	0.5
151	0.53
152	0.6
153	0.68
154	0.76
155	0.8
156	0.87
157	0.89
158	0.94
159	0.95
160	0.96
161	0.96
162	0.96
163	0.95
164	0.95
165	0.93
166	0.89
167	0.87
168	0.8
169	0.71
170	0.6
171	0.52
172	0.41
173	0.32
174	0.24
175	0.16
176	0.12
177	0.09
178	0.08
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.07
209	0.08
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.09
219	0.09
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.05
225	0.04
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.08
231	0.09
232	0.1
233	0.11
234	0.16
235	0.17
236	0.21
237	0.23
238	0.23
239	0.23
240	0.23
241	0.23
242	0.19
243	0.17
244	0.14
245	0.11
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.06
251	0.05
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.04
287	0.05
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.03
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.06
307	0.07
308	0.09
309	0.12
310	0.16
311	0.16
312	0.18
313	0.18
314	0.17
315	0.17
316	0.15
317	0.13
318	0.14
319	0.14
320	0.12
321	0.12
322	0.12
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.13
350	0.14
351	0.1
352	0.09
353	0.08
354	0.08
355	0.07
356	0.07
357	0.04
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.06
373	0.08
374	0.09
375	0.12
376	0.15
377	0.17
378	0.18
379	0.21
380	0.24
381	0.3
382	0.32
383	0.31
384	0.3
385	0.3
386	0.31
387	0.31
388	0.28
389	0.24
390	0.3
391	0.35
392	0.37
393	0.41
394	0.48
395	0.53
396	0.63
397	0.67
398	0.69
399	0.7
400	0.75
401	0.77
402	0.78
403	0.74
404	0.68
405	0.64
406	0.55
407	0.48
408	0.4
409	0.32
410	0.23
411	0.2
412	0.15
413	0.12
414	0.11
415	0.12
416	0.11
417	0.12
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.1
426	0.11
427	0.13
428	0.13
429	0.15
430	0.16
431	0.17
432	0.16
433	0.15
434	0.14
435	0.13
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.11
440	0.14
441	0.14
442	0.14
443	0.16
444	0.17
445	0.15
446	0.15
447	0.19
448	0.22
449	0.28
450	0.28
451	0.3
452	0.29
453	0.3
454	0.33
455	0.3
456	0.26
457	0.21
458	0.26
459	0.22
460	0.22
461	0.23
462	0.18
463	0.17
464	0.16
465	0.15
466	0.1
467	0.11
468	0.1
469	0.09
470	0.1
471	0.1
472	0.08
473	0.09
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.08
480	0.07
481	0.07
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.1
486	0.08
487	0.08
488	0.1
489	0.11
490	0.12
491	0.16
492	0.17
493	0.23
494	0.29
495	0.31
496	0.34
497	0.41
498	0.5
499	0.5
500	0.58
501	0.6
502	0.65
503	0.73
504	0.74
505	0.7
506	0.62
507	0.6
508	0.56
509	0.49
510	0.4
511	0.31
512	0.28
513	0.23
514	0.2
515	0.17
516	0.11
517	0.08
518	0.06
519	0.05
520	0.04
521	0.05
522	0.07
523	0.08
524	0.1
525	0.13
526	0.15
527	0.17
528	0.17
529	0.18
530	0.18
531	0.23
532	0.22

W2S4E4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer