Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W2RNH8

Protein Details
Accession W2RNH8    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAKKKASKQPRKPSQAPVAPGHydrophilic
133-158NRPATPGKRATPNRKRKQADREPSTTHydrophilic
163-183LIPQAVKKRRIAPRRAKSVSFHydrophilic
472-494APMQWVRKRRFERTKRTRVEDIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-11KKASKQPR
139-149GKRATPNRKRK
169-178KKRRIAPRRA
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 12.999, mito_nucl 11.832, cyto_nucl 5.499, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MAKKKASKQPRKPSQAPVAPGTAHGFITLNLSTELLATFGQSASQQEQEKRKDQNAEAAKKIFVPVVSVENHSITRAGGRTHVAPNTANQPPTGASDMQTRGAWGVNRSNPKRQKTAATDIKSEPDHDALPLNRPATPGKRATPNRKRKQADREPSTTVPDVLIPQAVKKRRIAPRRAKSVSFDPEADVVIIDSATDLVSSTSSPESRNNCDKENQEENDMERPKLNLKFSFNKSNNDGFAKPAPPSTAGSPTAQTPKIKLNFGNKGQDSSGKKRKRADTQQEVPIQTPTSGVPKIKLKTAVTKVSGPSPVTPGAAGLKLQTKGRIPKRHPGVGYDSELSDTERDPVILEGFILRMQPGPDCDYIRDHINRGTMGVSKLQGGADIGISVADTSGRRCSLRVRQNKYAATLVDLPTIIEGMKSWDKMRFIKSVDVCQMMIVLGPIKNDEEAKTYPLPPGVDPKTYQYAHGLTAPMQWVRKRRFERTKRTRVEDIENVDRRVGQLLASDAAALSVVAEQLDYDPRVDEDQYSGTEDEDEDEDDDADGEADDYFAEHNEHVDDEIGEAEVDEFTQMFEDADEDIPSAEAAPATNGAIDSSGFVTSAADSPDVTGSQAPTTAPTPAGEVSTPAAPTPGTDGDNESDDDEDQEDREAQNEEDEQKSQMQERIKDLEGKIVQQMEMLKTQTNLIIKRRLAQKIKELQQDVDMLKRELGQGGDEGDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.84
3 0.79
4 0.71
5 0.64
6 0.55
7 0.5
8 0.44
9 0.34
10 0.26
11 0.22
12 0.18
13 0.14
14 0.18
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.13
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.12
30 0.14
31 0.2
32 0.25
33 0.31
34 0.4
35 0.47
36 0.54
37 0.57
38 0.61
39 0.63
40 0.6
41 0.63
42 0.64
43 0.64
44 0.62
45 0.58
46 0.52
47 0.44
48 0.43
49 0.36
50 0.25
51 0.21
52 0.17
53 0.19
54 0.21
55 0.22
56 0.23
57 0.23
58 0.23
59 0.21
60 0.19
61 0.15
62 0.18
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.2
67 0.23
68 0.28
69 0.3
70 0.28
71 0.27
72 0.29
73 0.33
74 0.35
75 0.32
76 0.26
77 0.26
78 0.24
79 0.27
80 0.27
81 0.21
82 0.18
83 0.24
84 0.26
85 0.27
86 0.26
87 0.23
88 0.2
89 0.22
90 0.23
91 0.2
92 0.26
93 0.31
94 0.41
95 0.45
96 0.55
97 0.61
98 0.65
99 0.68
100 0.65
101 0.67
102 0.64
103 0.7
104 0.7
105 0.65
106 0.64
107 0.59
108 0.6
109 0.51
110 0.45
111 0.37
112 0.29
113 0.25
114 0.2
115 0.24
116 0.2
117 0.25
118 0.27
119 0.26
120 0.24
121 0.26
122 0.3
123 0.31
124 0.35
125 0.35
126 0.36
127 0.46
128 0.54
129 0.64
130 0.69
131 0.75
132 0.8
133 0.85
134 0.86
135 0.85
136 0.87
137 0.87
138 0.87
139 0.83
140 0.78
141 0.74
142 0.69
143 0.65
144 0.55
145 0.44
146 0.34
147 0.27
148 0.23
149 0.17
150 0.17
151 0.12
152 0.15
153 0.23
154 0.28
155 0.31
156 0.34
157 0.43
158 0.5
159 0.59
160 0.66
161 0.69
162 0.74
163 0.81
164 0.81
165 0.74
166 0.7
167 0.69
168 0.64
169 0.56
170 0.47
171 0.38
172 0.34
173 0.32
174 0.26
175 0.17
176 0.11
177 0.08
178 0.06
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.06
189 0.08
190 0.09
191 0.11
192 0.18
193 0.22
194 0.29
195 0.37
196 0.39
197 0.39
198 0.44
199 0.45
200 0.47
201 0.5
202 0.45
203 0.4
204 0.38
205 0.38
206 0.41
207 0.39
208 0.32
209 0.25
210 0.25
211 0.27
212 0.3
213 0.33
214 0.29
215 0.33
216 0.41
217 0.45
218 0.55
219 0.52
220 0.53
221 0.53
222 0.52
223 0.48
224 0.44
225 0.39
226 0.31
227 0.32
228 0.29
229 0.24
230 0.22
231 0.21
232 0.18
233 0.2
234 0.19
235 0.2
236 0.2
237 0.21
238 0.2
239 0.22
240 0.25
241 0.26
242 0.24
243 0.21
244 0.28
245 0.3
246 0.32
247 0.33
248 0.36
249 0.42
250 0.45
251 0.52
252 0.44
253 0.43
254 0.41
255 0.44
256 0.41
257 0.43
258 0.49
259 0.47
