Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2SDM0

Protein Details
Accession W2SDM0    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-124AGAPAKKKSKTAPKKPKTITDLVHydrophilic
460-510AAARTKTPAKEPREPKKRKKASTEASASVESPKPKPQKRKPKAALSEERIVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-118APVRKGAAGAPAKKKSKTAPKKPK
451-502KTKTVKKPRAAARTKTPAKEPREPKKRKKASTEASASVESPKPKPQKRKPKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSNTDQRAVEQHNHPATPHLQTKAVPRRSDWTPIKDDDVSVLALAFGHAAPKEDLMSNFGFNIAKSGRASSDVFVAGADIAKRRRIDLVEGVGPAPVRKGAAGAPAKKKSKTAPKKPKTITDLVTSHHQVRGKGNSPMAEFLVSTQVRARETVPEDNIEVATTSTKIKAAAGRPHGRKPTLLSPLSAMKAFEQQQAVFGTASQLVRDDALVEMELSSDPMSPQRTQPTSIGSVTPQTNRGSTRFMKTRNLWSAGDRDEDNALLHTDVVDLHSTPHVRAALAGKDALIETDWRSKGPPAAQSSSSLPNAIRAGMLGDVDVLSSPRIHSRLESVPGSYRPYSTSRAVQAIHASDAAESKEGVDAQETAAAQPQDKPSYAGMHITDLQKLVKNYGFKAIKSRQKMIDLLDKCWEEKEMRRLAKNRPPEATQSVAPKQSDFISNVHDLSNRLVPKTKTVKKPRAAARTKTPAKEPREPKKRKKASTEASASVESPKPKPQKRKPKAALSEERIVDVDDIQDDDFTTLNDLPEDKRKLRGAARPPTPPATLPAAHEDGPQTQNSKSHSLGHDVGHPPIVGPEIGEQIHSAILHQSEEAAADEERNHAQHPTWHEKMLMYDPIVIEDLARWLNAEGLDKVHEDREVTVIEVRDWCESKGICCMWKGGWRGQASKGGAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.43
4 0.43
5 0.44
6 0.37
7 0.35
8 0.37
9 0.48
10 0.53
11 0.58
12 0.52
13 0.49
14 0.52
15 0.53
16 0.61
17 0.59
18 0.56
19 0.55
20 0.55
21 0.57
22 0.53
23 0.49
24 0.4
25 0.34
26 0.26
27 0.19
28 0.16
29 0.11
30 0.09
31 0.09
32 0.07
33 0.05
34 0.07
35 0.08
36 0.1
37 0.11
38 0.12
39 0.14
40 0.16
41 0.17
42 0.19
43 0.2
44 0.18
45 0.18
46 0.19
47 0.17
48 0.14
49 0.19
50 0.16
51 0.17
52 0.18
53 0.2
54 0.19
55 0.22
56 0.24
57 0.19
58 0.22
59 0.19
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.16
68 0.21
69 0.22
70 0.23
71 0.27
72 0.28
73 0.32
74 0.34
75 0.38
76 0.36
77 0.36
78 0.35
79 0.31
80 0.29
81 0.23
82 0.17
83 0.12
84 0.09
85 0.08
86 0.1
87 0.1
88 0.19
89 0.26
90 0.33
91 0.41
92 0.5
93 0.55
94 0.55
95 0.57
96 0.58
97 0.62
98 0.65
99 0.68
100 0.71
101 0.75
102 0.84
103 0.86
104 0.86
105 0.82
106 0.78
107 0.7
108 0.66
109 0.59
110 0.51
111 0.52
112 0.46
113 0.41
114 0.37
115 0.36
116 0.31
117 0.35
118 0.41
119 0.38
120 0.4
121 0.41
122 0.4
123 0.39
124 0.38
125 0.33
126 0.25
127 0.21
128 0.17
129 0.22
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.2
134 0.21
135 0.22
136 0.22
137 0.2
138 0.25
139 0.31
140 0.3
141 0.29
142 0.29
143 0.28
144 0.27
145 0.2
146 0.16
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.17
156 0.23
157 0.3
158 0.38
159 0.46
160 0.5
161 0.57
162 0.61
163 0.57
164 0.53
165 0.5
166 0.5
167 0.49
168 0.45
169 0.39
170 0.35
171 0.38
172 0.37
173 0.32
174 0.24
175 0.17
176 0.21
177 0.23
178 0.24
179 0.22
180 0.2
181 0.22
182 0.22
183 0.22
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.13
188 0.13
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.09
207 0.12
208 0.12
209 0.16
210 0.23
211 0.25
212 0.27
213 0.28
214 0.29
215 0.3
216 0.29
217 0.27
218 0.2
219 0.22
220 0.22
221 0.22
222 0.21
223 0.19
224 0.2
225 0.22
226 0.23
227 0.25
228 0.26
229 0.31
230 0.34
231 0.37
232 0.42
233 0.44
234 0.51
235 0.51
236 0.52
237 0.45
238 0.41
239 0.42
240 0.36
241 0.34
242 0.26
243 0.21
244 0.17
245 0.17
246 0.15
247 0.11
248 0.1
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.06
