FuNGI

W2S5L9

Protein Details

Accession

W2S5L9

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
157-177	FSLAKYTLRKHRKYIKRFTVL	Hydrophilic
369-395	AKLKSNRRSNYFRKRRRWERARAVIDE	Hydrophilic
468-488	EETTTTTRKRRQQHVPSEDFP	Hydrophilic
539-558	GKVAARGKGRRNVRNKLVRD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
374-388	NRRSNYFRKRRRWER
543-549	ARGKGRR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 11.5, cyto 11, nucl 10, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017423 TRM6
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0031515 C:tRNA (m1A) methyltransferase complex GO:0030488 P:tRNA methylation
Pfam	View protein in Pfam PF04189 Gcd10p

Amino Acid Sequences

MDFTTIRPFQHVVLRLPNDQTRIERLNPNSLISLGKYGSFHTNQLFGRPYHLTFEILDKSEARPDRELRIISAAELHAAELLEEAGGEEGTPPSNEVDEYGLLTGDKSNVNIMDDPLNQRLTMSEIEELKQDDMGSTKELIAKIMSSHTNLDQKTAFSLAKYTLRKHRKYIKRFTVLPLDVATLTDFMMVEKDFTRVMEIRNEVLGLIGCWANIHASGDPLPSAQSSSRYLVVDDTGGLVAAAMAERMGILHQAYPSSQIETEEDVDIDNLDEPTETTSSIVAAPPVKPRRQAYAADQMSASSNTLTVIHSNQQPNLALLRYFNFDSMNPTATHPLYSHLKTLSWLQLIEPESDSAYIEPPILPPHELAKLKSNRRSNYFRKRRRWERARAVIDETRAGGFDGLVVASYTNPTSILQHLVPLLAGGSQVVVYSPQMEPLLSLTDYYSTARRTAFLSLQDDGDGDDDDEETTTTTRKRRQQHVPSEDFPVDPTLLLAPMVQTSRVRKWQVLPGRTHPVMTSKGGAEGYVWTATRVVRAEGKVAARGKGRRNVRNKLVRDEVGAVEDGVTNGAGMYATTDADGQQDSKRLKLGDEGEGIGEDVVVGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.46
3	0.5
4	0.51
5	0.47
6	0.45
7	0.44
8	0.42
9	0.43
10	0.44
11	0.47
12	0.47
13	0.53
14	0.51
15	0.49
16	0.43
17	0.39
18	0.35
19	0.28
20	0.28
21	0.19
22	0.19
23	0.18
24	0.19
25	0.25
26	0.25
27	0.27
28	0.25
29	0.31
30	0.3
31	0.34
32	0.36
33	0.29
34	0.32
35	0.33
36	0.32
37	0.3
38	0.31
39	0.27
40	0.24
41	0.3
42	0.29
43	0.27
44	0.28
45	0.24
46	0.24
47	0.31
48	0.34
49	0.33
50	0.35
51	0.36
52	0.4
53	0.45
54	0.45
55	0.39
56	0.4
57	0.36
58	0.29
59	0.3
60	0.24
61	0.18
62	0.17
63	0.15
64	0.11
65	0.1
66	0.1
67	0.07
68	0.07
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.04
73	0.04
74	0.04
75	0.05
76	0.05
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.08
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.11
85	0.1
86	0.11
87	0.11
88	0.1
89	0.09
90	0.1
91	0.1
92	0.09
93	0.1
94	0.09
95	0.11
96	0.12
97	0.14
98	0.15
99	0.15
100	0.18
101	0.2
102	0.23
103	0.24
104	0.24
105	0.22
106	0.21
107	0.2
108	0.18
109	0.17
110	0.15
111	0.16
112	0.16
113	0.17
114	0.19
115	0.2
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.11
120	0.11
121	0.12
122	0.12
123	0.11
124	0.13
125	0.15
126	0.15
127	0.15
128	0.14
129	0.14
130	0.13
131	0.16
132	0.16
133	0.14
134	0.16
135	0.2
136	0.25
137	0.25
138	0.27
139	0.24
140	0.23
141	0.23
142	0.24
143	0.2
144	0.14
145	0.16
146	0.16
147	0.23
148	0.26
149	0.3
150	0.37
151	0.47
152	0.51
153	0.57
154	0.65
155	0.68
156	0.74
157	0.8
158	0.8
159	0.78
160	0.77
161	0.73
162	0.72
163	0.63
164	0.54
165	0.44
166	0.34
167	0.26
168	0.24
169	0.19
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.07
174	0.05
175	0.06
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.12
183	0.12
184	0.14
185	0.18
186	0.19
187	0.19
188	0.19
189	0.19
190	0.15
191	0.14
192	0.12
193	0.07
194	0.07
195	0.06
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.07
202	0.05
203	0.07
204	0.07
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.1
