FuNGI

W2RP42

Protein Details

Accession

W2RP42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
62-87	PSTASKSTRHAPPPQRNARPSPRSND	Hydrophilic
772-794	EHSTQRNKTSRPNLRARKRVAAK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011502 Nucleoporin_Nup85
Gene Ontology	GO:0031965 C:nuclear membrane GO:0031080 C:nuclear pore outer ring GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF07575 Nucleopor_Nup85

Amino Acid Sequences

MNQFSADFSSSPAQTPPRRRDLFFNEPNISSTTPLVPPPSTVFGSSRFGSGKSNTLFGKQTPSTASKSTRHAPPPQRNARPSPRSNDFHSSYATSRGSESTERDGFEEDEPIPVQSLMKFSTNSARQSKSRSVFKRSTNSHSTLPNKGQPAVISGLARDLGSRAKAAPLEDDDALLLDTELFLQQLHNEKEQNMDEDGMRSLIDVQVKDLLNLWRNNADSTGHDTTDIGPPASAAAFDKANYLASLILNLHHPGESSIPGVILTWLNNHHVSYDPLLRSVASAQPNPTAHDLFWDAVLALVLRGRLQDAMRLLADADFQYAATAMDDGEQDPGFHGAQLQTIQSVIFRARQVINSCPGMTGDWETTSEEWNNYRGNIEAELENLGHLASGGDDDDDFEAENFGVNKPRRELLRKSQRSRNLPWSIYQGVRVLYSILSGGADETIAQSQDWLEAACALTIWWDGASDSSIQKWRLDVSQAPEDAPLASYLSRLRDAFLCVTDPEGKNTFPINSLSPVEVALGCALQGNVSGFLTVTRVLSQCVAAAIAEIASTAGWIGSGSNAGFDLDDLMVLSYGGVKPDLTKDDVLTQYAAALFGLSSLATENPSGVIEVEGWEVSLSILSRLDDEQLTRDSVHELLDQLPVSDQARTEKIINLCTDLRFMDEARAMSDKLGDHLAHNTTQYGLALLCYAKSHNAVRIQQLTEMLISYCLVQSCPYPEENELDEALRGLVETPKSAFAAIIDADPEAASILQFYVVGYACVRRIFVLRDQEHSTQRNKTSRPNLRARKRVAAKAIVAAVNSAADSIYGGLYDAERQTAIQADALLPLLGEATALLAKDHDNRSFTNEQMYALLAAIEDLETVNARVREATDACLSASIGEYRGSQPPSPRAMLKKSMSSGKDSNFSFSLMGSEMMGSGTSGGGRSDGSAVLVDGKGEGVRQMQRGWDWREAFRGVPVEEVGRVVLTTLRKGIAKELAMGELEL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.48
3	0.53
4	0.59
5	0.63
6	0.64
7	0.69
8	0.7
9	0.72
10	0.7
11	0.7
12	0.64
13	0.6
14	0.59
15	0.53
16	0.44
17	0.35
18	0.29
19	0.25
20	0.22
21	0.24
22	0.26
23	0.23
24	0.25
25	0.27
26	0.3
27	0.28
28	0.28
29	0.28
30	0.28
31	0.32
32	0.3
33	0.29
34	0.26
35	0.25
36	0.28
37	0.28
38	0.32
39	0.29
40	0.33
41	0.3
42	0.33
43	0.35
44	0.32
45	0.38
46	0.31
47	0.32
48	0.33
49	0.36
50	0.36
51	0.4
52	0.45
53	0.41
54	0.47
55	0.51
56	0.55
57	0.58
58	0.64
59	0.68
60	0.73
61	0.79
62	0.83
63	0.85
64	0.83
65	0.85
66	0.86
67	0.85
68	0.81
69	0.79
70	0.78
71	0.72
72	0.73
73	0.71
74	0.65
75	0.57
76	0.53
77	0.48
78	0.41
79	0.43
80	0.37
81	0.29
82	0.27
83	0.26
84	0.26
85	0.26
86	0.28
87	0.29
88	0.31
89	0.31
90	0.3
91	0.31
92	0.29
93	0.27
94	0.26
95	0.19
96	0.19
97	0.18
98	0.17
99	0.16
100	0.14
101	0.14
102	0.12
103	0.15
104	0.14
105	0.16
106	0.17
107	0.18
108	0.27
109	0.31
110	0.37
111	0.41
112	0.44
113	0.45
114	0.51
115	0.59
116	0.58
117	0.63
118	0.62
119	0.65
120	0.67
121	0.72
122	0.75
123	0.71
124	0.72
125	0.69
126	0.66
127	0.62
128	0.63
129	0.59
130	0.57
131	0.57
132	0.54
133	0.5
134	0.47
135	0.44
136	0.36
137	0.35
138	0.3
139	0.26
140	0.2
141	0.17
142	0.17
143	0.16
144	0.15
145	0.12
146	0.11
147	0.11
148	0.12
149	0.13
150	0.13
151	0.15
152	0.17
153	0.17
154	0.2
155	0.19
156	0.22
157	0.21
158	0.2
159	0.17
160	0.16
161	0.15
162	0.11
163	0.08
164	0.04
165	0.04
166	0.05
167	0.05
168	0.04
169	0.04
170	0.05
171	0.08
172	0.16
173	0.2
174	0.23
175	0.24
176	0.25
177	0.3
178	0.31
179	0.31
180	0.24
181	0.23
182	0.2
183	0.19
184	0.2
185	0.15
186	0.13
187	0.1
188	0.09
189	0.11
190	0.13
191	0.12
192	0.12
193	0.18
194	0.18
195	0.18
196	0.21
197	0.23
198	0.26
199	0.28
200	0.29
201	0.26
202	0.27
203	0.28
204	0.26
205	0.22
206	0.18