260 0.51
261 0.57
262 0.64
263 0.67
264 0.72
265 0.73
266 0.73
267 0.73
268 0.76
269 0.74
270 0.67
271 0.57
272 0.47
273 0.37
274 0.27
275 0.21
276 0.14
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.16
281 0.21
282 0.22
283 0.25
284 0.29
285 0.27
286 0.33
287 0.38
288 0.4
289 0.36
290 0.38
291 0.36
292 0.34
293 0.35
294 0.28
295 0.23
296 0.2
297 0.19
298 0.16
299 0.15
300 0.12
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.15
309 0.17
310 0.26
311 0.35
312 0.43
313 0.43
314 0.51
315 0.57
316 0.6
317 0.56
318 0.51
319 0.49
320 0.43
321 0.42
322 0.34
323 0.27
324 0.22
325 0.22
326 0.19
327 0.13
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.15
352 0.19
353 0.19
354 0.17
355 0.18
356 0.18
357 0.17
358 0.16
359 0.16
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.11
364 0.1
365 0.11
366 0.1
367 0.09
368 0.07
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.05
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.1
384 0.16
385 0.24
386 0.34
387 0.43
388 0.48
389 0.55
390 0.62
391 0.63
392 0.59
393 0.53
394 0.43
395 0.36
396 0.32
397 0.24
398 0.19
399 0.17
400 0.14
401 0.11
402 0.11
403 0.08
404 0.05
405 0.04
406 0.07
407 0.09
408 0.11
409 0.12
410 0.15
411 0.18
412 0.21
413 0.25
414 0.24
415 0.25
416 0.31
417 0.31
418 0.33
419 0.33
420 0.31
421 0.28
422 0.24
423 0.22
424 0.14
425 0.13
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.12
436 0.12
437 0.16
438 0.18
439 0.18
440 0.19
441 0.2
442 0.2
443 0.17
444 0.24
445 0.23
446 0.23
447 0.23
448 0.26
449 0.3
450 0.3
451 0.3
452 0.25
453 0.23
454 0.22
455 0.23
456 0.2
457 0.14
458 0.16
459 0.17
460 0.16
461 0.17
462 0.2
463 0.26
464 0.31
465 0.4
466 0.44
467 0.53
468 0.62
469 0.69
470 0.77
471 0.8
472 0.86
473 0.84
474 0.84
475 0.8
476 0.74
477 0.71
478 0.65
479 0.6
480 0.58
481 0.55
482 0.48
483 0.42
484 0.38
485 0.31
486 0.27
487 0.21
488 0.11
489 0.09
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.05
498 0.04
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.05
505 0.07
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.12
516 0.15
517 0.14
518 0.12
519 0.12
520 0.12
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.07
530 0.06
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.06
540 0.06
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.08
545 0.09
546 0.08
547 0.07
548 0.07
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.04
561 0.05
562 0.05
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.07
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.09
590 0.1
591 0.09
592 0.09
593 0.1
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.11
602 0.12
603 0.13
604 0.14
605 0.13
606 0.12
607 0.14
608 0.14
609 0.15
610 0.13
611 0.13
612 0.14
613 0.15
614 0.15
615 0.12
616 0.12
617 0.11
618 0.11
619 0.14
620 0.15
621 0.15
622 0.15
623 0.18
624 0.19
625 0.22
626 0.22
627 0.18
628 0.16
629 0.15
630 0.15
631 0.13
632 0.12
633 0.11
634 0.12
635 0.13
636 0.12
637 0.13
638 0.14
639 0.13
640 0.16
641 0.19
642 0.21
643 0.22
644 0.23
645 0.23
646 0.25
647 0.27
648 0.27
649 0.29
650 0.32
651 0.34
652 0.38
653 0.42
654 0.41
655 0.45
656 0.42
657 0.47
658 0.42
659 0.39
660 0.38
661 0.35
662 0.32
663 0.27
664 0.3
665 0.24
666 0.26
667 0.25
668 0.22
669 0.21
670 0.23
671 0.25
672 0.27
673 0.3
674 0.33
675 0.4
676 0.39
677 0.47
678 0.54
679 0.59
680 0.62
681 0.63
682 0.67
683 0.69
684 0.76
685 0.77
686 0.72
687 0.64
688 0.59
689 0.58
690 0.5
691 0.46
692 0.4
693 0.32
694 0.3
695 0.3
696 0.28
697 0.24
698 0.23
699 0.18
700 0.16
701 0.17