Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7F1F7

Protein Details
Accession A7F1F7    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-38QPVAIFKKRSAKGKSNFRKRAATPHydrophilic
51-75SSSEDESGRRIKRRKKNTGAITASSHydrophilic
308-331VAKGLKKILEKKRERARKIREEAIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-34KKRSAKGKSNFRKR
59-66RRIKRRKK
311-338GLKKILEKKRERARKIREEAIANGEEKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.5, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0034247  P:snoRNA splicing  
KEGG ssl:SS1G_11427  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MDTPESASIHPDTIQPVAIFKKRSAKGKSNFRKRAATPPPVDSDDDTSGYSSSEDESGRRIKRRKKNTGAITASSTINNNSSNSNDLSATKYIASHNTTIRASDDATRASNWYDENATDALSSKNLLGTTRSKPTSGDAPDGTYKGLANSTKFIQKNPDAPNRVVGPIKAPTNIRTITVTDFAPDVCKDYKTTGFCGFGDNCKYLHAREDYKAGWQLDKEWENVTKGKKTLGGTKIASADRKGEEEDDDDDALLENIPFACILCREKYKDPIITKCGHYFCESCALKRYRKDPSCAACGAGTNGVFNVAKGLKKILEKKRERARKIREEAIANGEEKRISKAPKSIMTGVTATIAFYGDGGECRVPYNGRDERTGGKEVWEVEMVTVGQGEGEMTVGIVGVLMLDLDEGYLMRESISGLNSENGKGGKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.18
3 0.2
4 0.26
5 0.3
6 0.31
7 0.33
8 0.41
9 0.45
10 0.54
11 0.59
12 0.62
13 0.67
14 0.75
15 0.82
16 0.83
17 0.87
18 0.84
19 0.84
20 0.78
21 0.79
22 0.78
23 0.77
24 0.7
25 0.66
26 0.66
27 0.6
28 0.59
29 0.5
30 0.46
31 0.38
32 0.35
33 0.3
34 0.24
35 0.21
36 0.19
37 0.17
38 0.12
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.17
44 0.25
45 0.31
46 0.39
47 0.47
48 0.55
49 0.64
50 0.75
51 0.81
52 0.83
53 0.87
54 0.88
55 0.89
56 0.85
57 0.77
58 0.71
59 0.62
60 0.52
61 0.43
62 0.35
63 0.25
64 0.22
65 0.21
66 0.17
67 0.17
68 0.17
69 0.19
70 0.19
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.2
75 0.19
76 0.19
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.2
81 0.22
82 0.22
83 0.24
84 0.27
85 0.27
86 0.26
87 0.26
88 0.22
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.19
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.19
97 0.19
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.12
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.12
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.07
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.12
115 0.17
116 0.21
117 0.28
118 0.29
119 0.28
120 0.28
121 0.3
122 0.34
123 0.32
124 0.32
125 0.25
126 0.27
127 0.29
128 0.29
129 0.26
130 0.19
131 0.16
132 0.12
133 0.15
134 0.13
135 0.12
136 0.14
137 0.16
138 0.23
139 0.24
140 0.24
141 0.28
142 0.3
143 0.37
144 0.43
145 0.49
146 0.46
147 0.46
148 0.49
149 0.43
150 0.42
151 0.35
152 0.27
153 0.21
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.19
158 0.19
159 0.23
160 0.23
161 0.21
162 0.19
163 0.19
164 0.18
165 0.19
166 0.17
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.12
171 0.1
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.19
178 0.19
179 0.22
180 0.22
181 0.23
182 0.22
183 0.25
184 0.23
185 0.22
186 0.23
187 0.2
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.15
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.2
196 0.23
197 0.21
198 0.23
199 0.27
200 0.23
201 0.2
202 0.17
203 0.18
204 0.2
205 0.21
206 0.2
207 0.17
208 0.18
209 0.19
210 0.23
211 0.23
212 0.21
213 0.2
214 0.2
215 0.23
216 0.23
217 0.29
218 0.29
219 0.31
220 0.29
221 0.3
222 0.33
223 0.3
224 0.3
225 0.23
226 0.23
227 0.18
228 0.19
229 0.17
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.07
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.06
249 0.09
250 0.12
251 0.16
252 0.21
253 0.24
254 0.31
255 0.35
256 0.41
257 0.43
258 0.46
259 0.47
260 0.46
261 0.45
262 0.45
263 0.41
264 0.36
265 0.34
266 0.29
267 0.25
268 0.31
269 0.29
270 0.24
271 0.32
272 0.35
273 0.38
274 0.42
275 0.47
276 0.47
277 0.52
278 0.56
279 0.56
280 0.56
281 0.56
282 0.52
283 0.47
284 0.37
285 0.33
286 0.28
287 0.22
288 0.17
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.16
299 0.17
300 0.24
301 0.34
302 0.39
303 0.48
304 0.54
305 0.63
306 0.72
307 0.79
308 0.8
309 0.81
310 0.82
311 0.82
312 0.82
313 0.8
314 0.75
315 0.68
316 0.63
317 0.59
318 0.5
319 0.4
320 0.34
321 0.28
322 0.24
323 0.21
324 0.23
325 0.22
326 0.23
327 0.27
328 0.32
329 0.38
330 0.43
331 0.48
332 0.47
333 0.44
334 0.43
335 0.39
336 0.33
337 0.28
338 0.22
339 0.16
340 0.12
341 0.1
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.06
346 0.07
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.11
351 0.13
352 0.13
353 0.14
354 0.23
355 0.27
356 0.29
357 0.32
358 0.34
359 0.37
360 0.41
361 0.43
362 0.35
363 0.31
364 0.32
365 0.3
366 0.3
367 0.25
368 0.2
369 0.16
370 0.18
371 0.15
372 0.12
373 0.11
374 0.08
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.08
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.17
407 0.19
408 0.19
409 0.22