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.16
281 0.19
282 0.21
283 0.25
284 0.23
285 0.26
286 0.27
287 0.28
288 0.3
289 0.3
290 0.27
291 0.22
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.14
296 0.11
297 0.07
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.06
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.13
315 0.16
316 0.19
317 0.19
318 0.18
319 0.2
320 0.21
321 0.24
322 0.2
323 0.17
324 0.16
325 0.19
326 0.22
327 0.21
328 0.23
329 0.21
330 0.23
331 0.23
332 0.22
333 0.21
334 0.17
335 0.16
336 0.13
337 0.11
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.12
357 0.14
358 0.14
359 0.14
360 0.16
361 0.14
362 0.17
363 0.17
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.17
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.25
379 0.25
380 0.23
381 0.32
382 0.37
383 0.42
384 0.45
385 0.49
386 0.43
387 0.45
388 0.46
389 0.41
390 0.42
391 0.37
392 0.34
393 0.34
394 0.31
395 0.28
396 0.26
397 0.25
398 0.18
399 0.22
400 0.28
401 0.32
402 0.35
403 0.41
404 0.45
405 0.53
406 0.58
407 0.62
408 0.58
409 0.53
410 0.52
411 0.51
412 0.5
413 0.44
414 0.39
415 0.36
416 0.35
417 0.35
418 0.33
419 0.28
420 0.25
421 0.24
422 0.24
423 0.19
424 0.17
425 0.18
426 0.19
427 0.19
428 0.19
429 0.18
430 0.16
431 0.17
432 0.21
433 0.18
434 0.18
435 0.22
436 0.22
437 0.29
438 0.39
439 0.45
440 0.5
441 0.6
442 0.68
443 0.7
444 0.78
445 0.79
446 0.79
447 0.79
448 0.74
449 0.73
450 0.74
451 0.74
452 0.68
453 0.67
454 0.65
455 0.64
456 0.68
457 0.68
458 0.69
459 0.73
460 0.81
461 0.83
462 0.86
463 0.89
464 0.87
465 0.87
466 0.87
467 0.84
468 0.84
469 0.79
470 0.71
471 0.64
472 0.57
473 0.48
474 0.41
475 0.36
476 0.29
477 0.25
478 0.3
479 0.37
480 0.44
481 0.55
482 0.62
483 0.7
484 0.77
485 0.86
486 0.86
487 0.87
488 0.88
489 0.87
490 0.86
491 0.81
492 0.79
493 0.68
494 0.6
495 0.49
496 0.41
497 0.31
498 0.21
499 0.15
500 0.08
501 0.09
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.11
513 0.13
514 0.21
515 0.28
516 0.27
517 0.32
518 0.35
519 0.4
520 0.46
521 0.52
522 0.53
523 0.57
524 0.61
525 0.61
526 0.63
527 0.61
528 0.56
529 0.48
530 0.42
531 0.38
532 0.33
533 0.29
534 0.31
535 0.29
536 0.28
537 0.28
538 0.26
539 0.25
540 0.26
541 0.25
542 0.22
543 0.2
544 0.24
545 0.26
546 0.29
547 0.26
548 0.31
549 0.31
550 0.35
551 0.37
552 0.34
553 0.38
554 0.36
555 0.35
556 0.3
557 0.28
558 0.22
559 0.19
560 0.19
561 0.11
562 0.1
563 0.11
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.12
568 0.11
569 0.12
570 0.11
571 0.1
572 0.1
573 0.1
574 0.11
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.1
583 0.1
584 0.13
585 0.15
586 0.15
587 0.15
588 0.15
589 0.17
590 0.21
591 0.29
592 0.36
593 0.37
594 0.37
595 0.38
596 0.37
597 0.4
598 0.39
599 0.35
600 0.27
601 0.27
602 0.25
603 0.25
604 0.25
605 0.21
606 0.16
607 0.12
608 0.14
609 0.11
610 0.11
611 0.1
612 0.1
613 0.12
614 0.13
615 0.16
616 0.14
617 0.15
618 0.17
619 0.18
620 0.2
621 0.19
622 0.19
623 0.17
624 0.17
625 0.19
626 0.17
627 0.18
628 0.2
629 0.19
630 0.2
631 0.22
632 0.22
633 0.25
634 0.26
635 0.25
636 0.27
637 0.27
638 0.26
639 0.32
640 0.33
641 0.31
642 0.3
643 0.33
644 0.31
645 0.37
646 0.4
647 0.39
648 0.43
649 0.45
650 0.48
651 0.5
652 0.54