207	0.25
208	0.25
209	0.22
210	0.21
211	0.21
212	0.21
213	0.26
214	0.24
215	0.17
216	0.13
217	0.13
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.09
233	0.08
234	0.09
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.1
240	0.09
241	0.11
242	0.11
243	0.1
244	0.1
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.09
252	0.1
253	0.13
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.16
259	0.17
260	0.22
261	0.19
262	0.2
263	0.2
264	0.19
265	0.18
266	0.18
267	0.2
268	0.18
269	0.19
270	0.2
271	0.25
272	0.25
273	0.27
274	0.28
275	0.24
276	0.2
277	0.2
278	0.21
279	0.16
280	0.15
281	0.13
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.06
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.08
293	0.08
294	0.11
295	0.12
296	0.14
297	0.13
298	0.13
299	0.13
300	0.11
301	0.12
302	0.08
303	0.08
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.09
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.1
334	0.1
335	0.13
336	0.14
337	0.18
338	0.21
339	0.23
340	0.26
341	0.25
342	0.24
343	0.21
344	0.21
345	0.17
346	0.15
347	0.14
348	0.11
349	0.09
350	0.1
351	0.11
352	0.11
353	0.13
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.14
358	0.14
359	0.13
360	0.13
361	0.12
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.1
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.09
370	0.07
371	0.06
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.04
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.13
391	0.15
392	0.17
393	0.19
394	0.22
395	0.25
396	0.31
397	0.37
398	0.41
399	0.51
400	0.58
401	0.63
402	0.68
403	0.72
404	0.73
405	0.72
406	0.71
407	0.66
408	0.58
409	0.53
410	0.5
411	0.45
412	0.39
413	0.34
414	0.25
415	0.19
416	0.18
417	0.16
418	0.11
419	0.08
420	0.08
421	0.06
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.06
454	0.07
455	0.11
456	0.12
457	0.12
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.15
462	0.16
463	0.17
464	0.21
465	0.21
466	0.2
467	0.19
468	0.18
469	0.16
470	0.14
471	0.09
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.07
476	0.08
477	0.1
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.1
486	0.12
487	0.16
488	0.15
489	0.16
490	0.16
491	0.16
492	0.16
493	0.17
494	0.16
495	0.12
496	0.13
497	0.12
498	0.13
499	0.13
500	0.12
501	0.12
502	0.11
503	0.1
504	0.09
505	0.08
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.06
523	0.07
524	0.07
525	0.08
526	0.08
527	0.07
528	0.07
529	0.06
530	0.05
531	0.04
532	0.04
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.02
538	0.02
539	0.02
540	0.02
541	0.02
542	0.02
543	0.02
544	0.02
545	0.03
546	0.03
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.05
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.05
564	0.04
565	0.05
566	0.08
567	0.1
568	0.11
569	0.11
570	0.12
571	0.16
572	0.17
573	0.17
574	0.15
575	0.13
576	0.11
577	0.11
578	0.1
579	0.05
580	0.05
581	0.04
582	0.03
583	0.04
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.04
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.04
604	0.05
605	0.04
606	0.04
607	0.05
608	0.05
609	0.06
610	0.07
611	0.08
612	0.08
613	0.09
614	0.1
615	0.11
616	0.12
617	0.11
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.12
622	0.1
623	0.1
624	0.1
625	0.12
626	0.11