213	0.13
214	0.14
215	0.17
216	0.16
217	0.17
218	0.16
219	0.15
220	0.13
221	0.1
222	0.09
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.02
234	0.02
235	0.02
236	0.03
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.13
249	0.14
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.06
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.07
269	0.06
270	0.07
271	0.09
272	0.17
273	0.22
274	0.23
275	0.27
276	0.29
277	0.33
278	0.36
279	0.37
280	0.35
281	0.4
282	0.39
283	0.35
284	0.33
285	0.27
286	0.25
287	0.22
288	0.17
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.1
297	0.15
298	0.16
299	0.16
300	0.17
301	0.17
302	0.17
303	0.17
304	0.14
305	0.09
306	0.09
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.14
314	0.15
315	0.15
316	0.14
317	0.15
318	0.17
319	0.16
320	0.17
321	0.12
322	0.15
323	0.18
324	0.18
325	0.19
326	0.17
327	0.17
328	0.17
329	0.2
330	0.2
331	0.16
332	0.15
333	0.13
334	0.17
335	0.19
336	0.19
337	0.16
338	0.13
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.07
348	0.08
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.11
353	0.17
354	0.18
355	0.19
356	0.27
357	0.34
358	0.4
359	0.48
360	0.53
361	0.51
362	0.57
363	0.65
364	0.66
365	0.69
366	0.73
367	0.76
368	0.79
369	0.85
370	0.89
371	0.91
372	0.91
373	0.9
374	0.9
375	0.9
376	0.85
377	0.77
378	0.72
379	0.63
380	0.55
381	0.44
382	0.34
383	0.24
384	0.19
385	0.16
386	0.1
387	0.07
388	0.06
389	0.05
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.06
400	0.08
401	0.09
402	0.12
403	0.11
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.11
408	0.09
409	0.08
410	0.05
411	0.05
412	0.04
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.06
420	0.06
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.12
427	0.1
428	0.1
429	0.09
430	0.1
431	0.11
432	0.12
433	0.14
434	0.12
435	0.15
436	0.15
437	0.15
438	0.16
439	0.19
440	0.2
441	0.23
442	0.25
443	0.23
444	0.24
445	0.23
446	0.21
447	0.18
448	0.15
449	0.11
450	0.07
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.09
459	0.13
460	0.19
461	0.27
462	0.35
463	0.44
464	0.53
465	0.64
466	0.72
467	0.79
468	0.82
469	0.82
470	0.76
471	0.74
472	0.65
473	0.54
474	0.44
475	0.35
476	0.26
477	0.18
478	0.16
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.06
484	0.08
485	0.09
486	0.11
487	0.14
488	0.19
489	0.26
490	0.34
491	0.37
492	0.38
493	0.43
494	0.5
495	0.57
496	0.58
497	0.58
498	0.57
499	0.63
500	0.59
501	0.55
502	0.47
503	0.42
504	0.39
505	0.35
506	0.31
507	0.22
508	0.25
509	0.24
510	0.22
511	0.18
512	0.15
513	0.16
514	0.15
515	0.14
516	0.12
517	0.14
518	0.14
519	0.17
520	0.17
521	0.17
522	0.21
523	0.22
524	0.24
525	0.27
526	0.29
527	0.32
528	0.33
529	0.35
530	0.36
531	0.42
532	0.47
533	0.51
534	0.59
535	0.62
536	0.69
537	0.74
538	0.78
539	0.81
540	0.78
541	0.78
542	0.76
543	0.68
544	0.63
545	0.57
546	0.47
547	0.39
548	0.34
549	0.26
550	0.19
551	0.17
552	0.13
553	0.1
554	0.09
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.04
560	0.05
561	0.06
562	0.06
563	0.07
564	0.07
565	0.07
566	0.09
567	0.11
568	0.11
569	0.14
570	0.21
571	0.22
572	0.24
573	0.28
574	0.28
575	0.28
576	0.33
577	0.34
578	0.34
579	0.35
580	0.34
581	0.3
582	0.29
583	0.28
584	0.2
585	0.16

W2S5L9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer