Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A7EK78

Protein Details
Accession A7EK78    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-53RDEFADYNPRKRRRTGRNAKESAALHydrophilic
61-84EDEGAPGRRWKKKSLRGKGMSFVAHydrophilic
286-311KIEDSDEERRKRRRKPKTSGTDSGMSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-45RKRRRTGR
67-78GRRWKKKSLRGK
276-303EKRQAKLRGEKIEDSDEERRKRRRKPKT
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0071008  C:U2-type post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
KEGG ssl:SS1G_05724  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSMNAFPRNSSDESSGDENDFLHPSTDPRDEFADYNPRKRRRTGRNAKESAALGVFGSESEDEGAPGRRWKKKSLRGKGMSFVAGGEKAGEDDEEEEDEDDDDDDDEAVETGANDGKGDADMKDYEEESIAPRGLGFGAVGQGLGFQSPAPTRSKNTGLGSNASTPLGRGFVPSSANNPILLNDDDPQDSTPRIARPSAFSTPSSGRGGNKAGGGATPVNSMSFAARMMAKMGYKEGQGLGKEGQGRSGVIEVTLRPQGVGLGSVAEKSKQEKEEEKRQAKLRGEKIEDSDEERRKRRRKPKTSGTDSGMSGVSTPRKAAKPKYRTVEEVQRAAPGLEIPEAFAPILDMTGPGQKLLTSTSGLLTPTAGPPKTESVEDIENRKLARRAQNDLSAFVEEWKNLEERKAYTEMELIQRQQELDEEQRQYEQMKIFAGSIQGIAKAVHDGQWDPVIEALKTVDGLDISGANEELSNIAVAAVHPFLRQASEGWQPLEDPKLNGMVPNLYKIRHILGAVTNDKVIISQDSFMNALHKNRVKSTTPYESMIYKIIFPKIVSSINKNWDVYNPAPVLAFLDAWQGLLPKFVRSQILDQAIVGKLNDAVSSWNPKKRRNHELPHLWLFPWLQYLPAYHADPKSSTGLVSDVKRKFRHLIDSWDFHRGVIPGLKQWREVLHPSPNNDTWTPLIMNHVLPSMAKFLKNEKNFLVDPNDQAPYMSSLQGIFAWKDVLKPRVVGQVLIGTVFPMWHNVLHQWLTVVGHNAEIGEWFEWWRDSVFPAEIRDLGEIQQEFEKGHEMIKRALALGEKAKTHLPAPETSSTSSQATQIPLSEEKPKEKQISEEVSFRETIEDWCIENDLQFLPEKKVLHSAGPLYRVTAAGNGKNGVLVYFRGEKLVALQSRGGGREKVEVGIEWEREEGRDILLGMAWMGVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.29
4 0.27
5 0.23
6 0.22
7 0.23
8 0.19
9 0.16
10 0.14
11 0.15
12 0.21
13 0.26
14 0.24
15 0.25
16 0.28
17 0.3
18 0.3
19 0.34
20 0.4
21 0.39
22 0.48
23 0.56
24 0.61
25 0.63
26 0.71
27 0.75
28 0.76
29 0.82
30 0.83
31 0.85
32 0.87
33 0.88
34 0.81
35 0.76
36 0.65
37 0.57
38 0.47
39 0.36
40 0.24
41 0.19
42 0.16
43 0.11
44 0.11
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.12
51 0.16
52 0.16
53 0.24
54 0.32
55 0.39
56 0.43
57 0.53
58 0.62
59 0.68
60 0.77
61 0.8
62 0.83
63 0.83
64 0.85
65 0.81
66 0.74
67 0.66
68 0.54
69 0.44
70 0.36
71 0.27
72 0.22
73 0.15
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.06
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.13
110 0.15
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.14
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.08
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.07
135 0.09
136 0.12
137 0.16
138 0.19
139 0.23
140 0.29
141 0.34
142 0.37
143 0.39
144 0.43
145 0.41
146 0.42
147 0.41
148 0.38
149 0.35
150 0.29
151 0.25
152 0.19
153 0.17
154 0.15
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.17
160 0.17
161 0.2
162 0.23
163 0.24
164 0.23
165 0.21
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.18
170 0.15
171 0.17
172 0.16
173 0.17
174 0.17
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.17
179 0.19
180 0.21
181 0.22
182 0.23
183 0.26
184 0.32
185 0.36
186 0.35
187 0.32
188 0.35
189 0.35
190 0.38
191 0.35
192 0.31
193 0.27
194 0.28
195 0.3
196 0.27
197 0.25
198 0.21
199 0.18
200 0.16
201 0.17
202 0.14
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.17
225 0.16
226 0.18
227 0.16
228 0.18
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.13
237 0.09
238 0.11
239 0.09
240 0.11
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.13
256 0.19
257 0.2
258 0.24
259 0.32
260 0.39
261 0.49
262 0.59
263 0.6
264 0.62
265 0.65
266 0.68
267 0.66
268 0.68
269 0.65
270 0.63
271 0.62
272 0.58
273 0.55
274 0.52
275 0.46
276 0.42
277 0.43
278 0.42
279 0.44
280 0.49
281 0.56
282 0.6
283 0.7
284 0.75
285 0.77
286 0.81
287 0.85
288 0.88
289 0.9
290 0.9
291 0.86
292 0.8
293 0.72
294 0.62
295 0.53
296 0.42
297 0.3
298 0.22
299 0.18
300 0.16
301 0.12
302 0.13
303 0.16
304 0.21
305 0.26
306 0.35
307 0.43
308 0.49
309 0.56
310 0.63
311 0.62
312 0.62
313 0.63
314 0.64
315 0.57
316 0.53
317 0.46
318 0.39
319 0.35
320 0.3
321 0.24
322 0.14
323 0.11
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.09
344 0.1
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.1
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.14
358 0.17
359 0.18
360 0.17
361 0.16
362 0.15
363 0.2
364 0.21
365 0.23
366 0.21
367 0.22
368 0.22
369 0.23
370 0.23
371 0.23
372 0.3
373 0.31
374 0.36
375 0.38
376 0.45
377 0.43
378 0.41
379 0.37
380 0.29
381 0.24
382 0.2
383 0.17
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.16
393 0.18
394 0.17
395 0.17
396 0.18
397 0.19
398 0.21
399 0.21
400 0.18
401 0.16
402 0.16
403 0.16
404 0.14
405 0.13
406 0.11
407 0.13
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.18
414 0.19
415 0.16
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.06
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.09
474 0.13
475 0.15
476 0.15
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.18
481 0.15
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.12
489 0.12
490 0.15
491 0.15
492 0.14
493 0.14
494 0.15
495 0.15
496 0.13
497 0.13
498 0.11
499 0.13
500 0.18
501 0.18
502 0.18
503 0.16
504 0.15
505 0.15
506 0.13
507 0.11
508 0.07
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.11
516 0.11
517 0.13
518 0.18
519 0.22
520 0.22
521 0.25
522 0.29
523 0.29
524 0.32
525 0.37
526 0.38
527 0.37
528 0.37
529 0.36
530 0.32
531 0.3
532 0.28
533 0.22
534 0.16
535 0.16
536 0.15
537 0.15
538 0.14
539 0.14
540 0.14
541 0.19
542 0.19
543 0.22
544 0.26
545 0.31
546 0.34
547 0.33
548 0.31
549 0.27
550 0.31
551 0.27
552 0.27
553 0.22
554 0.19
555 0.19
556 0.18
557 0.17
558 0.12
559 0.12
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.11
571 0.12
572 0.15
573 0.16
574 0.19
575 0.22
576 0.24
577 0.23
578 0.21
579 0.22
580 0.2
581 0.19
582 0.16
583 0.1
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.06
588 0.07
589 0.09
590 0.18
591 0.22
592 0.28
593 0.32
594 0.4
595 0.5
596 0.56
597 0.65
598 0.66
599 0.7
600 0.75
601 0.79
602 0.79
603 0.76
604 0.69
605 0.59
606 0.51
607 0.42
608 0.32
609 0.26
610 0.18
611 0.13
612 0.12
613 0.12
614 0.14
615 0.17
616 0.18
617 0.18
618 0.19
619 0.2
620 0.2
621 0.22
622 0.21
623 0.18
624 0.16
625 0.13
626 0.15
627 0.17
628 0.19
629 0.25
630 0.28
631 0.35
632 0.36
633 0.39
634 0.42
635 0.42
636 0.47
637 0.43
638 0.48
639 0.47
640 0.51
641 0.5
642 0.5
643 0.47
644 0.37
645 0.36
646 0.26
647 0.22
648 0.21
649 0.2
650 0.19
651 0.26
652 0.27
653 0.26
654 0.27
655 0.27
656 0.27
657 0.3
658 0.3
659 0.34
660 0.37
661 0.39
662 0.43
663 0.43
664 0.43
665 0.39
666 0.36
667 0.27
668 0.26
669 0.24
670 0.18
671 0.19
672 0.17
673 0.17
674 0.15
675 0.14
676 0.12
677 0.11
678 0.12
679 0.14
680 0.14
681 0.15
682 0.16
683 0.23
684 0.32
685 0.35
686 0.37
687 0.33
688 0.37
689 0.36
690 0.38
691 0.37
692 0.3
693 0.31
694 0.31
695 0.3
696 0.25
697 0.24
698 0.22
699 0.19
700 0.18
701 0.16
702 0.13
703 0.12
704 0.13
705 0.14
706 0.15
707 0.11
708 0.1
709 0.12
710 0.11
711 0.16
712 0.2
713 0.22
714 0.22
715 0.23
716 0.25
717 0.31
718 0.31
719 0.27
720 0.23
721 0.23
722 0.22
723 0.21
724 0.18
725 0.1
726 0.1
727 0.1
728 0.09
729 0.08
730 0.08
731 0.09
732 0.1
733 0.11
734 0.16
735 0.16
736 0.16
737 0.14
738 0.14
739 0.15
740 0.15
741 0.17
742 0.13
743 0.12
744 0.12
745 0.12
746 0.1
747 0.1
748 0.1
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.09
753 0.09
754 0.1
755 0.1
756 0.1
757 0.11
758 0.13
759 0.16
760 0.17
761 0.19
762 0.2
763 0.2
764 0.2
765 0.2
766 0.18
767 0.16
768 0.19
769 0.17
770 0.17
771 0.18
772 0.17
773 0.16
774 0.16
775 0.18
776 0.13
777 0.17
778 0.19
779 0.2
780 0.22
781 0.25
782 0.25
783 0.22
784 0.23
785 0.21
786 0.22
787 0.25
788 0.26
789 0.24
790 0.25
791 0.26
792 0.26
793 0.26
794 0.27
795 0.24
796 0.24
797 0.29
798 0.33
799 0.34
800 0.35
801 0.36
802 0.34
803 0.33
804 0.3
805 0.26
806 0.24
807 0.23
808 0.22
809 0.21
810 0.22
811 0.23
812 0.25
813 0.31
814 0.32
815 0.36
816 0.42
817 0.48
818 0.5
819 0.49
820 0.52
821 0.52
822 0.56
823 0.53
824 0.52
825 0.47
826 0.43
827 0.42
828 0.37
829 0.3
830 0.23
831 0.21
832 0.19
833 0.19
834 0.17
835 0.17
836 0.2
837 0.17
838 0.17
839 0.17
840 0.13
841 0.13
842 0.16
843 0.17
844 0.2
845 0.24
846 0.25
847 0.25
848 0.31
849 0.32
850 0.31
851 0.33
852 0.35
853 0.36
854 0.38
855 0.37
856 0.31
857 0.3
858 0.28
859 0.24
860 0.23
861 0.24
862 0.24
863 0.27
864 0.26
865 0.25
866 0.25
867 0.24
868 0.19
869 0.15
870 0.13
871 0.15
872 0.19
873 0.19
874 0.2
875 0.2
876 0.19
877 0.22
878 0.3
879 0.28
880 0.25
881 0.26
882 0.28
883 0.31
884 0.34
885 0.33
886 0.26
887 0.26
888 0.3
889 0.3
890 0.28
891 0.26
892 0.24
893 0.26
894 0.3
895 0.29
896 0.24
897 0.24
898 0.23
899 0.22
900 0.25
901 0.2
902 0.15
903 0.16
904 0.15
905 0.14
906 0.14
907 0.13
908 0.1