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.1
632	0.09
633	0.1
634	0.12
635	0.14
636	0.15
637	0.18
638	0.19
639	0.22
640	0.22
641	0.23
642	0.23
643	0.21
644	0.21
645	0.16
646	0.16
647	0.14
648	0.14
649	0.13
650	0.14
651	0.14
652	0.14
653	0.16
654	0.14
655	0.13
656	0.15
657	0.12
658	0.11
659	0.14
660	0.12
661	0.11
662	0.14
663	0.16
664	0.15
665	0.15
666	0.14
667	0.12
668	0.12
669	0.11
670	0.09
671	0.07
672	0.06
673	0.07
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.07
678	0.08
679	0.11
680	0.13
681	0.17
682	0.23
683	0.26
684	0.3
685	0.34
686	0.34
687	0.32
688	0.31
689	0.27
690	0.21
691	0.18
692	0.13
693	0.09
694	0.08
695	0.07
696	0.08
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.08
701	0.11
702	0.14
703	0.14
704	0.15
705	0.16
706	0.19
707	0.2
708	0.21
709	0.18
710	0.16
711	0.15
712	0.13
713	0.12
714	0.09
715	0.07
716	0.06
717	0.08
718	0.08
719	0.09
720	0.1
721	0.12
722	0.12
723	0.12
724	0.11
725	0.09
726	0.1
727	0.1
728	0.09
729	0.08
730	0.07
731	0.07
732	0.07
733	0.07
734	0.05
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.04
741	0.04
742	0.06
743	0.06
744	0.07
745	0.07
746	0.09
747	0.1
748	0.11
749	0.11
750	0.1
751	0.13
752	0.16
753	0.22
754	0.31
755	0.31
756	0.35
757	0.4
758	0.44
759	0.48
760	0.5
761	0.49
762	0.45
763	0.51
764	0.55
765	0.53
766	0.57
767	0.62
768	0.67
769	0.71
770	0.75
771	0.78
772	0.8
773	0.86
774	0.82
775	0.82
776	0.79
777	0.77
778	0.73
779	0.68
780	0.59
781	0.54
782	0.51
783	0.41
784	0.34
785	0.27
786	0.2
787	0.14
788	0.13
789	0.09
790	0.05
791	0.04
792	0.04
793	0.05
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.05
798	0.05
799	0.08
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.08
804	0.09
805	0.12
806	0.12
807	0.1
808	0.11
809	0.1
810	0.11
811	0.11
812	0.1
813	0.07
814	0.07
815	0.06
816	0.05
817	0.04
818	0.03
819	0.04
820	0.05
821	0.05
822	0.05
823	0.06
824	0.08
825	0.15
826	0.19
827	0.22
828	0.24
829	0.25
830	0.32
831	0.35
832	0.34
833	0.34
834	0.3
835	0.28
836	0.26
837	0.26
838	0.19
839	0.15
840	0.15
841	0.08
842	0.07
843	0.06
844	0.05
845	0.04
846	0.04
847	0.04
848	0.05
849	0.06
850	0.1
851	0.11
852	0.11
853	0.12
854	0.13
855	0.18
856	0.19
857	0.22
858	0.2
859	0.2
860	0.2
861	0.2
862	0.19
863	0.14
864	0.14
865	0.12
866	0.1
867	0.11
868	0.12
869	0.15
870	0.21
871	0.24
872	0.25
873	0.31
874	0.37
875	0.41
876	0.43
877	0.46
878	0.47
879	0.5
880	0.56
881	0.54
882	0.54
883	0.53
884	0.58
885	0.54
886	0.54
887	0.53
888	0.48
889	0.51
890	0.45
891	0.45
892	0.37
893	0.36
894	0.3
895	0.24
896	0.22
897	0.16
898	0.15
899	0.11
900	0.1
901	0.09
902	0.09
903	0.08
904	0.06
905	0.06
906	0.05
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.06
911	0.07
912	0.08
913	0.09
914	0.09
915	0.09
916	0.09
917	0.09
918	0.12
919	0.11
920	0.1
921	0.09
922	0.1
923	0.09
924	0.09
925	0.11
926	0.13
927	0.18
928	0.2
929	0.22
930	0.25
931	0.31
932	0.39
933	0.43
934	0.46
935	0.45
936	0.45
937	0.49
938	0.47
939	0.42
940	0.39
941	0.38
942	0.3
943	0.28
944	0.27
945	0.23
946	0.22
947	0.21
948	0.17
949	0.12
950	0.12
951	0.1
952	0.13
953	0.14
954	0.16
955	0.18
956	0.2
957	0.22
958	0.23
959	0.28
960	0.31
961	0.29
962	0.31
963	0.3
964	0.29

W2RP42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer