Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7EIF6

Protein Details
Accession A7EIF6    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-49SESQSQLRRRKEANKAYGRGHydrophilic
54-75IHSIKDKKLRGNLKKLEARNKTHydrophilic
458-485KIKNRGRGKNSSLRKYLRKKSSRGIIDEHydrophilic
490-509IEELRKSQMQREKNRLKTTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-74RRRKEANKAYGRGGKIPIHSIKDKKLRGNLKKLEARNK
450-480KKPEDPMAKIKNRGRGKNSSLRKYLRKKSSR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ssl:SS1G_05099  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MADTMELTESHLNGALPIKRARTELATTESESQSQLRRRKEANKAYGRGGKIPIHSIKDKKLRGNLKKLEARNKTAILRAKDAEILLENEDGFLEPENDLERTYKVRQDEIKQSVPLETAKKGFELKLDQLGPYVCDYTRNGKDLLLAGRKGHVATMDWREGKLGCELQLGETIRDAKWLHNNQLFAVAQKKYVYIYDGAGVEVHCLKKHIEVTNMEFLPYHYLLATVGNAGHLKYQDVSTGQMVMEMPTKLGSPTSLAQNPRNAILHMGHQNGTVTLWSPNSTTPLVKLLAHRGPVRSLAVDREGRYMVSTGQDMKMSVWDVRMFKEVSIWKGLFSKSSLEQEKIQSPYMAWGCEGKRIERVRWCPFEDVLGTSHDSGFSSILVPGAGEANFDALEVNPFETTKQRQEAEVKSLLNKLQPEMISLDPNYIGNLDLRSDEQRKAEKDLDKKPEDPMAKIKNRGRGKNSSLRKYLRKKSSRGIIDEQRDRIEELRKSQMQREKNRLKTTEEELGPALGRFAKKSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.24
4 0.28
5 0.31
6 0.31
7 0.33
8 0.35
9 0.35
10 0.35
11 0.35
12 0.37
13 0.37
14 0.37
15 0.41
16 0.39
17 0.34
18 0.31
19 0.29
20 0.31
21 0.37
22 0.41
23 0.43
24 0.5
25 0.57
26 0.65
27 0.73
28 0.75
29 0.78
30 0.8
31 0.77
32 0.78
33 0.77
34 0.7
35 0.64
36 0.58
37 0.52
38 0.45
39 0.49
40 0.47
41 0.46
42 0.51
43 0.52
44 0.56
45 0.61
46 0.64
47 0.64
48 0.67
49 0.72
50 0.74
51 0.79
52 0.78
53 0.78
54 0.8
55 0.81
56 0.82
57 0.79
58 0.76
59 0.71
60 0.67
61 0.6
62 0.59
63 0.58
64 0.52
65 0.5
66 0.45
67 0.4
68 0.37
69 0.34
70 0.29
71 0.23
72 0.2
73 0.17
74 0.16
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.16
90 0.2
91 0.24
92 0.24
93 0.3
94 0.36
95 0.41
96 0.49
97 0.51
98 0.53
99 0.5
100 0.48
101 0.43
102 0.38
103 0.35
104 0.28
105 0.24
106 0.22
107 0.21
108 0.22
109 0.23
110 0.22
111 0.22
112 0.24
113 0.24
114 0.28
115 0.29
116 0.27
117 0.27
118 0.26
119 0.23
120 0.19
121 0.18
122 0.11
123 0.14
124 0.16
125 0.22
126 0.26
127 0.27
128 0.26
129 0.25
130 0.27
131 0.27
132 0.31
133 0.28
134 0.26
135 0.24
136 0.25
137 0.26
138 0.24
139 0.21
140 0.15
141 0.12
142 0.16
143 0.21
144 0.25
145 0.25
146 0.25
147 0.25
148 0.25
149 0.24
150 0.23
151 0.19
152 0.13
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.19
157 0.19
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.14
162 0.17
163 0.17
164 0.15
165 0.24
166 0.28
167 0.33
168 0.35
169 0.35
170 0.32
171 0.37
172 0.34
173 0.25
174 0.27
175 0.2
176 0.18
177 0.18
178 0.19
179 0.14
180 0.15
181 0.15
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.13
196 0.18
197 0.2
198 0.22
199 0.25
200 0.29
201 0.35
202 0.34
203 0.31
204 0.26
205 0.23
206 0.23
207 0.2
208 0.16
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.12
244 0.15
245 0.18
246 0.2
247 0.24
248 0.24
249 0.23
250 0.23
251 0.19
252 0.17
253 0.15
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.09
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.13
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.18
278 0.2
279 0.23
280 0.24
281 0.22
282 0.22
283 0.22
284 0.22
285 0.17
286 0.15
287 0.14
288 0.17
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.19
293 0.18
294 0.17
295 0.16
296 0.12
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.15
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.21
315 0.21
316 0.2
317 0.24
318 0.22
319 0.21
320 0.23
321 0.24
322 0.19
323 0.18
324 0.19
325 0.16
326 0.23
327 0.25
328 0.24
329 0.27
330 0.29
331 0.33
332 0.33
333 0.31
334 0.24
335 0.22
336 0.26
337 0.24
338 0.21
339 0.16
340 0.19
341 0.18
342 0.24
343 0.25
344 0.2
345 0.27
346 0.3
347 0.35
348 0.39
349 0.46
350 0.49
351 0.53
352 0.55
353 0.49
354 0.46
355 0.43
356 0.36
357 0.3
358 0.22
359 0.19
360 0.17
361 0.15
362 0.15
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.09
389 0.14
390 0.19
391 0.24
392 0.29
393 0.29
394 0.33
395 0.4
396 0.43
397 0.44
398 0.44
399 0.39
400 0.36
401 0.38
402 0.36
403 0.32
404 0.29
405 0.24
406 0.24
407 0.23
408 0.23
409 0.23
410 0.23
411 0.22
412 0.21
413 0.22
414 0.17
415 0.17
416 0.16
417 0.12
418 0.11
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.12
424 0.18
425 0.21
426 0.24
427 0.28
428 0.35
429 0.36
430 0.42
431 0.47
432 0.48
433 0.53
434 0.6
435 0.64
436 0.62
437 0.61
438 0.58
439 0.59
440 0.54
441 0.5
442 0.5
443 0.51
444 0.53
445 0.6
446 0.62
447 0.63
448 0.7
449 0.74
450 0.72
451 0.71
452 0.73
453 0.74
454 0.78
455 0.78
456 0.78
457 0.77
458 0.8
459 0.81
460 0.83
461 0.84
462 0.83
463 0.81
464 0.81
465 0.83
466 0.8
467 0.77
468 0.76
469 0.75
470 0.76
471 0.76
472 0.7
473 0.63
474 0.56
475 0.51
476 0.46
477 0.45
478 0.4
479 0.39
480 0.45
481 0.49
482 0.51
483 0.58
484 0.63
485 0.64
486 0.69
487 0.75
488 0.75
489 0.78
490 0.84
491 0.79
492 0.76
493 0.72
494 0.69
495 0.67
496 0.58
497 0.5
498 0.42
499 0.4
500 0.34
501 0.28
502 0.23
503 0.18
504 0.19